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2004 年度 実績報告書

枯草菌転写制御ネットワークの全体像の解明

研究課題

研究課題/領域番号 12206010
研究機関福山大学

研究代表者

藤田 泰太郎  福山大学, 生命工学部, 教授 (40115506)

研究分担者 三輪 泰彦  福山大学, 生命工学部, 助教授 (00219833)
広岡 和丈  福山大学, 生命工学部, 講師 (20389068)
関口 順一  信州大学, 繊維学部, 教授 (80111053)
田中 暉夫  東海大学, 海洋学部, 教授 (10236606)
定家 義人  埼玉大学, 理学部, 教授 (40000252)
キーワード枯草菌 / 転写制御 / ネットワーク / DNAマイクロアレイ / シグマ因子 / 2成分制御系 / HTH蛋白質 / レギュロン
研究概要

DNA結合転写制御因子レギュロンのDNAマイクロアレイ解析結果に基づく、個々のレギュロンの機能解析を体系的に進めた。シグマ因子の支配するレギュロンの機能解析はほぼ終了しているので、機能未知の2成分制御系レギュロン個々の機能解析を進めた。本年度分子遺伝学的にレギュロン機能解析が進んだのは、GlnK-GlnL(YcbA-YcbB)、YclK-YclJ、YdfH-YdfI、YhcY-YhcZおよびYvrG-YvrHである。GlnK-GlnLはグルタミンをセンスし、その取り込みと代謝に関与するglsA-glnTオペロンを誘導する。YdfH-YdfIは薬剤耐性に関連し、YrvG-YrvHは細胞表層の維持や安定化に関与すると思われるが、YclK-YclJとYhcY-YhcZの機能は類推の域をでない。これらレギュロンの機能解析の成果は、学術論文として印刷中、投稿中あるいは投稿準備中である。HTH転写制御因子の支配するレギュロンの網羅的機能解析では、薬剤耐性遺伝子のHTH転写制御因子を多く含む、MarR、TetRとMerRファミリーの制御因子の支配するレギュロンの解析を優先的に進めた。既にMarRの14因子、TetRの15因子およびMerRの2因子の標的遺伝子を同定し、これら31因子のうち20因子の結合配列の同定に成功している。また、LmrAとYxaFの誘導物質は、ケルセチン等のフラボノールであり、YsiAレギュロンは脂肪酸の酸化に関与する遺伝子群から成り立っていた。
また、枯草菌の基幹代謝制御因子の多重制御をうけるilv-leuオペロンの発現制御の解析により、炭素代謝、窒素代謝、緊縮制御が密接に連動している事を明らかにした(論文印刷中)。この連動の本体の解明を進め、代謝制御ネットワークを統合的に捉えらるようになった。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 (12件)

  • [雑誌論文] Restriction and modification of SP10 phage by BsuM of Bacillus subtilis Marburg2005

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Matsuoka
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology Letters 244

      ページ: 335-339

  • [雑誌論文] A polysaccharide deacetylase homologue, PdaA, in Bacillus subtilis acts as an N-acetylmuramic acid deacetylase in vitro2005

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Fukushima
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology 187

      ページ: 1287-1292

  • [雑誌論文] Negative transcriptional regulation of the ilv-leu operon for biosynthesis of branched-chain amino acids through the Bacillus subtilis global regulator TnrA2004

    • 著者名/発表者名
      Sigeo Tojo
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology 186

      ページ: 7971-7979

  • [雑誌論文] Identification of the nonA and nonB loci of Bacillus subtilis Marburg permitting the growth of SP10 phage2004

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Matsuoka
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems 79

      ページ: 311-317

  • [雑誌論文] Bacillus subtilis LmrA is a repressor of the lmrAB and yxaGH operons : identification of its binding site and functional analysis of lmrB and yxaGH2004

    • 著者名/発表者名
      Ken-ichi Yoshida
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology 186

      ページ: 5640-5648

  • [雑誌論文] Characterization of a polysaccharide deacetylase gene homologue (pdaB) on sporulation of Bacillus subtilis2004

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Fukushima
    • 雑誌名

      Journal of Biochemistry (Tokyo) 136

      ページ: 283-291

  • [雑誌論文] IVH (ykvV), a requisite cortex formation gene, is expressed in both sporulating compartments of Bacillus subtilis2004

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Imamuraspo
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology 186

      ページ: 5640-5648

  • [雑誌論文] Bacillus subtilis SalA (YbaL) negatively regulates expression of scoC, which encodes the repressor for the alkaline exoprotease gene, aprE2004

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Ogura
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology 186

      ページ: 3056-3064

  • [雑誌論文] Systematic analysis of SigD-regulated genes in Bacillus subtilis by DNA microarray and Northern blotting analyses2004

    • 著者名/発表者名
      Masakuni Serizawa
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology 186

      ページ: 5640-5648

  • [雑誌論文] Interaction of Bacillus subtilis extracytoplasmic function (ECF) sigma factors with the N-terminal regions of their potential anti-sigma factors.2004

    • 著者名/発表者名
      Mika Yoshimura
    • 雑誌名

      Microbiology 150

      ページ: 591-599

  • [雑誌論文] Elaborate transcription regulation of the Bacillus subtilis ilv-leu operon involved in the biosynthesis of branched-chain amino acids through global regulators of CcpA, CodY and TnrA

    • 著者名/発表者名
      Shigeo Tojo
    • 雑誌名

      Mol.ecular Microbiology (印刷中)

  • [雑誌論文] The Bacillus subtilis YdfHI two-compoment system regulates the transcription of ydfJ that is a member of the RND superfamily

    • 著者名/発表者名
      Masakuni Serizawa
    • 雑誌名

      Micobiology (印刷中)

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公開日: 2006-07-12   更新日: 2016-04-21  

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