ニワトリ機能遺伝子の大規模染色体マッピングによる比較染色体地図の作製

2001 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 12460120
• 研究機関: 北海道大学
• 研究代表者: 松田 洋一 北海道大学, 先端科学技術共同研究センター, 教授 (70165835)
• 研究分担者: 梅原 千鶴子 北海道大学, 先端科学技術共同研究センター, 助手 (80291227) ; 阿形 清和 岡山大学, 理学部, 教授 (70167831) ; 島田 清司 名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 教授 (40065579)
• キーワード: ニワトリ / ヒト / ニホンウズラ / FISH / 比較染色体地図 / 染色体相同性 / DNAライブラリー / ESTクローン

研究概要

ニワトリの脳より作製したcDNAライブラリーから2,000個のcDNAクローンを単離し、部分配列を決定してEST化を行った。NCBIのデータベースを用いてホモロジー検索を行った結果、1,468種類の遺伝子のESTクローンを得ることができた。既知の機能遺伝子と高い相同性をもつクローンが高頻度で同定され、今回得られた1,468ESTクローンの内、それぞれ507、342、179のヒト、マウス、ニワトリ遺伝子のホモログが得られた。今年度はこれらのESTクローンの中から46のヒト遺伝子ホモログと共同研究者より分与された既存の40遺伝子DNAクローンをダイレクトR-バンディングFISH法を用いてニワトリ染色体上にマッピングした。86機能遺伝子の中で、マクロ染色体にマップされたものは50、マイクロ染色体にマップされたものは36であり、ニワトリ-ヒト間で新たに5つの染色体相同領域が検出された。昨年度のデータを加えると192の機能遺伝子が新たにニワトリ染色体上にマップされたことになり、ニワトリ-ヒト間で計14の新たな保存領域が検出された。この数はこれまでに全世界でマップされた機能遺伝子の約3分の1に当たる。
次に、我々がニワトリコスミドDNAライブラリーより得たニワトリ1-8番染色体およびZ染色体にマップされる50のコスミドクローンと16の機能遺伝子cDNAクローンを用いてニワトリ-ニホンウズラ間で比較染色体地図を作製した。その結果、ニワトリ-ウズラ間で高い染色体相同性が存在することが判明し、さらに4つの染色体逆位の存在を同定することができた。この結果は、DNAクローンの比較染色体マッピングが、異なる鳥類種間に生じた染色体構造変化を詳細に分析する手段として非常に有効であることを示している。

研究成果

• [文献書誌] Kansaku, N., Matsuda et al.: "Molecular cloning of chicken vasoactive intestinal polypeptide receptor complementary DNA, tissue distribution and chromosomal localization"Biology of Reproduction. 64. 1575-1581 (2001)
• [文献書誌] Inoue-Murayama, Matsuda et al.: "Chicken microsatellite primers are not efficient markers for Japanese quail"Animal Genetics. 32. 7-11 (2001)
• [文献書誌] Ogura, K., Matsuda et al.: "Cloning and chromosomal mapping of human and chicken iroquois(IRX) genes"Cytogenetics and Cell Genetics. 92. 320-325 (2001)
• [文献書誌] Yokomine, T., Matsuda et al.: "Sequence polymorphisms, allelic expression status and chromosomal localization of the chicken IGF2 and MPR1 genes"Cytogenetics and Cell Genetics. 93. 109-113 (2001)
• [文献書誌] Shibusawa, M., Matsuda et al.: "Chromosomal localization of two Z-chromosome-specific DNA fragments(DZGif1 and DZGif2) in Japanese quail"Animal Science Journal. 72. 431-432 (2001)
• [文献書誌] Fukui, A., Matsuda et al.: "Molecular cloning and functional characterization of chicken toll-like receptors: a single chicken toll covers multiple molecular patterns"Journal Biological Chemistry. 276. 47143-47149 (2001)