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マウスプロリルエンドペプチダーゼは、N末側とC末側のペプチダーゼドメイン、並びに中間のプロペラードメインから構成されている。この蛋白質をコードするマウスプロリルエンドペプチダーゼ遺伝子は、15のエクソンから構成されている。この内、エクソン6は、プロペラードメインを構成するペプチドをコードする。ポリA付加シグナルを有するネオマイシン耐性遺伝子がエクソン6に挿入されると、エクソン7以降の転写が起きなくなることが期待される。また、万一、エクソン6をスキップして、エクソン5とエクソン7が連結するような場合があっても(すなわち、エクソン6を欠いたmRNAが発現する場合)、エクソン6の欠失によるフレームシフト変異が起き、正常な蛋白質は翻訳されなくなる。以上のことから、エクソン6の欠失が遺伝子欠損を引き起こすと考えた。本研究では、129系統のマウスのゲノムライブラリーより、プロリルエンドペプチダーゼ遺伝子を行った。得られたゲノムDNAを元に、エクソン6にネオマイシン耐性遺伝子を置換したターゲティングベクターを構築した。エレクトロポーレーション法を用いて、ターゲティングベクターをマウスES細胞に導入し、相同組み換えにより、ES細胞ゲノム上のプロリルエンドペプチダーゼ遺伝子が破壊されたES細胞を樹立した。さらに、このES細胞を用いて、キメラマウスを作出した。現在、作出したキメラマウスからES由来のF1マウスが誕生するかについて調べている。
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