RNAエディティングによるDNAゲノム情報の変換-葉緑体ゲノムでの網羅的解析

2000 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 12201002
• 研究機関: 名古屋市立大学
• 研究代表者: 杉浦 昌弘 名古屋市立大学, 自然科学研究教育センター, 教授 (80027044)
• 研究分担者: 小保方 潤一 名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助教授 (50185667) ; 櫻井 宣彦 名古屋市立大学, 自然科学研究教育センター, 助手 (00255233)
• キーワード: RNAエディティング / タバコ / 葉緑体 / DNAチップ / in vitro系 / mRNA / シス配列 / トランス因子

研究概要

葉緑体はその発生プログラムにより原色素体(種子)からエチオプラスト(芽生え)、葉緑体(葉)、クロモプラスト(果実)などへと形態的・機能的に大きく変化する。高等植物の葉緑体ゲノムからの転写産物は、RNAエディティング(C→U)によりDNAの一次情報が一部変換するため、ゲノム情報の正確な解読にはRNAエディティングの網羅的知見が必須である。そこで最も研究の進んでいる、タバコ葉緑体を用いて以下の解析を進めている。
1)RNAエディティング部位の網羅的同定
組織的なRNAエディティング部位の探索のため、タンパク質コード領域以外の転写領域を調べる必要がある。そのためタバコ葉緑体のDNAチップ(全ゲノムをカバーする220DNA断片、平均700bp/断片)を作製して予備的実験を開始した。
2)RNAエディティングのシス配列とトランス因子の同定
タバコ単離葉緑体よりin vitro RNAエディティング系を開発した。この系を使って、タバコ葉緑体psbL mRNAとndhB mRNAのシス配列を同定し、psbL mRNAのトランス因子の同定も行った。

研究成果

• [文献書誌] Yukawa,Y.: "The TATA motif, the CAA motif and the Poly(T) transcription termination motif are all important for transcription re-initiation on plant tRNA genes."Plant Journal. 22. 439-447 (2000)
• [文献書誌] Akama,K.: "Splicing of Arabidopsis tRNA^<Met> precursors in tobacco cell and wheat germ extracts."Plant Molecular Biology. 44. 155-165 (2000)
• [文献書誌] Sugita,C.: "A novel nucleic acid-binding protein in the cyanobacterium Synechococcus sp. PCC6301."Mol.Gen.Genet.. 263. 655-663 (2000)
• [文献書誌] Nakamura T.: "Chloroplast ribonucleoproteins function as a stabilizing factor of ribosomefree mRNAs in the stroma."J.Biol.Chem.. 276. 147-152 (2001)
• [文献書誌] Sugiura,M.: "Nucleic Acids. In "Biochemistry & Molecular Biology of Plants""American Society of Plant Physiologists. 50 (2000)
• [文献書誌] Sugiura,M.: "Phytogene Sequence : From cyanobacteia to plastids. In "From Symbiosis to Eukaryotism-Endocytobiology VII""Univ Geneva Press. 16 (2000)