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2004 年度 研究成果報告書概要

絶対光独立栄養型ラン藻シネココッカスにおける転写制御ネットワークの解明

研究課題

研究課題/領域番号 13206027
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関名古屋大学

研究代表者

杉田 護  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 教授 (70154474)

研究分担者 小俣 達男  名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (50175270)
岩崎 秀雄  早稲田大学, 理工学術院・電気・情報生命工学科, 助手 (00324393)
研究期間 (年度) 2001 – 2004
キーワードラン藻 / 転写制御ネットワーク / 二成分制御系 / 窒素代謝 / DNAチップ / 光独立栄養 / 概日リズム / 時計遺伝子
研究概要

本研究は、二成分制御系を介した転写プロファイルの解析、無機物質同化系を制御する転写因子の同定と機能解析、概日時計遺伝子を介したゲノムワイドのグローバルな転写制御の分子機構の解析を行い、ラン藻(シアノバクテリア)に特有の転写制御ネットワークを明らかにすることを目的とする。17年度までに得られた主な成果は以下の通りである。
(1)絶対光独立栄養型ラン藻シネココッカスSynechococcus PCC 6301株の全ゲノム配列(2,696,255bp)を決定した。この中に、2つのrRNA遺伝子オペロン(rrnAとrrnB)、45のtRNA遺伝子、4つの低分子RNA遺伝子、およびを2525個のタンパク質遺伝子をアノテートした。二成分制御系遺伝子を37個同定した。全タンパク質遺伝子の10%の遺伝子は他の生物種のゲノムに存在しないことを明らかにした。さらに、シネココッカスSynechococcus 6301株のゲノムの全遺伝子および遺伝子間領域をカバーするオリゴDNAチップを作製した。
(2)他のラン藻種にはなく、Synechococcus 7942株/6301株にのみ存在する遺伝子群の中に、潜在的な硝酸輸送活性をもつ新規トランスポータの遺伝子(syc1147)とその活性を制御する二成分シグナル伝達系の遺伝子群(syc2277-syc2278)を同定した。
(3)時計関係の研究での最大の研究成果として,連続暗期中で転写・翻訳活性が極端に低下し,kai遺伝子の転写翻訳が完全に停止してもKaiC蛋白質のリン酸化振動が完全に持続することを発見した。さらに、KaiABC蛋白質の試験管内リン酸化振動発生を世界で初めて明らかにした。これらの研究は,シアノバクテリアに限らず哺乳類,植物を含む生物時計の分子機構の常識を一変させ,大きな反響を呼んだ。

  • 研究成果

    (10件)

すべて 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 (9件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Latent nitrate transport activity of a novel sulfate permease-like protein of the cyanobacterium Synechococcus elongatus.2006

    • 著者名/発表者名
      Maeda, S., Sugita, C., Sugita.M., Omata, T.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 281

      ページ: 5869-5876

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Latent nitrate transport activity of a novel sulfate permease-like protein of the cyanobacterium Synechococcus elongatus.2006

    • 著者名/発表者名
      Maeda, S., Sugita, C., Sugita, M., Omata, T.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 281

      ページ: 5869-5876

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] No transcription-translation feedback in circadian rhythm of KaiC phosphorylation.2005

    • 著者名/発表者名
      Tomita, J., Nakajima, M, Kondo, T, Iwasaki, H.
    • 雑誌名

      Science 307

      ページ: 251-254

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Reconstitution of circadian oscillation of cyanobacterial KaiC phosphorylation in vitro.2005

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, M., Imai, K., Ito, H., Nishiwaki, T., Murayama, Y., Iwasaki, H., Oyama, T., Kondo, T.
    • 雑誌名

      Science 308

      ページ: 414-415

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Reconstitution of circadian oscillation of cyanobacterial KaiC phosphorylation in vitro.2005

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, M., Imai, K., Ito, H., Nishiwaki, T..Murayama, Y., Iwasaki, H., Oyama, T., Kondo, T.
    • 雑誌名

      Science 308

      ページ: 415

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Plastid transformation reveals that moss tRNA^<Arg>-CCG is not essential for plastid function.2004

    • 著者名/発表者名
      Sugiura, C., Sugita, M.
    • 雑誌名

      The Plant Journal 40

      ページ: 314-321

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Chloroplast phylogeny indicates that bryophytes are monophyletic.2004

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, T., Wolf, P.G., Kugita, M., Sinclair, R.B., Sugita, M., et al.
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution 21

      ページ: 1813-1819

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Roles of CmpR, a LysR family transcriptional regulator, in acclimation of the cyanobacterium Synechococcus sp. strain PCC 7942 to low-CO2 and high-light conditions.2004

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, Y., Yamaguchi, O., Omata, T.
    • 雑誌名

      Molecular Microbiology 52

      ページ: 837-845

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Roles of CmpR, a LysR family transcriptional regulator, in acclimation of the cyanobacterium Synechococcus sp. strain PCC 7942 to low-CO2 and high-light conditions.2004

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, Y., Yamaguchi, 0., Omata, T.
    • 雑誌名

      Molecular Microbiology 52

      ページ: 837-845

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [図書] シアノバクテリア(ゲノムミクス・プロテオミクスの新展開)(今中忠行監修)2004

    • 著者名/発表者名
      杉田 護, 杉田千恵子
    • 総ページ数
      1158
    • 出版者
      エヌ・ティ・エス出版
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より

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公開日: 2008-05-27  

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