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2003 年度 研究成果報告書概要

コンポジット生体触媒の分子設計と進化工学

研究課題

研究課題/領域番号 13125101
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関京都大学

研究代表者

江崎 信芳  京都大学, 化学研究所, 教授 (50135597)

研究分担者 林 秀行  大阪医科大学, 医学部, 助教授 (00183913)
谷澤 克行  大阪大学, 産業科学研究所, 教授 (20133134)
虎谷 哲夫  岡山大学, 工学部, 教授 (70026318)
島田 秀夫  慶應義塾大学, 医学部, 助教授 (80095611)
広津 建  大阪市立大学, 大学院・理学研究科, 教授 (10047269)
研究期間 (年度) 2001 – 2003
キーワードコンポジット生体触媒 / 補酵素 / 構造活性相関 / ピリドキサルリン酸 / コバラミン / フラビン / ヘム / ビルトイン補酵素
研究概要

コンポジット生体触媒の構造活性相関の解明、新しいコンポジット生体触媒の創出について、以下のような成果が得られた。虎谷らは、コバラミン酵素の立体構造に基づいて精密触媒機構を解明し、タンパク質工学的手法で酵素の反応性を改変した。また理論化学計算により、反応機構のエネルギー論的妥当性を示した。さらに、種々のアポ酵素モデルを用いてコバラミンのコンポジット触媒を構築した。谷澤らは、タンパク質の翻訳後修飾により生成するビルトイン型キノン補酵素を研究対象として、新規キノン補酵素を発見・同定するとともに、その生成機構を解明した。また、これらの酵素の立体構造や触媒機構を明らかにし、機能改変・デノボデザインに必要な基礎的研究を行った。三浦らは、天然フラビンと酸化還元特性の異なる人工フラビンをフラビン酵素に再構成させ、新規反応を触媒するフラビン酵素を作製した。堀池らは、種々のジオキシゲナーゼの構造と機能の比較から、基質認識と酸素分子活性化の分子基盤を解明した。林らは、ピリドキサール酵素のプロトン移動過程を調べることにより、これらの酵素の精密な反応機構を解明した。その結果、従来概念論の域を出なかった「誘導適合が触媒能力を高める機構」や「多基質認識の機構」の分子論的実体を明らかにすることができた。広津らは、天然のコンポジット触媒の精密立体構造解析を行った。江崎らは、鉄硫黄クラスター形成機構の詳細を明らかにするとともに、新しいコンポジット生体触媒を開発し、種々の光学活性化合物の生産法を開発した。島田らは、高機能生体触媒開発研究を展開し、タンパク質改変と化学修飾ヘム導入の実効性を種々の新規触煤体の開発で示した。

  • 研究成果

    (207件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (207件)

  • [文献書誌] Miyaka, Y., Deshimaru, S., Toraya, T.: "Revised Sequence and Expression of Cyclin B cDNA from the Starfish Asterina pectinifera."Biosci.Biotech.Biochem.. 65. 1119-1126 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Toraya, T., Eda, M., Kamachi, T., Yoshizawa, K.: "Energetic Feasibility of Hydrogen Abstraction and Recombination in coenzyme B12-dependent Diol Dehydratase Reaction."J.Biochem.. 130. 865-872 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Kajiura, H., Mori, K., Tobimatsu, T., Toraya, T.: "Characterization and Mechanism of Action of a Reactivating Factor for Adenosylcobalamin-dependent Glycerol Dehydratase."J.Biol.Chem.. 276. 36514-36519 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 安岡則武, 柴田直樹, 虎谷哲夫: "ラジカル反応の初期過程の構造生物化学:B12補酵素関与ジオールデヒドラターゼの放射光による研究"生物物理. 41(4). 201-204 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 虎谷哲夫: "ラジカルによって触媒される酵素反応:ビタミンB_<12>酵素の立体構造と精密触媒機構"生化学. 74(2). 87-102 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 鏡山博行, 三浦 洌, 虎谷哲夫: "補酵素作用のダイナミズム-酵素の機能を支えるアポタンパクの働き-"ビタミン. 76. 273-282 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Eda, M., Kamachi, T., Yoshizawa, K., Toraya, T.: "Theoretical study on the mechanism of catalysis of coenzyme B12-dependent diol dehydratase."Bull.Chem.Soc.Jap.. 75(7). 1469-1481 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Shibata, N., Masuda, J., Morimoto, Y., Yasuoka, N., Toraya, T.: "Substrate-Induced Conformational Change of a Coenzyme B 12-Dependent Enzyme : Crystal Structure of the Substrate-Free Form of Diol Dehvdratase."Biochemistry. 41(42). 12607-12617 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Yamanishi, M., Tobimatsu, T., Toraya, T.et al.: "The crystal structure of coenzyme B 12-dependent glycerol dehydratase in complex with cobalamin and 1,2-propanediol."Eur.J.Biochem.. 269. 4484-4494 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Fukuoka, M., Yamanishi, M., Zou, X., Brown, L.K., Toraya, T.et al.: "Functions of the D-Ribosyl Moiety and the Lower Axial Ligand of the Nucleotide Loop of Coenzyme B12 in Diol Dehydratase and Ethanolamine Ammonia-lease Reactions"J.Biochem.. 132(6). 935-943 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Toraya, T.: "Enzymatic Radical Catalysis : Coenzyme B12-Dependent Diol Dehydratase."The Chemical Records. 2. 352-366 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Toraya, T.: "Radical Catalysis in Coenzyme B 12- Dependent isomerization (Eliminating) Reactions"Chem.Rev.. 103. 2095-2127 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Shibata, N., Nakanishi, Y., Yamanishi, M., Yasuoka, N.Toraya, T., et al.: "Structural Rationalization for the Lack of Stereospecificity in Coenzyme B12-dependent Dial Dehydratase"J.Biol.Chem.. 278(25). 22717-22725 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 虎谷哲夫: "シンポジウムB群ビタミンはどのように働くか:ビタミンB12酵素の立体構造と精密触媒機構"ビタミン. 77(5・6). 297-312 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Toraya, T., Oka, T., Ando, M., Yamanishi, M., Nishihara, H.: "Novel Pathway for Utilization of Cyclopropanecarboxylate by Rhodococcus rhodochrous."Appl.Environ.Microbiol. 70(1). 224-228 (2004)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] I.Van denberghe, et al.: "The Covalent Structure of the Small Subunit from Pseudomonas putida Amine Dehydrogenase Reveals the Presence of Three Novel Types of Internal Cross-Linkages, All Involving Cysteine in a Thio-Ether Bond"J.Biol.Chem.. 276. 42923-42931 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S.Datta, et al.: "Structure of a Quinohemoprotein Amine Dehydrogenase with an Uncommon Redox Cofactor and Highly Unusual Crosslinking"Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.. 98. 14268-14273 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S.Hirota, et al.: "Spectroscopic Observation of Intermediates Formed during the Oxidative Half-Reaction of Copper/Topa Quinone-Containing Phenylethylamine Oxidase"Biochemistry. 40. 15789-15796 (2001)

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  • [文献書誌] K.Mli_kova, et al.: "Inhibition of Copper Amine Oxidases by Pyridine-Derived Aldoximes and Ketoximes"Biochimie. 83. 995-1002 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] C.Ogino, et al.: "Identification of novel membrane-bound phospholipase D from Streptoverticillium cinnamoneum, possessing only hydrolytic activity"Biochem.Biophys.Acta. 1530. 23-31 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] K.Tanizawa, et al.: "UDP-Glucose pyrophosphorylase : primary structure and affinity labeling"J.Biochem.Mol.Biol.Biophys.. 5. 83-98 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 谷澤克行: "バイオファクター研究のブレークスルー:「PQQ」(3)TPQ, TTQ, LTQ"ビタミン. 75. 367-373 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] T.Okajima, et al.: "Novel Trimeric Adenylate Kinase from an Extremely Thermoacidophilic Archaeon, Sulfolobus solfataricus : Molecular Cloning, Nucleotide Sequencing, Expression in Escherichia coli, and Characterization of the Recombinant Enzyme"Biosci.Biotech.Biochem.. 66. 2112-2124 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M.Kim, et al.: "X-ray Snapshots of Quinone Cofactor Biogenesis in Bacterial Copper Amine Oxidase"Nature Struct.Biol.. 9. 591-596 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S.Iwaki, et al.: "Real-time Monitoring of Histamine Released from Rat Basophilic Leukemia (RBL-2H3) Cells with a Histamine Microsensor Using Recombinant Histamine Oxidase"Anal.Biochem.. 304. 236-243 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S.Kishishita, et al.: "Role of Copper Ion in Bacterial Copper Amine Oxidase : Spectroscopic and Crystallographic Studies of Metal-substituted Enzymes"J.Am.Chem.Soc.. 125. 1041-1055 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M.Uchida, et al.: "Stereochemistry of 2-Phenylethylamine Oxidation Catalyzed by Bacterial Copper Amine Oxidase"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 67. 2664-2667 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Ogino, et al.: "Phospholipase D from Streptoverticillium cinnamoneum : Protein Engineering and Application for Phospholipid Production"J.Mol.Cat.. B23. 107-115 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] K.Kataoka, K.Tanizawa: "Alteration of Substrate Specificity of Leucine Dehydrogenase by Site-directed Mutagenesis"J.Mol.Cat.. B23. 299-309 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] D.Sun, et al.: "Chemical and Kinetic Reaction Mechanisms of Quinohemoprotein Amine Dehydrogenase from Paracoccus denitrificans"Biochemistry. 42. 10896-10903 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S.Kodera, et al.: "Detection of Protein-Protein Interactions on SiO_2/Si Surfaces by Spectroscopic Ellipsometry"Anal.Biochem.. 321. 65-70 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 谷澤克行: "新しいペプチド・ビルトイン型キノン補酵素:その構造と触媒機能および生合成機構"ビタミン. 77. 275-283 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 岡島俊英, 谷澤克行: "ペプチド・ビルトイン型補酵素研究の新展開.酵素の多彩な触媒機能発現のための"しかけ"を探って"蛋白質核酸酵素. 48. 740-746 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] H.Matsunami, et al.: "Chemical Rescue of a Site-specific Mutant of Bacterial Copper Amine Oxidase for Generation of the Topa Quinone Cofactor"Biochemistry. 43. 2178-2187 (2004)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Miura, C.Setoyama, Y.Nishina, K.Shiga, I.Miyahara, H.Mizutani, K.Hirotsu: "Porcine kidney D-amino acid oxidase : the three-dimensional structure and its catalytic mechanism based on the enzyme-substrate complex model."J.Mol.Catalysis B : Enzymatic. 12. 43-52 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Miura: "Versatility and specificity in flavoenzymes : Control mechanisms of flavin reactivity."The Chemical Record. 1. 183-194 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Y.Nakajima, I.Miyahara, K.Hirotsu, Y.Nishina, K.Shiga, C.Setoyama, H.Tamaoki, R.Miura: "X-Ray crystallographic study of rat acyl-CoA oxidase II."Protein Sci.. 10. 85-86 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Y.Nakajima, I.Miyahara, K.Hirotsu, Y.Nishina, K.Shiga, C.Setoyama, H.Tamaoki, R.Miura: "Crystallization and preliminary X-ray characterization of rat liver acyl-CoA oxidase"Acta Crystallogr.. D57. 1680-1681 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] C.Setoyama, Y.Nishina, H.Tamaoki, H.Mizutani, I.Miyahara, K.Hirotsu, K.Shiga, R.Miura: "Effects of hydrogen bonds in association with flavin and substrate in flavoenzyme D-amino acid oxidase. The catalytic and structural roles of Gly313 and Thr317."J.Biochem.. 131. 59-69 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Y.Nakajima, I.Miyahara, K.Hirotsu, Y.Nishina, K.Shiga, C.Setoyama, H.Tamaoki, R.Miura: "Three-dimensional structure of the flavoenzyme acyl-CoA oxidase-II from rat liver, the peroxisomal counterpart of mitochondrial acyl-CoA dehydrogenase."J.Biochem.. 131. 365-374 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] A.Satoh, Y.Nakajima, I.Miyahara, K.Hirotsu, T.Tanaka, Y.Nishina, K.Shiga, H.Tamaoki, C.Setoyama, R.Miura: "Structure of the transition state analog of medium-chain acyl-COA dehydrogenase. Crystallographic and molecular orbital studies on the charge-transfer complex of medium-chain acyl-CoA dehydrogease with 3-thiaoctanoyl-CoA."J.Biochem.. 134. 297-304 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Y.Nishina, K.Sato, H.Tamaoki, H., Tanaka, T., Setoyama, C., R.Miura, K.Shiva: "Molecular mechanism of the drop in the pKa of a substrate analog bound to medium-chain acyl-CoA dehydrogenase : Implications for substrate activation."J.Biochem.. 134. 835-842 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 三浦洌: "フラビン酵素における反応制御の構造的基盤"ビタミン. 77. 313-320 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Tetsuo Ishida: "Quantitative structure-activity relationship for the cleavage of C3/C4-substituted catechols by a prototypal extradiol catechol Dioxygenases with broad substrate specificity"J.Biochem.. (印刷中). (2004)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 石田哲夫: "非ヘム2価鉄イオン単核錯体を利用する酵素群:2-His-1-Carboxylate酵素のO_2を利用した多彩な反応"化学と生物. (印刷中). (2004)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Tetsuo Ishida: "Structure and reaction mechanism of catechol 2,3-dioxygenase (metapyrocatechase)"International Congress Series. 1233. 213-220 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Hirofumi Nakajima: "Accurate measurement of near-micromolar oxygen concentrations in aqueous solutions based on enzymatic extradiol cleavage of 4-chlorocatechol : applications to improved low-oxygen experimental systems and quantitative assessment of back diffusion of oxygen from the atmosphere"J.Biochem.. 131. 523-531 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Nakai, Y.: "Yeast Nfs1p is involved in thio-modification of both mitochondrial and cytoplasmic tRNAs."J.Biol.Chem.. 279・13. 12363-12368 (2004)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Ikushiro, H.: "Reactions of serine palmitoyltransferase with serine and molecular mechanisms of the actions of serine derivatives as inhibitors."Biochemistry. 43・4. 1082-1092 (2004)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Matsuda, N.: "Instability of the apo form of aromatic L-amino Acid decarboxylase in vivo and in vitro : implications for the involvement of the flexible loop that covers the active site."J.Biochem.. 135・1. 33-42 (2004)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Hosono: "Glutamine : phenylpyruvate aminotransferase from an extremely thermophilic bacterium, Thermus thermophilus HB8."J.Biochem.. 134・6. 843-851 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Islam, M.M.: "Reaction of aspartate aminotransferase with C5-dicarboxylic acids : comparison with the reaction with C4-dicarboxylic acids."J.Biochem.. 134・2. 277-285 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Mizuguchi, H.: "Characterization of histidinol phosphate aminotransferase from Escherichia coli."Biochim.Biophys.Acta. 1647・1-2. 321-324 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Ikushiro, H.: "Bacterial serine palmitoyltransferase : a water-soluble homodimeric prototype of the eukaryotic enzyme."Biochim.Biophys.Acta. 1647・1-2. 116-120 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Hayashi, H.: "Strain and catalysis in aspartate aminotransferase."Biochim.Biophys.Acta. 1647・1-2. 103-109 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Goto, M.: "Crystal structures of branched-chain amino acid aminotransferase complexed with glutamate and glutarate : true reaction intermediate and double substrate recognition of the enzyme."Biochemistry. 42・13. 3725-3733 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Hayashi, H.: "Conformational change in aspartate aminotransferase on substrate binding induces strain in the catalytic group and enhances catalysis."J.Biol.Chem.. 278・11. 9481-9488 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Olmo, M.T.: "Spectroscopic analysis of recombinant rat histidine decarboxylase."J.Biochem.. 132・3. 433-439 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 林秀行: "酵素反応のエネルギー論"生化学. 74・1. 5-16 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Kagamiyama, H.: "Release of enzyme strain during catalysis reduces the activation energy barrier."Chem.Rec.. 1・5. 385-394 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Nakayama, T.: "Specificity analysis and mechanism of aurone synthesis catalyzed by aureusidin synthase, a polyphenol oxidase homolog responsible for flower coloration."FEBS Lea.. 499・1-2. 107-111 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Ikushiro, H.: "A water-soluble homodimeric serine palmitoyltransferase from Sphingomonas paucimobilis EY2395T strain, purification, characterization, cloning, and overproduction."J.Biol.Chem.. 276・21. 18249-18256 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] H.Mizuguchi, H.Hayashi, K.Okada, I.Miyahara, K.Hirotsu, H.Kagamiyama: "Strain is More Important than Electrostatic Interaction in Controlling the pKa of the Catalytic Group in Aspartate Aminotransferase."Biochemistry. 40(2). 353-360 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] K.Haruyama, T.Nakai, I.Miyahara, K.Hirotsu, H.Mizuguchi, H.Hayashi, et al.: "Structures of Escherichia coli Histidinol-Phosphate Aminotransferase and Its Complexes with Histidinol-Phosphate and N-(5'-Phosphopyridoxyl)- L-Glutamate : Double Substrate Recognition of the Enzyme"Biochemistry. 40(15). 4633-4644 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] K.Okada, K.Hirotsu, H.Hayashi, H.Kagamiyama: "Structures of Escherichia coli Branched-Chain Amino Acid Aminotransferase and Its Complexes with 4-Methylvalerate and 2-Methylleucine : Induced Fit and Substrate Recognition of the Enzyme"Biochemistry. 40(25). 7453-7463 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] T.Tada, C-T.Lu, Y.Nakamura, K.Wada, I.Miyahara, K.Hirotsu, Y.Katsuya, M.Sawada, et al.: "Crystallization and preliminary X-ray analysis of a novel pectolytic enzyme polymethoxy-galactturonase AX1 from Trichosporon penicillatum"Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. D57(3). 457-458 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] H.Ura, T.Nakai, S.Kawaguchi, I.Miyahara, K.Hirotsu, S.Kuramitsu: "Substrate recognition mechanism of thermophilic dual-substrate enzyme"J.Biochem.. 130(1). 89-98 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] A.Satoh, J-H.Kim, I.Miyahara, B.Devreese, I.Vandenberghe, A.Hacisalihoglu, et al.: "Crystal Structure of Quinohemoprotein Amine Dehydrogenase from Pseudomonas putida"J.Biol.Chem.. 277(4). 2830-2834 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M.Goto, Y.Nakajima, K.Hirotsu: "Crystal structure of argininosuccinate synthetase from Thermus thermophilus HB8. Structural basis for the catalytic action"J.Biol.Chem.. 277(18). 15890-15896 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Omi, H.Mizuguchi, M.Goto, I.Miyahara, H.Hayashi, H.Kagamiyama, K.Hirotsu: "Structure of Imidazole Glycerol Phosphate Synthase from Thermus thermophilus HB8 : Open-Closed Conformational Change and Ammonia Tunneling."J Biochem.. 132(5). 759-765 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 佐藤敦子, 広津 建: "最近の研究から「ビルトイン補酵素を持つアミン脱水素酵素の構造研究 - 新規キノン補酵素と異常な分子内架橋-」"日本結晶学会誌. 44. 176-181 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M.Goto, Y.Agari, R.Omi, I.Miyahara, K.Hirotsu: "Expression, purification and preliminary X-ray characterization of N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase from Thermus thermophilus HB8"Acta Crystallogr.D Biol.Crystallogr.. 59(2). 356-358 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M.Goto, R.Omi, J.Hoseki, N.Nakagawa, I.Miyahara, K.Hirotsu: "Expression, purification and preliminary X-ray characterization of CTP synthetase from Thermus thermophilus HB8."Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 59(3). 551-553 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] A.Satoh, O.Adachi, K.Tanizawa, K.Hirotsu: "The active site structure of quinohemoprotein amine dehydrogenase inhibited by p-nitrophenyl-hydrazine"Biochimica et Biophysica Acta. 1647(1-2). 272-277 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M.Goto I.Miyahara H.Hayashi H.Kagamiyama, K.Hirotsu: "Crystal structures of branched-chain amino Acid aminotransferase complexed with glutamate and glutarate : true reaction intermediate and double substrate recognition of the enzyme."Biochemistry. 42(13). 3725-3733 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M.Gogo, R.Omi, I.Miyahara, M.Sugahara, K.Hirotsu: "Structures of Argininosuccinate Synthetase in Enzyme-ATP-Substrates and Enzyme-AMP-Product Forms : Stereochemistry of the Catalytic Reaction"J.Biol.Chem.. 278(25). 22964-22971 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Omi, M.Goto, I.Miyahara, H.Mizuguchi, H.Hayashi, H.Kagamiyama, K.Hirotsu: "Crystal Structures of Threonine Synthase from Thermus thermophilus HB8 ; Conformational change, substrate recognition, and mechanism"J Biol Chem.. 278(46). 46035-46045 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 森本幸生: "蛋白質結晶学における二次元検出器の利用"日本結晶学会誌. 45. 289-294 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Omi, M.Goto, N.Nakagawa, I.Miyahara, K.Hirotsu: "Expression, purification and preliminary X-ray characterization of histidinol phosphate phosphatase"Acta Crystallogr.D Biol.Crystallogr.. 60(3). 574-576 (2004)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M.Goto, R.Omi, I.Miyahara, A.Hosono, H.Mizuguchi, H.Hayashi, H.Kagamiyama, K.Hirotsu: "Crystal structures of glutamine : phenylpyruvate aminotransferase from Thermus thermophilus HB8: induced fit and substrate recognition"J.Biol.Chem.. 279(16). 16518-16525 (2004)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M.Goto, R.Omi, N.Nakagawa, I.Miyahara, K.Hirotsu: "Crystal Structures of CTP Synthetase reveal ATP, UTP, and Glutamine Binding Sites"Structure. 12(In press). (2004)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] A.Watanabe et al.: "Stereochemistry of hydrogen abstraction from pyridoxamine phosphate catalyzed by alanine racemase of Bacillus stearothermophilus"J.Mol.Catal.B.Enzymatic. 12. 145-150 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] T.Uo et al.: "Purification and characterization of alanine racemase from hepatopancreas of black-tiger prawn, Penaeus monodon"J.Mol.Catal.B : Enzymatic. 12. 137-144 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] T.Uo et al.: "Functional characterization of alanine racemase from Schizosaccharomyces pombe : a eucaryotic counterpart to bacterial alanine racemase"J.Bacteriol.. 183. 2226-2233 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] T.Suzuki et al.: "Cold-active lipolytic activity of psychrotrophic Acinetobacter sp. strain no.6"J.Biosci.Bioeng.. 92. 144-148 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] K.Soda et al.: "Stereospecificity for the hydrogen transfer of pyridoxal enzyme reactions"The Chemical Record. 1. 373-384 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S.Kato et al.: "Screening and identification of a protein interacting with IscU"微量栄養素研究. 18. 105-109 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M.Kashiwa et al.: "Removal of soluble selenium by a selenate-reducing bacterium Bacillus sp. SF-1"BioFactors. 14. 261-265 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] H.Mihara et al.: "Role of cysteine desulfurase in the biosynthesis of formate dehydrogenase H containing Mo, molybdopterin, selenocysteine, and Fe_4S_4 cluster"Biomed.Res.Trace.Elem.. 12. 261-262 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] A.Lewandowicz et al.: "Chlorine kinetic isotope effect on fluoroacetate dehalogenase reaction"J.Am.Chem.Soc.. 123. 9192-9193 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] K.Yokoigawa et al.: "Structure and function of psychrophilic alanine racemase"J.Mot.Catal.B : enzymatic. 12. 27-35 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] A.Watanabe et al.: "Reaction mechanism of alanine racemase from Bacillus stearothermophilus : X-ray crystallographic studies of the enzyme bound with N-(5'-phosphopyridoxyl)-alanine"J.Biol.Chem.. 277. 19166-19172 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] T.Uo et al.: "Gene cloning, purification and characterization of 2,3-diaminopropionate ammonia-lyase from Escherichia col"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 66. 2639-2644 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] U.Tokumoto et al.: "Network of protein-protein interactions among iron-sulfur cluster assembly proteins in Eschrichia col"J.Biochem.. 131. 713-719 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] T.Suzuki et al.: "A cold-active esterase with a substrate preference for vinyl esters from a psychrotroph, Acinetobacter sp.strain no.6 : gene cloning, purification, and characterization"J.Mol.Catal.B : Enzymatic. 16. 255-263 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] T.Suzuki et al.: "Primary structure and catalytic properties of a cold-active esterase from a psychrotroph, Acinetobacter sp.strain no.6 isolated from Siberian soil"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 66. 1682-1690 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S.Kato et al.: "Cys328 of IscS and Cys63 of IscU are the sites of disulfide bridge formation in a covalently-bound IscU/IscS complex : Implications for the mechanism of iron-sulfur cluster assembly"Proc.Natl.Acad.Sci.. 99. 5948-5952 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] E.Pilon-Smits et al.: "Characterization of a NifS-like chloroplast protein from Arabidopsis. Implications for its role in sulfur and selenium metabolism"Plant Physiol.. 130. 1309-1318 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] H.Bae et al.: "Application of a thermostable glutamate racemase from Bacillus sp. SK-1 for the production of D-phenylalanine in a multi-enzyme system"J Mol Catal B : Enzymatic. 17. 223-233 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 山西 守, 飛松孝正, 虎谷哲夫: "生物工学実験書 改訂版 (日本生物工学会編)"培風館. 480 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 虎谷哲夫: "ビタミン研究のブレークスルー-発見から最新の研究まで- (日本ビタミン学会)"学振出版. 296 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 虎谷哲夫: "廣川タンパク質化学 第4巻 酵素 (福井哲也・伊藤正樹編集)"廣川書店. 366 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 後藤祐児, 谷澤克行(編著): "バイオサイエンスの新世紀3 タンパク質の分子設計"共立出版株式会社. 201 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Y.Nakajima, I.Miyahara, K.Hirotsu, Y.Nishina, K.Shiga, C.Setoyama, H.Tamaoki, R.Miura: "Agency for Scientific Publ. Berlin (Eds. Chapman, S., Perham, R., Scrutton, N.)"Flavins and Flavoproteins. 6 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 江崎信芳 他: "生化学基礎の基礎"化学同人. 326 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] N.Esaki et al.: "Isomerizations. Enzyme Catalysis in Organic Synthesis second edition (Edited by K Drauz and H.Waldmann)"VCH. 53 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S.P.Manandhar et al.: "Oxygen and Life - Oxygenases, Oxidases and Lipid Mediators"Elsevier Science Amsterdam, Boston, New York, Oxford, Paris, Sandiego, San Francisco, Singapore, Tokyo. 560 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 下方国稔 他: "ゲノム・プロテオミクスの新展開-生物情報の解析と応用"エヌアイエス出版、東京. 1158 (2004)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] T., Toraya, M.Eda, T.Kamachi, K.Yoshizawa: "Energetic feasibility of hydrogen abstraction and recombination in coenzyme B_<12>-dependent diol dehydratase dreaction."J. Biochem.. 130. 865-872 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Kjiura, K.Mori, T.Tobimatsu, T.Toraya: "Characterization and mechanism of action of reactivation factor for adensylcobalamin-dependent glycerol dehydratase."J. Biol. Chem.. 276. 36514-36519 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] J.Masuda, N.Shibata, Y.Morimoto, T.Toraya, N.Yasuoka: "Radical production simulated by photo-irradiation of the diol dehydratase-adeninylpentylcobalamin complex."J. Synchrotron Radiat.. 8. 1182-1185 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Y.Miyaka, S.Deshimaru, T.Toraya: "Revised sequence and expression of cyclin B cDNA from the starfish Asterina pectinifera."Biosci. Biotech. Biochem.. 65(5). 1119-1116 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Eda, T.Kamachi, K.Yoshizawa, T.Toraya: "Theoretical study on the mechanism of catalysis of conezyme B12-dependent diol dehydratase."Bull. Chem. Soc. Jap.. 75(7). 1469-1481 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] N.Shibata, J.Masuda, Y.Morimoto, N.Yasuoka, T.Toraya: "Substrate-induced conformational change of cenzyme B12-dependent enzyme : Crystal structure of the subsrate-free form of diol dehydratase."Biochemistry. 41(42). 12607-12617 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Yamanishi, M.Yunoki, T.Tobimatsu, H.Sato, J.Matsui A.Dokiya, Y.Iuchi, K.Oe, K.Suto, N.Shibara, Y.Morimoto, N.Yasuoka, T.Toraya: "The crystal structure of coenzyme B12-ependent glycerol dehydratase in complex with cobalamin and 1, 2-propanediol."Eur. J. Biochem.. 269. 4484-4494 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Fukuoka, S.Yamada, S.Miyoshi, K.Yamashita, M.Yamashi, X.Zou, L.K.Brown, T.Toraya: "Functions of the D-ribosyl moiety and teh lower axial ligand of the nucleotide loop of conezyme B12 in diol dehydratase and ethanolamine ammonia-lyase reactions."J. Biochem.. 132(6). 935-943 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Toraya: "Enzymatic radical catalysis : Coenzyme B12-dependent diol dehydratase."The Chemical Records. 2. 352-366 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Toraya: "Radical catalysis in coenzyme B12-dependent isomerization (elininating) reactions."Chem. Rev.. 103. 2095-2127 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] N.Shibata, Y.Nakanishi, M.Fukuoka, M.Yamanishi, N.Yasuoka, T.Toraya: "Structural rationalization for the lack of stereospecificity in coenzyme B12-dependent diol dehydratase."J. Biool. Chem.. 278(25). 22717-22725 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Toraya, T.Oka, M.Ando, M.Yamanishi, H.Nishihara: "Novel pathway for utilization of cyclopropanecarboxylate by Rhodococcus rhodochrous."Appl. Environ. Micobiol.. 70(1). 224-228 (2004)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] I.Vandenberghe, J.-K.Kim, B.Devreese, A.Hacisalihoglu, H.Iwabuki, T.Okajima, S.Kuroda, O.Adachi, J.A.Jongejan, J.A.Duine, K.Tanizawa, J.Van Bdeeumen: "The covalent structure of the small subunit from Pseudomonas putida amine dehydrogenase reveals the presence of three novel types of internal cross-linkages, all involving cysteine in a thio-ether bond."J. Biol. Chem.. 276. 42923-42931 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] S.Datta, Y.Mori, K.Takagi, K.Kawaguchi, Z.W.Chen, T.Okajima, S.Kuroda, T.Ikeda, K.Kano, K.Tanizawa, F.S.Mathews: "Structure of a quinohemoprotein amine dehydrogenase with an uncommon redox cofactor and highly unusual crosslinking."Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.. 98. 14268-14273 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] S.Hirota, T.Iwamoto, S.Kishishita, T.Okajima.O.Yamauchi, K.Tanizawa: "Spectrosocpic observation of intermediates formed during the oxidative half-reaction of coppertopa quinone-containing phenylethylamine oxidase."Biochemistry. 40. 15789-15796 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] K.Mlickova, M.Sebela, R.Cibulka, L.Frebort, P.Pec, F.Liska, K.Tanizawa: "Inhibition of copper amine oxidases by pyridine-derived aldoximes and ketoximes."Biochimie. 83. 995-1002 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] C.Ogino, Y.Negi, H.Daido, M.Kanemasu, A.Kondo, S.Kuroda, K.Tanizawa, N.Shimizu, H.Fukuda: "Identification of novel membrane-bound phospholipase D from Streptoverticillium cinnamoneum, possessing only hydrolytic activity."Biochem. Biophys. Acta. 1530. 23-31 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] K.Tanizawa, M.Kusunoki, T.Fukui: "UDP-glucose pyrophosphorylase : primary structure and affinity albeling."J. Biochem. Mol. Biol. & Biophys.. 5. 83-98 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Okajima, D.Kitaguchi, K.Fujii, H.Matsuoka, S.Goto, S.Uchiyama, Y.Kobayashi, K.Tanizawa: "Novel trimeric adenylate kinase from an extremely thermoacidophilic archaeon, Sulfolobus solfataricus : molecular cloning, nucleotide sequencing, expression in Escherichia coli, and characterization of the recombiant enzyme."Biosci. Biotech. Biochem.. 66. 2112-2124 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Kim.T.Okajima, S.Kishishita, M.Yoshimura, A.Kawamori, K.Tanizawa, H.Yamaguchi: "X-tay snapshots of quinone cofactor biogenesis in bacterial copper amine oxidase."Nature Struct. Biol.. 9. 591-596 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] S.Iwaki, M.Ogasawar, R.Kurita, O.Niwa, K.Tanizawa, Y.Ohashi, K.Mdaeyama: "Real-time monitoring of histamine released from rat basophilic leukemia (RBL-2H3) cell with a histamine microsensor using recombinant histamine oxidase."Anal. Biochem.. 304. 236-243 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] S.Kishishita, T.Okajima, M.Kim H.Yamaguchi, S.Hirota, S.Suzuki, S.Kuroda, K.Tanizawa, M.Mure: "Role of copper ion in bacterinal copper amine oxidase : spectroscopic and crystallographic studies of metal-substituted enzymes."J. Am. Chem. Soc.. 125. 1014-1055 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Uchida, A.Ohtani, N.Kohyama, T.Okajima, K.Tanizawa, Y.Yamamoto: "Stereochemistry of 2-phenylethylamine oxidation catalyzed by bacterial copper amine oxidase."Biosic, Biotechnol. Biochem.. 67. 2664-2667 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] C.Ogino, S.Kuroda, S.Tokuyama, A.Kondo, N.Shimizu, K.Tanizawa, H.Fukuda: "phospholipase D from Streptoverticillium cinnamoneum : protein engineering and application for phospholipid production."J. Mol. Cat.. B23. 107-115 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] K.Kataoka, K.Tanizawa: "Alteration of substrate specificity of leucine dehydrogenase by site-directed mutagenesis."J. Mol. Cat.. B23. 299-309 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] D.Sun, K.Ono, T.Okajima, K.Tanizawa, M.Uchida, Y.Yamamoto, F.S.Mathews, V.L.Davidason: "Chemical and kinetic reaction mechanisms of quinohemoprotein amine dehydrogenase fro mParacocus denitrificans."Biochemistry. 42. 10896-10903 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] S.Kodera, T.Okajima, H.Iwabuki, D.Kitaguchi, S.Kuroda, T.Yoshinobu, K.Tanizawa, M.Futai, H.Iwasaki: "Detection of protein-protein interactions on Siol_2/Si surfaces by spectroscopic ellipsometry."Anal. Biochem.. 321. 65-70 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Matsunami, T.Okajima, S.Hirota, H.Yamaguchi, H.Hori, S.Kuroda, K.Tanizawa: "Chemical rescue of a site-specific mutant of bacterial copper amine oxidase for gencration of the topa quinane cofactor."Biochemistry. 43. 2178-2187 (2004)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] R.Miura, C.Setoyama, Y.Nishina, K.Shiga, I.Miyahara, H.Mizutani, K.Hirotsu: "Porcine kidney D-amino acid oxidase : the three-dimensional structure and its catalytic mechanism based on the enzyme-substrate complex model."J. Mol. Catalysis B : Enzymatic. 12. 43-52 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] R.Miura: "Versatility and specificity in flavoenzymes : Control mechanisms of flavin reactivity."The Chemical Record. 1. 183-194 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Y.Nakajima, I.Miyahara, K.Hirotsu, Y.Nishina, K.Shiga, Setoyama, H.Tamaoki, R.Miura: "X-Ray crystallographic study of rat acyl-CoA oxidase II."Protein Sci.. 10, Suppl.2. 85-86 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Y.Nakajima, I.Miyahara, K.Hirotsu, Y.Nishina, K.Shiga, C.Setoyama, H.Tamaoki, R.Miura: "Crystallization and preliinary X-ray characterization of rat live acyl-CoA oxidase."Acta Crystallogr.. D57. 1680-1681 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Y.Nishina, K.Sato, R.Shi, C.Setoyama, R.Miura, K.Shiga: "On theligands in charge-transfer complexes of porcine kidney flavoenzyme D-amino acid oxiase in three redox states : A resonance Raman study."J. Biochem.. 130. 637-647 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] C.Setoyama, Y.Nishina, H.Tamaoki, H.Mizutani, I.Miyahara, K.Horitsu, K.Shhiga, R.Miura: "Effects of hydrogen bonds in association with flavin and substrate in flavoenzyme D-amino acid oxidase. The catalytic and structural roles of Gly313 and Thr 317"J. Biochem.. 131. 59-69 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Y.Nakajima, I.Miyahara, K.Hirotsu, Y.Nishina, K.Shiga, C.Setoyama, H.Tamaoki, R.Miura: "Three-deimensional structure of the flavenzyme acyl-CoA oxidase-II from rat liver, the peroxisomal counterpart of mitochondrial acyl-CoA dehydrogenase."J. Biochem.. 131. 365-374 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] A.Satoh, Y.Nakajima, I.Miyahara, K.Hirotsu, T.Tanaka, Y.Nishina, K.Shiga, H.Tamaoki, C.Setoyama, R.Miura: "Structure of the transition state analog of medifum-chain acyl-CoA dehydrogenase. Crystallographic and molecular orbital studies on the charge-transfer complex of medium-chain acyl-CoA dehydrogenase with 3-thiaoctanoyl-CoA."J. Biochem.. 134. 297-304 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Y.Nishina, K.Sato, H.Tamaoki, H., Tanaka, T., Setoyama, C., R.Miura, K.Shiga: "Molecular mechanism of the drop in the pKa of a substrate analog bound to medium-chain acyl-CoA dehydrogenase : Implications for substrate activation."J. Biochem.. 134. 835-842 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Nakajima, T.Ishida, H.Tanaka, K.Horiike: "Accurate measurement of near-micromolar oxygen concentrations in aqueous solutions based on enzymatic extradiol cleavage of 4-chlorocatechol : applications to improved low-oxygen experimental systems and quantitative assessment of back diffusion of oxygen from the atmosphere."J. Biochem.. 131. 523-531 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Ishida, A.Kita, K.Miki, M.Nozaki, K.Horiike: "Structure and reaction mechanism of catechol 2,3-dioxygenase (metapyrocatechase)."International Congress Series. 1233. 213-220 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Ishida, H.Tanaka, K.Horiike: "Quantitative structure-activity relationship for the cleaveage of C3/C4-substituted catecholsy by a prototypal extradiol catechol dioxygenases with broad substrate specificity."J. Biochem.. (in press). (2004)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Ikushiro, H.Hayashi, H.Kagamiyama: "A water-soluble homodimeric serine palmitoryltransferase from Sphingomonas paucimobilis EY2395T strain. purification, characterization, cloning, and overproduction."J. Biol. Chem.. 276. 18249-18256 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Nakayama, T.Sat.Y.Fukui, K.Yonekura-Sakakibara, H.Hayashi, Y.Tanaka, T.Kusumi, T.Nishino: "Sdepcificity analysis and mechanism of aurone synthesis actalyzed by aureusidin synthase, a polyphenol oxidase homolog responsible for flower coloration."FEBS Lett.. 499. 107-111 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Kagamiyama, H.Hayashi: "Release of enzyme strain during catalysis reduces the activation energy barrier."Chem. Rec.. 1. 385-394 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.T.Olmo, F.Sanchez-Jimenez, M.A.Medina, H.Hayashi: "Spectroscopic analysis of recombinant rat histidine decarboxylase."J. Biochem.. 132. 433-439 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Hayashi, H.Mizuguchi, I.Miyahara, Y.Nakajima, K.Hirotsu, H.Kagamiyama: "Conformational change in aspartate aminotransferase on substrate binding induces strain in te catalytic group and enhances catalysis."J. Biol. Chem.. 278. 9481-9488 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Hayashi, H.Mizuguchi, I.Miyahara, M.M.Islam, H.Ikushiro, Y.Nakiajima, K.Hirotsu, H.Kagamiyama: "Strain and catalysis in asparate aminotransferase."Biochim. Biophys. Acta. 1674. 103-109 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Ikushiro, H.Hayashi, H.Kagamiyama: "Bacterial serine plamitoyltransferase : a water-soluble homodimeric prototype of the eukaryotic enzyme."Biochim. Biophys. Acta. 1647. 116-120 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Mizuguchi, H.Hayashi, I.Miyahara, K.Hirotsu, H.Kagamiyama: "Characterization of histidinol phosphate aminotransferase from Escherichia coli."Biochim. Biophys. Acta. 1647. 321-324 (2003)

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  • [文献書誌] M.M.Islan, H.Hayashi, H.Kagamiyama: "Reation of aspartate ainotransferase with C5-dicarboxylic acids : comparison with the reaction with C4-dicarboxylic acids."J. Biochem.. 134. 277-285 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] A.Hosono, H.Mizuguchi, H.Hayashi, M.Goto, I.Miyahara, K.Hirotsu, H.Kagamiyama: "Glutamine : phenylpyruvate aminotransferase from an extremely thermophilic bacterium, Thermus themophilus HB8."J. Biochem.. 134. 843-851 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] N.Matsuda, H.Hayashi, S.Miyatake, T.Kuroiwa, H.Kagamiyama: "Instability of the apo form of aromatic L-amino acid decarboxylase in vivo and in vitro : implications of the involement of the flexible loop that covers the active site."J. Biochem.. 135. 33-42 (2004)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Ikushiro, H.Hayashi, H.Kagamiyama: "Rections of serine plamitoyltransferase with serine and molecular mechanisms of the actions of serine derivatives as inhibitors."Biochemistry. 43. 1082-1092 (2004)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Y.Nakai, N.Umeda, T.Suzuki, M.Nakai, H.Hayashi, K.Watanabe, H.Kagamiyama: "Yeast Nfs1P is inveolved in thio-modification of both mitochondrial and cytoplasmic cRNAs."J. Biol. Chem.. 279. 12363-12368 (2004)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Mizuguchi, H.Hayashi, K.Okada, I.Miyahara, K.Hirotsu, H.Kagamiyama: "Strai si more important than electrostatic interaction in controlling the pKa of the catalytic group in asparate aminotransferase."Biochemistry. 40. 353-360 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] K.Haruyama, T.Nakai, I.Miyahara, K.Hirotsu, H.Mizuguchi, H.Hayashi, H.Kagamiyama: "Structures of Escherichia coli histidinol-phosphate aminotransferase and its complexes with histidinol-phosphate and N-(5'-phosphopyridoxyl)-L-glutamate : Double substrate recognition of the enzyme."Biochemistry. 40. 4633-4644 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] K.Okada, K.Hirotsu, H.Hayashi, H.Kagamiyama: "Structures of Escherichia coli branched-chain amino acid aminotransferase adn tis complexes with 4-methylvaterate and 2-methylleucine : Induced fit and substrae recognion of the enzyme."Biochemistry. 40. 7453-7463 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Tada, C-T.Lu, Y.Nakamura, K.Wada, I.Miyahara, K.Hirotsu, Y.Katsuya, M.Sawada, M.Takao, T.Sakai, K.Nishimura: "Crystallization and preliminary X-ray analysis of a novel pectolytic enzyme polymethoxy-galactturonase AX1 fro Trichosporon penicillatum."Acta Cryst.. D57. 457-458 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Ura, T.Nakai, S.Kawaguchi, I.Miyahara, K.Hirotsu, S.Kurumitsu: "Substrate recognition mechanism of thermophilic dual-substrate enzyme."J. Biochem.. 130. 89-98 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] A.Satoh, J-H.Kim.I.Miyahara, B.Devreese, I.Vandenberghe, A.Hacisalihoglu, T.Okajima, S.Kuroda, O.Adachi, J.A.Duine, J.Van Beeumen, K.Tanizawa, K.Hirotsu: "Crystal structure of quinohemoprotein amine dehydrogenase from Pseudomanas putida"J. Biol. Chem.. 277. 2830-2834 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Goto, Y.Nakajima, K.Hirotsu: "Crystal structure of argininosuccinate synthetase from Thermus thermophilus HB8. Structural basis for the catalytic action."H. Biol. Chem.. 277. 15890-15896 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] R.Omi, H.Mizuguchi, M.Goto, I.Miyahara, H.Hayashi, H.Kagamiyama, K.Hirotsu: "Structure of imidazole glycerol phosphate synthase from Thermus thermophilus HB8 : Open-closed conformation change and annomia tunneling"J. Biochem.. 132. 759-765 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Goto, Y.Agari, R.Omi, I.Miyahara, K.Hirotsu: "Expression, purification and preliminary X-ray characterization of N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase from Thermus thermophilus HB8. Acta Crystallogr."D Biol. Crystallogr.. 59. 356-358 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Goto, R.Omi, J.Hoseki, N.Nakagawa, I.Miyahara, K Hirotsu: "Expression, purification and preliminary Xray characterization of CTP synthetase from Thermus thermophilus HB8."Acta Crystallogr D Biol Crystallogr.. 59. 551-553 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] A.Satoh, O.Adachi, K.Tanizawa, K.Hirotsu: "The active site structure of quinohemoprotein amine dehydrogenase inhibited by p-nitrophenyl-hydrazine."Biochimica et Biophysica Acta. 1647. 272-277 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Goto I.Miyahara H.Hayashi H.Kagamiyama, H.Hirotsu: "Crystal structures of branched-chai amino acid aminotransferase complexed with glutamate and glutarate : true reaction intermediate and double substrae recognition of the enzyme."Biochemistry. 42. 3725-3733 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Goto, R.Omi, I.Miyahara, M.Sughara, K.Hitosu: "Structures of argininosuccinate synthetase in enzyme-ATP-substrates and enzyme-AMP-product forms : Stereochemistry of the catalytic reaction."J. Biol. Chem.. 278. 22964-22971 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] R.Omi, M.Goto, I.Miyahara, H.Mizuguchi, H.Hayashi, H.Kagamiyama, K.Hirotsu: "Crystal Structures of threonine synthease from Thermus thermophilus HB8 : Conformation change, substrate recognition, and mechan."J. Biol. Chem.. 278. 46035-46045 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] R.Omi, M.Goto, N.Nakagawa, I.Miyahara, K.Hirotsu: "Expression, puritication and pretiminary X-ray characterization of histidinol phosphate phosphatase. Acta Crystallogr."D Biol. Crystallogr.. 60. 574-576 (2004)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Goto, R.Omi, I.Miyahara A.Hosono, H.Mizuguchi, H.Hayashi, H.Kagamiyama, K.Hirotsu: "Crystal strutures of glutamine : phenylphruvate aminotransferase from Thermus thermophilus HB8 : induced fit and substrate recognition."J. Biol. Chem.. 279. 16518-16525 (2004)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Goto, R.Omi, N.Nakagaw, I.Miyahara, K.Hirotsu: "Crystal structures of CTP synthetase eveal ATP, UTP, and glutamine binding sites."Structure. 12(in press). (2004)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Sato, N.Shibata, Y.Morimoto, Y.Takayama, K.Ozawa, H.Akutsu, Y.Higuchi, N.Yasuoka: "X-ray induced reduction of the crystal of high-moleucular weight cytochrome c revealed by miroscopectrophotometry."J. Synchrotron Rad.. 11. 113-116 (2004)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] A.Watanabe, T.Yoshimura, Y.H.Lim.Y.Kurokawa, K.Soda, N.Esaki: "Stereochemistry of hydrogen abstracton from pyridoxamine phosphate catalyzed by alanine racemase of Bacillus stearothemophilus."J. Mol. Catal. B : Enzymatic. 12. 145-150 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Uo, T.Ueda, T.Nishiyama, T.Yoshimura, N.Esaki: "Purification and characterization of alanine racemase from hepatopancreas of black-tiger prawn, Penaeus monodon"J. Mol. Catal. B : Enzymatic. 12. 137-144 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Uo, T.Yoshimura, N.Tanaka, K.Takegawa, N.Esai: "Functional characterizaton of alanine racemase from Schizosacharomyces pombe : a eucaryotic counterpart to bacterial alanine racemase."J. Bacteriol.. 183. 226-2233 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Suzuki, T.Nakayama, T.Kurihara, T.Nishino, N.Esaki: "Cold-active lipolytic activity of psychrotrophic Acinetobacter sp. strain no. 6."J. Biosci. Bioeng.. 92. 144-148 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] K.Soda, T.Yoshimura, N.Bsaki: "Stereospecificity for the hydrogen transfer of pyridoxal enzyme reactions."The Chemical Record. 1. 373-384 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Kashiwa, M.Ike, H.Mihara, N.Esaki, M.Fujita: "Removal of soluble selenium by a selenate-reducing bacterium Bacillus sp."SF-1. BioFactors. 14. 261-265 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Mihara, S.Kato, T.Kurihara, T.Yoshimura, N.Esaki, G.M.Lacourciere, T.C.Stadtman: "Role of cysteine desulfurase in the biosynthesis of formate dehydrogenase H containing Mo, molybdopterin, selenocysteine, and Fe_4S_4 cluster."Biomed. Res. Trace. Elem.. 12. 261-262 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] A.Lewandowicz, D.Sicinska, J.Rudzinski, S.Ichiyama, T.Kurihara, N.Esaki, P.Paneth: "Chlorine kinetic isotope effect on fluoroacetate dehalogenase reaction"J. Am. Chem. Soc.. 123. 9192-9193 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] K.Yokoigawa, Y.Okubo, H.Kawai, N.Esaki, K.Soda: "Structure and function of psychrophilic alanine racemas"J. Mol. Catal. B : Enzymatic. 12. 27-35 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] A.Watanabe, T.Yoshimura, B.Mikami, H.Hayashi, H.Kagamiyama, N.Esaki: "Reaction mechanism of alanine racemase from Bacillus stearothermophilus : X-ray crystallographic studies of the enzyme bound with N-(5'-phosphopyridoxyl)-alanine"J. Biol. Chem.. 277. 19166-19172 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Uo, T.Yoshimura, T.Nishiyama, N.Esaki: "Gene cloning, purification and characterization of 2,3-diaminopropionate ammonia-lyase from Escherichia coli."Biosci. Biotechnol. Biochem.. 66. 2639-2644 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] U.Tokumoto, S.Nomura, Y.Minami, H.Mihara, S.Kato, T.Kurihara, N.Esaki, H.Kanazawa, H.Matsubara, Y.Takahashi: "Network of protein-protein interactions among iron-sulfur cluster assembly proteins in Eschrichia coli."J. Biochem.. 131. 713-719 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Suzuki, T.Nakayama, T.Kurihara, T.Nishino, N.Esaki: "A cold-active esterase with a substrate preference for vinyl esters from a psychrotroph, Acinetobacter sp. strain no.6 : gene cloning, purification, and characterization"J. Mol. Catal. B : Enzymatic. 16. 255-263 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Suzuki, T.Nakayama, T.Kurihara, T.Nishino, N.Esaki: "Primary structure and catalytic properties of a cold-active esterase from a psychrotroph, Acinetobacter sp. strain no.6 isolate from Siberian soil"Biosci. Biotechnol. Biochem.. 66. 1682-1690 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] S.Kato, H.Mihara, T.Kurihara, Y.Takahashi, U.Tokumoto, T.Yoshimura, N.Esaki: "Cys328 of IscS and Cys63 of IscU are the sites of disulfide bridge formation in a covalently-bound IscU/IscS complex : Implications for the mechanism of iron-sulfur cluster assembly"Proc. Natl. Acad. Sci.. 99. 5948-5952 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] E.Pilon-Smits, G.Garifullina, S.bdel-Ghany, S.Kato, H.Mihara, K.Hale, J.Burkhead, N.Esaki, T.Kurihara, M.Pilon: "Characterization of a NifS-like chloroplast protein from Arabidopsis. Implications for its role in sulfur and selenium metabolism"Plant Physiol.. 130. 1309-1318 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Bae, S.Hong, S.Lee, M.Kwak, N.Esaki, M.Sung: "Application of a thermostable glutamate racemase from Bacillus sp. SK-1 for the production of D-phenylalanine in a multi-enzyme system"J Mol Catal B : Enzymatic. 17. 223-233 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] S.Ichiyama, T.Kurihara, M.Miyagi, A.Galkin, S.Tsunasawa, H.Kawasaki, N.Esaki: "Catalysis-linked inactivation fluoroacetate dehalogenase by ammonia : A novel approach to the active-site environment"J. Biochem.. 131. 671-677 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.A.Muranova, S.N.Ruzheinikov, S.E.Sedelnikova, P.J.Baker, A.Pasquo, A.Galkin, N.Esaki, T.Ohshima, K.Soda, D.W.Rice: "Crystallization and preliminary X-ray analysis of substrate compleses of leucine dehydrogenase from Thermoactinomyces intermedius"Acta Cryst.. D58. 1059-1062 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Mihara, N.Esaki: "Bacterial cysteine desulfurases : their function and mechanisms"Appl. Microbiol. Biotechnol. 60. 12-23 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Mihara, N.Esaki: "Selenocysteine lyase from mouse liver"Methods in Enzymology. 347. 198-203 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Mihara, S.Kato, G.M.Lacourciere, T.C.Standman, R.A.J.D.Kennedy, T.Kurihara, U.Tokumoto, Y.Takahashi, N.Esaki: "The iscS gene is essential for the biosynthesis of 2-selenouridine in tRNA and the selenocysteine containing fromate dehydrogenase"H. Proc. Natl. Acad. Sci.. 99. 6679-6683 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H.Mihara, T.Fujii, S.Kato, T.Kurihara, Y.Hata, N.Esaki: "Structure of external aldimine of Escherichia coli CsdB, an IscS/NifS homolog implications for its specificity toward selenocysteine"J. Biochem.. 131. 679-685 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] K.Yoshimune, T.Yoshimura, T.Nakayama, T.Nishino, N.Esaki: "Hsc62, Hsc56, and GrpE, the third Hsp70 chaperone system of E. coli."Biochem. Biophys. Res. Commun.. 293. 1389-1395 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Kwak, H.Mihara, N.Esaki: "Protein interaction between selenocysteine lyase and MUP-I"Biomedical Research on Trace Elements. 13. 238-239 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] E.Kuwana, S.Kurokawa, H.Mihara, T.Kurihara, T.Yoshimura, N.Esaki: "Effects of selenium deficiency on the expression of selenoprotein mRNAs in mouse brain"BiOMEDICAL RESEARCH ON TRACE ELEMENTS. 14. 293-296 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Y.Wei, T.Kurihara, T.Suzuki, N.Esaki: "A novel esterase from a psychrotrophic bacterium, Acinetobacter sp. strain no. 6, that belongs of the amidase signature family"J. Mol. Catal. B : Enzymatic. 23. 357-365 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Kurihara, T.Yamauchi, S.Ichiyama, H.Takahata, N.Esaki: "Purification, characterization, and gene cloning of a novel fluoroacetate dehalogenase from Burkholderia sp."FA1. J. Mol. Catal. B : Enzymatic. 23. 347-355 (2003)

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公開日: 2005-04-19  

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