アレル特異的遺伝子発現の定量的比較による遺伝性腫瘍の新規診断法の確立に関する研究

2001 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 13218145
• 研究機関: 国立がんセンター
• 研究代表者: 村上 善則 国立がんセンター研究所, 腫瘍ゲノム解析・情報研究部, 室長 (30182108)
• キーワード: 遺伝子診断 / 遺伝子発現 / 網膜芽細胞腫 / 遺伝性非ポリポーシス大腸がん / がん抑制遺伝子 / 第11染色体 / 肺非小細胞がん

研究概要

1.遺伝子の発現の欠如、低下によるがん抑制遺伝子、DNA修復酵素遺伝子の不活化を検出し、診断へ応用する目的で、遺伝子コード領域の多型(cSNP)をSSCP法で分離し定量することにより、各アレル当りの遺伝子発現量の高度定量的検出法(RNA Difference Plot : RDP法)を確率した。そこで、網膜芽細胞腫、並びに遺伝性非ポリポーシス大腸がん(HNPCC)の保因者を対象として、RDP法により、従来、検出不可能であったRB、hMSH2 mRNAの微小ながら有意な減少を定量的に検出し、その診断に役立てた。また変異アレルの相対的発現量が、野生型アレルとの組みあわせ、特に野生型アレルのハブロタイプによって規定される可能性を示した。
2.がん細胞に様々な方法で正常DNA断片を導入・発現し、腫瘍原性の抑制を指標とした機能的相補法により、新規がん抑制遺伝子TSLC1を同定した。TSLC1は第11染色体長腕q23領域に存在し、肺非小細胞がん(NSCLC)由来の培養細胞の半数以上で発現の欠如、または著明低下を示した。そしてNSCLCの約40%で、一方のアレルの欠失と残存アレルのプロモーターメチル化による2ヒットによる不活化を示した。TSLC1は、肺以外でも、血球を除く検索したすべての臓器で発現することから、他のがんにおける異常の有無を検討した。そして、プロモーター領域のメチル化は、原発性肝細胞がん、膵がん、前立腺がん、小細胞肺がん(SCLC)でも、30-40%程度に認められることを明らかにした。

研究成果

• [文献書誌] Kuramochi, M., Murakami, Y. et al.: "TSLC1 is a tumor suppressor gene in human non-small cell lung cancer"Nature Genetics. 27. 427-430 (2001)
• [文献書誌] Fukuhara, H., Murakami, Y. et al.: "Isolation of the TSLL1 and TSLL2 gene, members of the tumor suppressor TSLC1 gene family encoding transmembrane proteins"Oncogene. 20. 5401-5407 (2001)
• [文献書誌] Kanbe, T., Murakami, Y. et al.: "Four single-nucleotide polymorphisms in the human BUB1 gene"Journal of Human Genetics. 46. 150-151 (2001)
• [文献書誌] Fukuhara, H., Murakami, Y. et al.: "Functional evidence for the presence of tumor suppressor gene on chromosome 10p15 in human prostate cancers"Oncogene. 20. 314-319 (2001)
• [文献書誌] Nishimoto, A., Murakami, Y., Oshimura, M. et al.: "Evidence for a telomerase repressor gene on human chromosome 10p15.1"Oncogene. 20. 828-835 (2001)