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2011 年度 実績報告書

二本鎖RNA結合タンパク質TRBPの遺伝子サイレンシングにおける機能

研究課題

研究課題/領域番号 11J08395
研究機関東京大学

研究代表者

高橋 朋子  東京大学, 大学院・理学系研究科, 特別研究員(DC1) (00738792)

キーワードRNA interference
研究概要

本研究の目的は、二本鎖RNA結合タンパク質であるTAR-RNA binding protein(TRBP)の、小分子RNAによる遺伝子サイレンシングにおける機能の解析である。
TRBPは3つの二本鎖RNA結合ドメインをもつタンパク質(dsRBD-1,dsRBD-2,dsRBD-3)であり、RNAi経路において、small interfering RNA(siRNA)をDicerからAgo2へとロードする役割があるとされている。また一方PACT(a protein activator of PKR)も3つの二本鎖RNA結合ドメインを持ち、RNAi経路において、TRBPと同様の機能をもつとされている。
TRBPとPACTはRNAi経路において重要な因子であるにも関わらず、siRNAとの結合様式や詳細な機能について未解明な部分が多い。
本研究ではこれまで、ゲルシフトアッセイやゲルろ過クロマトグラフィーによって、TRBPが低濃度のときに、TRBP1分子がdsRBD-1とdsRBD-2を介して、siRNA1分子と結合すること、高濃度のときにTRBP2分子とsiRNA1分子が結合することを明らかにした。またPACTは低濃度のときにはsiRNAと結合せず、高濃度のときにPACT2分子とsiRNA2分子が結合することも明らかにした。
以上の結果から、まずTRBPはPACTと比べてより積極的にRNAi経路に関与していると考えられる。また、TRBPとPACTは非常によく似たドメイン構造であるのにも関わらず、siRNAとの結合様式は異なっていることがわかった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

二本鎖RNA結合タンパク質であるTRBPのRNAiにおける機能を調べるために、まずsiRNAとTRBPの結合様式について検討を行ったが、その際にRNAi経路においてTRBPと同様の機能をもつと示唆されているPACTとsiRNAとの結合様式についても同時に検討を行い、TRBPとPACTではsiRNAに対するアフィニティーや結合様式が異なるという全く新しい知見を得ることができた。

今後の研究の推進方策

今後も引き続き、今回得られた知見をもとに、二本鎖RNA結合タンパク質であるTRBPとPACTのRNAiにおける機能を調べる予定である。またTRBPとPACTは細胞がストレス条件下にあるときやウイルス感染時にアポトーシスの経路に関与していることが知られている。こちらについても検討を続けていきたい。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2011 その他

すべて 学会発表 (2件) 図書 (1件)

  • [学会発表] Comparative analysis of siRNA binding patterns of dsRNA binding proteins, TRBP and PACT2011

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Takahashi, Kenji Nishi, Shuhei Zenno, Kumiko Ui-Tei
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      2011-12-16
  • [学会発表] Identification of small interfering RNA binding domains of TAR RNA binding protein (TRBP) and their molecular implication in RNA interference2011

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Takahashi, Kenji Nishi, Shuhei Zenno, Kumiko Ui-Tei
    • 学会等名
      Sixteenth Annual Meeting of the RNA society
    • 発表場所
      京都国際会議場(京都府)
    • 年月日
      2011-06-15
  • [図書] 「第3章RNAi実験の準備と実践2.修飾基のついたsiRNAとRNAi効果とその選択」実験医学別冊目的別で選べる遺伝子導入実験プロトコール

    • 著者名/発表者名
      西賢二、高橋朋子、長沢達矢、程久美子
    • 出版者
      羊土社(印刷中)

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公開日: 2013-06-26   更新日: 2015-05-21  

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