Grid技術を適応した新しい研究手法とデータ管理技術の研究

2001 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 13224059
• 研究種目: 特定領域研究(C)
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 下條 真司 大阪大学, サイバーメディアセンター, 教授 (00187478)
• 研究分担者: 森 博太郎 大阪大学, 超高圧電子顕微鏡センター, 教授 (10024366) ; 西原 功修 大阪大学, レーザー核融合研究センター, 教授 (40107131) ; 村田 正幸 大阪大学, サイバーメディアセンター, 教授 (80200301) ; 塚本 昌彦 大阪大学, 大学院・工学研究科, 助教授 (60273588)
• キーワード: Grid / 医用データ解析 / 大規模シュミレーション / スーパーコンピュータ / 可視化システム / トラヒック制御技術 / 電子顕微鏡遠隔操作システム / データ管理基盤技術

研究概要

村田は、インターネットのトラヒック特性を計測し、その応用として、インターネットにおけるネットワークディメンジョニングに関する研究を行った。
西原は、今年度は大規模シミュレーション環境を実現化するための環境整備を主として、2台のスーパーコンピュータをGbEで接続し、MPIを用いて並列処理を行い、大規模シミュレーション環境を整備した。また、Globusを用いて遠隔地の2台のスーパーコンピュータ上で大規模シミュレーションを実施し、通信負荷について定量的評価を行った。
森は、高速ネットワークを利用する超高圧電子顕微鏡用遠隔観察システムを構築し、遠隔地からも本体操作室に近い環境で電子顕微鏡の操作・観察を行えることを可能にし、tele-scienceを実現した。具体的には、北大から、SINETを用いて阪大の超高圧電子顕微鏡を遠隔操作し照射効果に関する応用実験を行うことに成功した。このことは同様のネットワーク環境にある国内の各大学、研究機関からも遠隔観察が可能であることを意味し、今後の電子顕微鏡の相互利用など多様な利用形態が可能になったことを示している。
塚本は、今年度はGrid技術を用いた部分空間統合モデルの検証ならびに要素技術の集積のために,プロトタイプシステムを開発し、そのシステムを用いた実験を行った。
下條は、グリッドをMEG(脳磁計)データ解析へ応用し、グリッドの医用応用への有効性を示すとともに、システムの完成度を高めるための問題分析を行った。また、これらの研究成果をもとに、解決しなければならない問題点を明確化するとともに、次年度の研究推進に対する総括を行った。

研究成果

• [文献書誌] K.Yoshida, H.Mori, S.Shimojo, Y.Kadobayashi, T.Akiyama, M.H.Ellisman: "Design of a remote operation system for trans-pacific microscopy via International adovanced networks"Electron Microscopy. 51(Full-legth paper). (2002)
• [文献書誌] 柴山環樹, 高橋平七郎, 吉田清和, 森博太郎: "超高圧電子顕微鏡の遠隔操作・観察システムを用いた応用実験"Electrn Microscopy. Vol36. 241 (2001)
• [文献書誌] Kazumine Matoda, Shingo Ata, Masayuki Murata: "Inproving bandwidth estimation for internet links by statistical methods"IEICE Transactions on Communications. Vol.E84-B. 1521-1531 (2001)
• [文献書誌] Kazumine Matoda, Shingo Ata, Masayuki Murata: "Capacity dimensioning based on traffic measurement in the Internet"IEEE GLOBECOM 2001. 2532-2536 (2001)
• [文献書誌] Mizuno-Matsumoto, Y., Date, S., Kashima, T., Hara, K., Shinosaki, K., Tamura S., Shimojyo, S.: "Development of high performance computing system for MEG data using independent component analysis on Globus"The International Conference on Bioinformatics 2002. (2002)
• [文献書誌] S.Date, Y.Mizuno-Matsumoto, Y.Kadobayashi, S.Shimojo: "An MEG data analysis system using Grid technology"Journal of Information Processing Society of Japan. Vol.42 No.12. 2952-2962 (2001)