2000 年度実績報告書

質量分析法によりDNA多型を検索するDNAチップの開発

研究課題

研究課題/領域番号	12794019
研究機関	東海大学
研究代表者	猪子英俊東海大学, 医学部, 教授 (10101932)
研究分担者	川畑慎一郎島津製作所, 分析機器事業部, プロダクトマネージャー田宮元東海大学, 医学部, 助手 (10317745) 椎名隆東海大学, 医学部, 助手 (00317744)
キーワード	質量分析 / MALDI-TOF / 遺伝子多型 / SNP / HLA / マイクロサテライト / スライドガラス / DNAチップ
研究概要	これまでに行われてきたDNA分子の質量分析では、測定における種々のパラメータのうち、どのパラメータがどのように測定値に影響するのかという点に関して十分な検証がなされていなかったため、再現性の高い結果を得ることは困難であった。そこで我々は、まずはじめに(1)DNA鎖長、(2)DNA濃度、(3)DNA溶液の純度、という3つのパラメータに着目し、詳細な条件検討を行った。検討の結果、最適な条件を見出すことに成功し、当初20〜50bpまでのDNA分子の検出が限界であったのに対し、現在では200bp程度まで極めて再現性良く測定することが可能となった。それと同時に、飛躍的な分解能の向上を実現した。一方、ハード面では、次世代のMALDI-TOF質量分析計であるAXIMA-CFRを新たに開発した。本装置は、デフォルトの設定では384検体の質量分析を一回の測定で行うことが可能であり、フリーフォーマットでのサンプルウェル指定を行えば数千検体の処理を一回で行うことが可能である。このハイスループット性は、今後本研究を実用化する際の重要な要素として位置付けられる。現在は、マトリックスの検討も含め更に詳細に種々の条件検討を行っている。それに加え、質量分析計の更なる性能の向上に取り組んでいる。これらのソフト面、ハード面の両方向からのアプローチにより、500bp程度のDNA分子についての安定した測定系を確立し、最終的には研究面・臨床面での実用性・応用性に十分に耐え得るDNAチップを作製したいと考えている。

研究成果
(8件)

すべてその他

すべて文献書誌 (8件)

[文献書誌] Shiina T et al.: "The beta 1,3-galactosyltransferase-4 (B3GALT4) gene is located in the centromeric segment of the human MHC class II region."Immunogenetics. 51. 75-78 (2000)
[文献書誌] Teraoka Y et al.: "Genetic polymorphisms in the cell growth regulated gene, SC1 telomeric of the HLA-C gene and lack of association with psoriasis vulgaris."Tissue Antigens. 55. 206-611 (2000)
[文献書誌] Ikewaki I et al.: "A unique monoclonal antibody mNI-11 rapidly enhances spread formation in human umbilical vein endothlial cells."J Clinical Immunology. 20. 317-324 (2000)
[文献書誌] Naruse T et al.: "HLA-DQ1 ^*0601 is primarily associated with the susceptibility to cardiac sarcoidosis."Tissue Antigens. 56. 52-57 (2000)
[文献書誌] Iwasaki M et al.: "Polymorphism of the ABO blood group genes in Hans, Kazak and Uygur populations in the Silk Route of northwestern China."Tissue Antigens. 56. 136-172 (2000)
[文献書誌] Ota M et al.: "On the MICA deleted-MICB null, HLA-B4801 haplotype."Tissue Antigens. 56. 268-271 (2000)
[文献書誌] Kanaya K et al.: "Major Histocompatibility Complex 2000"Springer. 561 (2000)
[文献書誌] Yabuki K et al.: "HLA testing in patients with uveitis."Lippincott Williams & Wilkins. 367 (2000)

2000 年度 実績報告書

質量分析法によりDNA多型を検索するDNAチップの開発

研究代表者

猪子 英俊 東海大学, 医学部, 教授 (10101932)

研究成果

[文献書誌] Shiina T et al.: "The beta 1,3-galactosyltransferase-4 (B3GALT4) gene is located in the centromeric segment of the human MHC class II region."Immunogenetics. 51. 75-78 (2000)

[文献書誌] Teraoka Y et al.: "Genetic polymorphisms in the cell growth regulated gene, SC1 telomeric of the HLA-C gene and lack of association with psoriasis vulgaris."Tissue Antigens. 55. 206-611 (2000)

[文献書誌] Ikewaki I et al.: "A unique monoclonal antibody mNI-11 rapidly enhances spread formation in human umbilical vein endothlial cells."J Clinical Immunology. 20. 317-324 (2000)

[文献書誌] Naruse T et al.: "HLA-DQ1 ^*0601 is primarily associated with the susceptibility to cardiac sarcoidosis."Tissue Antigens. 56. 52-57 (2000)

[文献書誌] Iwasaki M et al.: "Polymorphism of the ABO blood group genes in Hans, Kazak and Uygur populations in the Silk Route of northwestern China."Tissue Antigens. 56. 136-172 (2000)

[文献書誌] Ota M et al.: "On the MICA deleted-MICB null, HLA-B4801 haplotype."Tissue Antigens. 56. 268-271 (2000)

[文献書誌] Kanaya K et al.: "Major Histocompatibility Complex 2000"Springer. 561 (2000)

[文献書誌] Yabuki K et al.: "HLA testing in patients with uveitis."Lippincott Williams & Wilkins. 367 (2000)

2000 年度実績報告書

猪子英俊東海大学, 医学部, 教授 (10101932)