| 研究課題/領域番号 |
12556001
|
|---|
| 研究機関 | 北海道大学 |
|---|
研究代表者 |
三上 哲夫 北海道大学, 大学院・農学研究科, 教授 (50133715)
|
|---|
| 研究分担者 |
田中 征勝 独立行政法人農業技術研究機構, 北海道農業研究センター, 室長(研究職)
貴島 祐治 北海道大学, 大学院・農学研究科, 助教授 (60192556)
久保 友彦 北海道大学, 大学院・農学研究科, 講師 (40261333)
池口 正二郎 ホクレン農業組合研究所, 主任研究員
|
|---|
| キーワード | テンサイ / 稔性回復核遺伝子 / BACライブラリー / 共優性マーカー / TAIL PCR / コンティグ / ポジショナルクローニング / X遺伝子 |
|---|
| 研究概要 |
今年度得られた研究成果は次の通りである。
[1]稔性回復核遺伝子Xを含むコンティグの作成
X遺伝争と密接に連鎖するAFLPマーカーをクローン化し、これらを用いてBACライブラリーのスクリーニングを行った。その結果、複数の陽性BACクローンが得られたので、各クローンの末端DNA配列をthermal asymmetric interlaced(TAIL)PCRまたはVectorette PCRにより調製し、各クローン間の重複関係を調査した。またコンティグ作成の過程で、コンティグ間のギャップを埋めるためクローン末端DNA配列をプローブに使ってゲノムウォーキングも試みた。現在までに、X遺伝子座周辺の900kbに亘る領域をカバーするコンティグを作成し、物理地図を試作することができた。
[2]CAPS(cleaved amplified polymorphic sequences)マーカーの作製とX座の限定
扱いが簡便で信頼度の高い共優性マーカーの1つであるCAPSマーカーを作り、連鎖分析に供した。その結果、X遺伝子座近傍に7個のCAPSマーカーを設定することができた。またX遺伝子座はコンティグ上の500kbの領域に含まれることが結論された。今後はさらに新たなDNAマーカーを設定してX遺伝子座の絞り込みを進めると同時に、シーケンス解析を開始する予定である。
|
