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2004 年度 実績報告書

脊索動物モデルのホヤ発生の遺伝子システムとその進化の解明

研究課題

研究課題/領域番号 12202001
研究機関京都大学

研究代表者

佐藤 矩行  京都大学, 大学院・理学研究科, 教授 (30025481)

キーワードホヤ / 脊索動物 / 発生 / 進化 / cDNAプロジェクト / ゲノムプロジェクト / EST解析 / 染色体マッピング
研究概要

脊索動物門はホヤなどの尾索類、ナメクジウオの頭索類、それに脊椎動物からなる。これらの動物は脊索・背側神経管・鰓裂など多くの共有形質を有し、共通の祖先から進化してきたものと考えられている。ホヤのオタマジャクシ幼生は体幹部背側の中枢神経系(構成細胞数約350)、尾部の脊索(構成細胞数40)や筋肉(構成細胞数約40)など、脊椎動物の体制の原型がそこに存在する。本研究は、カタユウレイボヤ(Ciona intestinalis)のcDNAプロジェクトおよびゲノムプロジェクトの展開を計り、発生遺伝子システムの解明と進化と関連したゲノム科学の進展を計ることを目的とした。まずcDNAプロジェクトとしてこの動物の発生および成体で発現する遺伝子の約60万を越えるEST解析を行った。また約18,000のユニークcDNAを得て、それらを再配列した"Ciona Gene Collection"を作り、世界中の研究者に配布した。次にゲノムプロジェクトとして、アメリカJGI、国立遺伝研(日本)と共同で、カタユウレイボヤのドラフト・ゲノムを決定した。その結果、この動物のゲノムサイズは153-159Mbp、タンパク質をコードする遺伝子は15,852と見積もられた。さらにこれらのゲノムおよびcDNA情報をもとに、この動物の発生関連遺伝子(転写因子やシグナル分子を含む)をできるだけ正確にアノテーションし、それらを一括公表した。
本年度はこれらのゲノム情報を、n=14本の染色体にマップすることを中心に研究を進めた。核型を決定し、またFISH法などを駆使して、これまでにカタユウレイボヤ・ゲノム情報の約60%を14本の染色体にマップすることに成功した。これらの結果は、これからこの動物の発生遺伝子を研究するための大きな基盤となると考えられる。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2004

すべて 雑誌論文 (6件)

  • [雑誌論文] A zinc finger transcription factor, ZicL, is a direct activator of Brachyury in the notochord specification of Ciona intestinalis2004

    • 著者名/発表者名
      Yagi, K.
    • 雑誌名

      Development 131

      ページ: 1279-1288

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Piecing together evolution of the vertebrate endocrine system2004

    • 著者名/発表者名
      Campbell, R.K.
    • 雑誌名

      Trends in Genetics 20

      ページ: 359-366

  • [雑誌論文] The ascidian Mesp gene specifies heart precursor cells2004

    • 著者名/発表者名
      Satou, Y.
    • 雑誌名

      Development 131

      ページ: 2533-2541

  • [雑誌論文] Gene expression profiles of transcription factors and signaling molecules in the ascidian embryo : towards a comprehensive understanding of gene networks2004

    • 著者名/発表者名
      Imai, K.S.
    • 雑誌名

      Development 131

      ページ: 4047-4058

  • [雑誌論文] Three distinct lineages of mesenchymal cells in Ciona intestinalis embryos demonstrated by specific gene expression2004

    • 著者名/発表者名
      Tokuoka, M.
    • 雑誌名

      Developmental Biology 274

      ページ: 211-224

  • [雑誌論文] Identification of downstream genes of the ascidian muscle determinan gene Ci-machol2004

    • 著者名/発表者名
      Yagi, K.
    • 雑誌名

      Developmental Biology 274

      ページ: 478-489

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公開日: 2006-07-12   更新日: 2016-04-21  

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