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2004 年度 実績報告書

光合成微生物の環境応答遺伝子システムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 12206002
研究機関埼玉大学

研究代表者

大森 正之  埼玉大学, 理学部, 教授 (80013580)

研究分担者 池内 正彦  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 教授 (20159601)
田畑 哲之  かずさDNA研究所, 部長(研究職)
キーワードラン藻 / Synechocystis / Anabaena / 信号伝達 / マイクロアレイ / 塩ストレス / 乾燥ストレス / ゲノム解析
研究概要

1)ラン藻Synechocystisの転写調節ネットワーク、信号伝達ネットワークの解析:
マイクロアレイを用いた、転写因子破壊株の網羅的な解析により、単細胞性Synechocystisの遺伝子発現機構の全体的な把握を試みた。特に温度変化や塩ストレスに対応した遺伝子発現の変化についてTwo-hybrid法やリン酸基転移反応の確認により、信号伝達ネットワークを明らかにした。
2)ラン藻Anabaenaの遺伝子機能解析:
Anabaenaは細胞が数珠上に繋がった糸状性ラン藻であり、窒素固定能を持ち、さらに乾燥にも強い性質を備えている。本研究では、Anabaenaに固有の遺伝子を欠失した変異株を作成し、独自に作成したマイクロアレイを用いて、関連する遺伝子の網羅的解析と表現型の検索を行った。特に、窒素固定条件や乾燥条件、光刺激などで誘導される遺伝子について解析した。得られた実験結果から、ラン藻における機能分化と遺伝子構造の変化との関連を検証した。
3)ラン藻における比較ゲノム解析、統合データベースの構築:
SynechocystisやAnabaenaのゲノム情報から予測される重要な遺伝子を大腸菌もしくはラン藻を用いて発現させ、そのタンパク質の生化学的な性質を明らかにするとともに、立体構造を予測した。また、他のラン藻や植物のゲノムとの比較を行い、生物に普遍的に存在する遺伝子、ラン藻に共通する遺伝子、種固有の遺伝子について統合的なデータベースを構築した。これらをもとにラン藻における遺伝子の多様化、あるいは遺伝子の伝播に関する検討を行い、遺伝子進化の本質について検討した。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2004

すべて 雑誌論文 (6件)

  • [雑誌論文] In planta functions of the Arabidopsis cytokinin receptor family.2004

    • 著者名/発表者名
      Higuchi M, Pischke MS, Mahonen AP, Miyawaki K, Hashimoto Y, Seki M, Kobayashi M, Shinozaki K, Kato T, Tabata S, Helariutta Y, Sussman MR, Kakimoto T.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA. 101・23

      ページ: 8821-8826

  • [雑誌論文] Two cAMP receptor proteins with different biochemical properties in the filamentous cyanobacterium Anabaena sp.PCC 7120.2004

    • 著者名/発表者名
      Suzuki T, Yoshimura H, Hisabori T, Ohmori M
    • 雑誌名

      FEBS Lett. 571・1-3

      ページ: 154-160

  • [雑誌論文] Photoresponsive cAMP signal transduction in cyanobacteria.2004

    • 著者名/発表者名
      Ohmori M, Okamoto S
    • 雑誌名

      Photochem Photobiol Sci. 3・6

      ページ: 503-511

  • [雑誌論文] Molecular evolution of PAS domain-containing proteins of filamentous cyanobacteria through domain shuffling and domain duplication.2004

    • 著者名/発表者名
      Narikawa R, Okamoto S, Ikeuchi M, Ohmori M
    • 雑誌名

      DNA Res. 11・2

      ページ: 69-81

  • [雑誌論文] A phytochrome-like protein AphC triggers the cAMP signaling induced by Far-red light in the cyanobacterium Anabaena sp.strain PCC 7120.2004

    • 著者名/発表者名
      Okamoto S, Kasahara M, Kamiya A, Nakahira Y, Ohmori M.
    • 雑誌名

      Photochem Photobiol. 80・3

      ページ: 429-433

  • [雑誌論文] Cynaobacterial phytochrome-like PixJ1 holoprotein shows novel reversible photoconversion between blue- and green-absorbing forms.2004

    • 著者名/発表者名
      Yoshihara S, Katayama M, Geng X, Ikeuchi M.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol. 45・12

      ページ: 1729-1737

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公開日: 2006-07-12   更新日: 2016-04-21  

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