2000 年度実績報告書

脊椎動物ゲノムにおけるパラロガス領域の起源

研究課題

研究課題/領域番号	12024209
研究機関	総合研究大学院大学
研究代表者	笠原正典総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 教授 (30241318)
キーワード	パラロガス領域 / MHC / ゲノム重複 / 無顎類
研究概要	本研究では,ゲノム重複によって形成されたと想定されるパラロガス領域の典型例と考えられるMHC(Major Histocompatibility Complex)パラロガス・グループに焦点を当てることにより,パラロガス領域を形成した重複の性質,回数,時期を解明することを目的とした. 1.MHCパラロガス・グループを構成する新規ヒト遺伝子群の同定 1)HLA領域に存在する全遺伝子の約3〜4分の1に相当すると考えられる37個の遺伝子がHLAとパラロガスな領域(9q33-q34,19p13.1-13.3,1q21-q25/p11-p32)のいずれかにコピーをもっていること(ただし,直列重複で生じた遺伝子を一つと数える),2)HLA領域内にはコピーをもたないが,9q33-q34,19p13.1-13.3,1q21-q25/p11-p32領域間でパラロガスなコピーを共有する遺伝子群が少なくとも50個存在することを示した. 2.メクラウナギのゲノムに存在するMHCパラロガス領域数の同定 MHCパラロガス・グループのメンバーである5個の遺伝子族をメクラウナギからクローニングした.これらの遺伝子族の大部分において2-3コピーのパラロガスコピーを同定することが可能であった.したがって,無顎類が誕生する前の段階ですでに一回のゲノム重複が起こった可能性が高いことが示唆された.最終的には,ゲノム・レベルでのクローニングを行うことによって,無顎類のゲノムに何個のMHCパラロガス領域が存在するかを確定することが可能となる.そのため,現在,メクラウナギ由来のBACライブラリーの作製を行っている.

研究成果

(17件)

すべてその他

すべて文献書誌 (17件)

[文献書誌] Kasahara,M.: "Genome paralogy : A new perspective on the organization and origin of the major histocompatibility complex."Curr.Top.Microbiol.Immunol.. 248. 53-66 (2000)
[文献書誌] Kawahara,H.: "Developmentally regulated, alternative splicing of the Rpn10 gee generates multiple forms of 26S proteasomes."EMBO J.. 19. 4144-4153 (2000)
[文献書誌] Kobayashi,A.: "A half-type ABC transporter TAPL is highly conserved between rodent and man, and the human gene is not responsive to interferon-γ in contrast to TAP1 and TAP2."J.Biochem. 128. 711-718 (2000)
[文献書誌] Yawata,M.: "Nucleotide sequence analysis of the 〜35-kb region containing interferon-γ-inducible mouse proteasome activator genes."Immunogenetics. 53(印刷中). (2001)
[文献書誌] Murata,S.: "Normal immunoproteasome assembly in mice lacking both PA28α and PA28β."EMBO J.. 20(印刷中). (2001)
[文献書誌] Flajnik,M.F.: "MHC genomics : A current overview."Immunity. 14(印刷中). (2001)
[文献書誌] Cohen,D.J.: "Mammalian sperm-egg fusion : Evidence that human epididymal protein ARP plays a role in gamate fusion through complementary sites on the surface of the human egg."Biol.Reprod. 65(印刷中). (2001)
[文献書誌] Kasahara,M.(ed.): "Major Histocompatibility Complex : Evolution, Structure, and Function"Spinger-Verlag,Tokyo-Berlin-Heidelberg-New York. 561 (2000)
[文献書誌] Kasahara,M.: "Polyploid origin of the human genome.In : D.N.Cooper(ed.) : Encyclopedia of the Human Genome"Nature Publishing Group(印刷中). (2001)
[文献書誌] 大田竜也: "自己・非自己識別システムの進化.藤原大美編:新移植免疫学"中外医学社,東京. 21 (2000)
[文献書誌] 笠原正典: "特異的免疫応答.-抗原認識と免疫の発現-.菊地浩吉,上出利光編:医科免疫学改訂第5版"南江堂,東京. 26 (2001)
[文献書誌] 笠原正典(分担執筆): "Fc receptor neonatal.大沢利昭,奥田研爾,小山次郎編:免疫学辞典第2版"東京化学同人,東京(印刷中). (2001)
[文献書誌] 笠原正典:(分担執筆): "MHCクラスI分子.南山堂医学大辞典改訂19版"南山堂,東京(印刷中). (2001)
[文献書誌] 笠原正典:(分担執筆): "免疫,ほか12項目.北川高嗣,須藤修,西垣通,濱田純一,吉見俊哉,米本昌平編:情報学事典"弘文堂,東京(印刷中). (2001)
[文献書誌] 笠原正典: "原索動物から脊椎動物への進化とゲノム.小原雄治,榊佳之編:ポストシークエンスのゲノム科学第4巻.グノムから個体へ.生命システムの理解にむけて."中山書店,東京(印刷中). (2001)
[文献書誌] 笠原正典: "脊椎動物ゲノムにおけるパラロガス領域の起源."蛋白質核酸酵素臨時増刊号「ゲノムサイエンスの新たなる挑戦」,東京(印刷中). (2001)
[文献書誌] 笠原正典:(分担執筆): "主要組織適合遺伝子複合体,ほか15項目.伊藤正男,井村裕夫,高久史麿編:医学大辞典"医学書院,東京(印刷中). (2001)

2000 年度 実績報告書

脊椎動物ゲノムにおけるパラロガス領域の起源

研究代表者

笠原 正典 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 教授 (30241318)

研究成果

[文献書誌] Kasahara,M.: "Genome paralogy : A new perspective on the organization and origin of the major histocompatibility complex."Curr.Top.Microbiol.Immunol.. 248. 53-66 (2000)

[文献書誌] Kawahara,H.: "Developmentally regulated, alternative splicing of the Rpn10 gee generates multiple forms of 26S proteasomes."EMBO J.. 19. 4144-4153 (2000)

[文献書誌] Kobayashi,A.: "A half-type ABC transporter TAPL is highly conserved between rodent and man, and the human gene is not responsive to interferon-γ in contrast to TAP1 and TAP2."J.Biochem. 128. 711-718 (2000)

[文献書誌] Yawata,M.: "Nucleotide sequence analysis of the 〜35-kb region containing interferon-γ-inducible mouse proteasome activator genes."Immunogenetics. 53(印刷中). (2001)

[文献書誌] Murata,S.: "Normal immunoproteasome assembly in mice lacking both PA28α and PA28β."EMBO J.. 20(印刷中). (2001)

[文献書誌] Flajnik,M.F.: "MHC genomics : A current overview."Immunity. 14(印刷中). (2001)

[文献書誌] Cohen,D.J.: "Mammalian sperm-egg fusion : Evidence that human epididymal protein ARP plays a role in gamate fusion through complementary sites on the surface of the human egg."Biol.Reprod. 65(印刷中). (2001)

[文献書誌] Kasahara,M.(ed.): "Major Histocompatibility Complex : Evolution, Structure, and Function"Spinger-Verlag,Tokyo-Berlin-Heidelberg-New York. 561 (2000)

[文献書誌] Kasahara,M.: "Polyploid origin of the human genome.In : D.N.Cooper(ed.) : Encyclopedia of the Human Genome"Nature Publishing Group(印刷中). (2001)

[文献書誌] 大田竜也: "自己・非自己識別システムの進化.藤原大美 編:新 移植免疫学"中外医学社,東京. 21 (2000)

[文献書誌] 笠原正典: "特異的免疫応答.-抗原認識と免疫の発現-.菊地浩吉,上出利光 編:医科免疫学 改訂第5版"南江堂,東京. 26 (2001)

[文献書誌] 笠原正典(分担執筆): "Fc receptor neonatal.大沢利昭,奥田研爾,小山次郎 編:免疫学辞典 第2版"東京化学同人,東京(印刷中). (2001)

[文献書誌] 笠原正典:(分担執筆): "MHCクラスI分子.南山堂医学大辞典 改訂19版"南山堂,東京(印刷中). (2001)

[文献書誌] 笠原正典:(分担執筆): "免疫,ほか12項目.北川高嗣,須藤修,西垣通,濱田純一,吉見俊哉,米本昌平 編:情報学事典"弘文堂,東京(印刷中). (2001)

[文献書誌] 笠原正典: "原索動物から脊椎動物への進化とゲノム.小原雄治,榊佳之 編:ポストシークエンスのゲノム科学第4巻.グノムから個体へ.生命システムの理解にむけて."中山書店,東京(印刷中). (2001)

[文献書誌] 笠原正典: "脊椎動物ゲノムにおけるパラロガス領域の起源."蛋白質 核酸 酵素 臨時増刊号「ゲノムサイエンスの新たなる挑戦」,東京(印刷中). (2001)

[文献書誌] 笠原正典:(分担執筆): "主要組織適合遺伝子複合体,ほか15項目.伊藤正男,井村裕夫,高久史麿 編:医学大辞典"医学書院,東京(印刷中). (2001)

2000 年度実績報告書

笠原正典総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 教授 (30241318)

[文献書誌] 大田竜也: "自己・非自己識別システムの進化.藤原大美編:新移植免疫学"中外医学社,東京. 21 (2000)

[文献書誌] 笠原正典: "特異的免疫応答.-抗原認識と免疫の発現-.菊地浩吉,上出利光編:医科免疫学改訂第5版"南江堂,東京. 26 (2001)

[文献書誌] 笠原正典(分担執筆): "Fc receptor neonatal.大沢利昭,奥田研爾,小山次郎編:免疫学辞典第2版"東京化学同人,東京(印刷中). (2001)

[文献書誌] 笠原正典:(分担執筆): "MHCクラスI分子.南山堂医学大辞典改訂19版"南山堂,東京(印刷中). (2001)

[文献書誌] 笠原正典:(分担執筆): "免疫,ほか12項目.北川高嗣,須藤修,西垣通,濱田純一,吉見俊哉,米本昌平編:情報学事典"弘文堂,東京(印刷中). (2001)

[文献書誌] 笠原正典: "原索動物から脊椎動物への進化とゲノム.小原雄治,榊佳之編:ポストシークエンスのゲノム科学第4巻.グノムから個体へ.生命システムの理解にむけて."中山書店,東京(印刷中). (2001)

[文献書誌] 笠原正典: "脊椎動物ゲノムにおけるパラロガス領域の起源."蛋白質核酸酵素臨時増刊号「ゲノムサイエンスの新たなる挑戦」,東京(印刷中). (2001)

[文献書誌] 笠原正典:(分担執筆): "主要組織適合遺伝子複合体,ほか15項目.伊藤正男,井村裕夫,高久史麿編:医学大辞典"医学書院,東京(印刷中). (2001)