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2014 年度 実績報告書

樹状細胞由来破骨細胞を中心とした歯周炎病態形成機構の"骨免疫学"的視点からの解明

研究課題

研究課題/領域番号 12J05841
研究機関東北大学

研究代表者

河田 恵子  東北大学, 歯学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
キーワード分化誘導 / 転写調節系の分子解剖 / TALエフェクター
研究実績の概要

ESTファミリー転写因子PU.1は主に骨髄球系前駆細胞に発現し、成人型造血における細胞の運命選択に重要な役割を果たす。しかし、PU.1遺伝子の発現が転写因子ネットワーク内でどのように同細胞の分化を制御しているのか、そのメカニズムは十分に解明されていない。本研究の目的は、転写因子PU.1を中心とするゲノムワイド転写因子マップを作成することで、そのため標的ゲノム編集技術であるTALEを用いてPU.1のエンハンサーの修飾を試みた。この修飾によりPU.1遺伝子の発現レベルを変化させることで生じる転写因子ネットワークの変化を単一細胞レベルで解析することとした。本研究においては、まず造血幹細胞および造血前駆細胞の運命を決定づける転写制御の分子機構を明らかにするのに必要なTALEを用いた解析法の開発に取り組んだ。ES細胞のPU.1の転写開始点下流14kbに存在するエンハンサーにTALEを用いて転写活性化ドメインVP64あるいは転写抑制ドメインKRABをコードするDNAを導入し、 EB(EB: 胚様体)を形成させた。導入したDNAにはドキシサイクリン標識を行い、PU.1およびそれに隣接した遺伝子群の発現に及ぼす影響と造血細胞分化へ及ぼす効果を解析した。
その結果、TALEを用いた標的ゲノム編集と単一細胞レベルでの遺伝子発現プロファイリングを組み合わせた方法が、遺伝子レベルでの細胞分化調節ネットワークの解析に有用であることが明らかとなった。本研究で実施したTALEを用いたPU.1-14kbの活性化によって細胞表面抗原の発現量は変化し、造形細胞への運命決定が促進されることが示された。すなわち、単一細胞遺伝子発現解析の結果、PU.1-14kbの活性化は同細胞内の転写因子ネットワークが内皮系から造血系へと推移させた。本研究はPU.1-14kbの造血細胞分化に果たす重要性を明らかにしたばかりでなく、遺伝子ネットワーク解析におけるTALEを用いた標的ゲノム編集の有用性を示した。

現在までの達成度 (段落)

26年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Single-cell analyses of regulatory networkperturbations using enhancer-targeting TALEs suggest novel roles for PU.1 during haematopoietic specification2014

    • 著者名/発表者名
      Wilkinson AC*, Kawata VK*, Judith Schutte, Gao X, Antoniou S, Baumann C, Woodhouse S,Hannah R, Tanaka Y, Swiers G, Moignard V, Fisher J, Shimauchi H, Tijssen MR, de Bruijn MF, Liu P, Gottgens B. (*共同第一著者)
    • 雑誌名

      Development

      巻: 141 ページ: 4018-30

    • DOI

      10.1242/dev.115709

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Analysis of haematopoietic transcription factor networks using TALEs2015

    • 著者名/発表者名
      河田恵子
    • 学会等名
      国際高等研究教育機構(IIARE)
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2015-03-03 – 2015-03-03
  • [学会発表] High-throughput single-cell gene expression analysis of transcriptional regulation of PU.1 enhancer in blood stem/progenitor cells2014

    • 著者名/発表者名
      河田恵子
    • 学会等名
      全領域合同研究交流会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2014-12-08 – 2014-12-08

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公開日: 2016-06-01  

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