2001 年度実績報告書

循環器感受性遺伝子解析のためのTaqMan PCR法の確立

研究課題

研究課題/領域番号	12557063
研究機関	大阪大学
研究代表者	勝谷友宏大阪大学, 医学系研究科, 助手 (30311757)
研究分担者	檜垣實男大阪大学, 医学系研究科, 助教授 (70189744)
キーワード	遺伝子多型 / MGBプローブ / 疾患感受性 / SNPs / 高血圧 / TaqManケミストリー / 遺伝疫学 / 多因子疾患
研究概要	DNAチップ技術が注目を集めているが、圧倒的に高頻度である遺伝性多因子疾患、特に本能性高血圧症や糖尿病といった疾患の解析には、統計学的に十分なパワーが要求されることから、多施設での大量検体収集の解析には不向きである。プレDNAチップとして中小規模の施設でも検討可能な遺伝子解析技術の確立が必要であり、定量的RT-PCR(reverse transcriptase PCR)における定量性を高め、Western blottingと同様の信頼性を得ることを目的として開発されたTaq Man PCR法の応用が求められている。本法においてプローブは多形性部位が中心に来るように設計されるが、当該領域がGCリッチであったり、同一塩基が3つ以上続く場合はTaq Man ケミストリー法の適応が困難とされる。特に、primerとプローブが同時にアニーリングするため、各primer濃度のバランス、アニーリング温度の設定が重要であり、塩基配列に応じたPCR条件の設定およびMGBプローブの活用が有効であった。本年度は実際にMGBプローブも用いて、3省庁合同のヒトゲノム遺伝子解析の倫理指針に則り収集された検体を用いて、TaqMan PCR法を実施し、大規模集団における遺伝子型決定を行った。本法は再現性に優れ、少量のDNAを迅速かつ安価に処理できることが判明したが、より最少反応量の決定を目指して、条件の検討を続けている。

研究成果

(6件)

すべてその他

すべて文献書誌 (6件)

[文献書誌] Morimoto S, Katsuya T, et al.: "Deletion allele of the angiotensin-converting enzyme gene as a risk factor for pneumonia in elderly patients"Am J Med. 112. 89-94 (2002)
[文献書誌] Fu Y, Katsuya T, Higaki J, et al.: "A common mutation of low-density lipoprotein receptor gene is associated with essential hypertension among Japanese"J Hum Hypertens. 15. 125-130 (2001)
[文献書誌] Asai T, Katsuya T, Higaki J, et al.: "Endothelin-1 gene variant associates with blood pressure in obese Japanese subjects : the Ohasama Study"Hypertension. 38. 1321-1324 (2001)
[文献書誌] Matsubara M, Katsuya T, Higaki J, et al.: "Aldosterone synthase gene (CYP11B2) C-334T polymorphism, ambulatory blood pressure and nocturnal decline in blood pressure in the general Japanese population : the Ohasama Study"J Hypertens. 19. 2179-2184 (2001)
[文献書誌] Katsuya T, Higaki J, et al.: "Effects of antihypertensive drugs and gene variants in the renin-angiotensin system"Hypertens Res. 24. 463-467 (2001)
[文献書誌] Fu Y, Katsuya T, Higaki J, et al.: "Lack of correlation between Mbo I restriction fragment length polymorphism of renin gene and essential hypertension in Japanese"Hypertens Res. 24. 295-298 (2001)

2001 年度 実績報告書

循環器感受性遺伝子解析のためのTaqMan PCR法の確立

研究代表者

勝谷 友宏 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (30311757)

研究成果

[文献書誌] Morimoto S, Katsuya T, et al.: "Deletion allele of the angiotensin-converting enzyme gene as a risk factor for pneumonia in elderly patients"Am J Med. 112. 89-94 (2002)

[文献書誌] Fu Y, Katsuya T, Higaki J, et al.: "A common mutation of low-density lipoprotein receptor gene is associated with essential hypertension among Japanese"J Hum Hypertens. 15. 125-130 (2001)

[文献書誌] Asai T, Katsuya T, Higaki J, et al.: "Endothelin-1 gene variant associates with blood pressure in obese Japanese subjects : the Ohasama Study"Hypertension. 38. 1321-1324 (2001)

[文献書誌] Matsubara M, Katsuya T, Higaki J, et al.: "Aldosterone synthase gene (CYP11B2) C-334T polymorphism, ambulatory blood pressure and nocturnal decline in blood pressure in the general Japanese population : the Ohasama Study"J Hypertens. 19. 2179-2184 (2001)

[文献書誌] Katsuya T, Higaki J, et al.: "Effects of antihypertensive drugs and gene variants in the renin-angiotensin system"Hypertens Res. 24. 463-467 (2001)

[文献書誌] Fu Y, Katsuya T, Higaki J, et al.: "Lack of correlation between Mbo I restriction fragment length polymorphism of renin gene and essential hypertension in Japanese"Hypertens Res. 24. 295-298 (2001)

2001 年度実績報告書

勝谷友宏大阪大学, 医学系研究科, 助手 (30311757)