遺伝子発現プロファイル解析による肝細胞癌診断法の開発

2002 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 13218019
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 油谷 浩幸 東京大学, 国際・産学協同研究センター, 教授 (10202657)
• キーワード: マイクロアレイ / 発現プロファイル / 肝細胞癌

研究概要

網羅的遺伝子発現プロファイルパターンと肝細胞癌の臨床的あるいは病理学的診断との相関を解析することにより、肝細胞癌の診断アルゴリズムの開発を目指し、さらに肝癌特異的な発現を示す遺伝子の機能解析を行い、肝発がんにおける役割を検討した。最大4万個の遺伝子について肝細胞癌組織の非癌部と癌部組織においての遺伝子発現プロファイリング解析をおこない、従来の少数の腫瘍マーカーによる診断ではなく、多数の遣伝子の発現プロファイルパターンを用いて癌と健常部との識別、予後因子の評価を行うために階層的クラスタリングや主因子分析、SVM法などの新しい診断アルゴリズムの開発を試みた。「結節内結節」型の肝細胞癌では脱分化によるがん細胞の悪性化が認められるが、高分化型から中分化型への進展に関与すると思われる遺伝子群を抽出し、RT-PCRによる検証も行った(緑川、2002)。肝細胞癌に高発現する遺伝子GPC3については増殖因子のシグナル伝達を調節する知見が得られた(緑川、2003)。また、肝細胞癌では染色体欠失や増幅などのゲノム異常を解明すべく、遺伝子発現レベルを染色体領域ごとに評価、表示するインターフェースを作成した(加納、2003)。研究成果の実用化として、肝細胞癌に高発現する遺伝子の発現蛋白に対するモノクロナル抗体パネルを用いての血清診断システムの開発に着手し、2種類のタンパクに対して血清測定系を樹立した。

研究成果

• [文献書誌] Kano M, Nishimura K, Ishikawa S, Tsutsumi s, Hirota K, Hirose M, Aburatani H.: "Expression Imbalance Map : A New Visualization Method for Detection of mRNA Expression Imbalance Regions"Physiol Genomics.. Jan 7(epub ahead of print. (2003)
• [文献書誌] Midorikawa Y, Ishikawa S, Iwanari H, Imamura T, Sakamoto H, Miyazono K, Kodama T, Makuuchi M, Aburatani H.: "Glypican-3, overexpressed in hepatocellular carcinoma, modulates FGF2 and BMP-7 signaling"Int J Cancer. 103(4). 455-465 (2003)
• [文献書誌] Aburatani H.: "Understanding cancer through gene expression profiling.(review)"International Congress Series. 1246:. 261-270 (2002)
• [文献書誌] Midorikawa Y, Tsutsumi S, Taniguchi H, Ishii M, Kobune Y, Kodama T, Makuuchi M, Aburatani H.: "Identification of genes associated with dedifferentiation of hepatocellular carcinoma with expression profiling analysis"Jpn J Cancer Res.. 93(6):. 636-643 (2002)
• [文献書誌] Hippo Y, Taniguchi H, Tsutsumi S, Machida N, Chong JM, Fukayama M, Kodama T, Aburatani H.: "Global gene expression analysis of gastric cancer by oligonucleotide microarrays"Cancer Research. 62(1):. 233-240 (2002)