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2003 年度 研究成果報告書概要

ATP合成酵素を構成する2つのナノモーターの回転共役機構

研究課題

研究課題/領域番号 13308036
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 機能生物化学
研究機関東京工業大学

研究代表者

吉田 賢右  東京工業大学, 資源化学研究所, 教授 (90049073)

研究期間 (年度) 2001 – 2003
キーワードATP合成酵素 / 回転分子モーター / F_1-ATPase / F_0チャネル
研究概要

F_1-ATPaseの調節サブユニットεにATPが直接結合することを示した.また,このεサブユニットはATP合成酵素中で膜内外の水素イオンの電気化学ポテンシャル差に応じてその形態を変化させることも分かった.
F_1-ATPaseの反応機構としては触媒部位を持つβサブユニットにトリプトファン残基を変異導入することにより,従来から謎であった見かけの協同性の原因がαサブユニットの非触媒ATP結合部位に起因することを示し,また,ATPase活性が最大になるのは三つのβサブユニットの触媒部位にAT(D)Pが結合するATPの濃度域であることが分かった.そして,回転のうちの80°のサブステップはATPの加水分解が起こらなくても,結合だけで駆動されること,次に続く40°のサブステップが起こるためにはATPの加水分解が必要なことが分かった.また,蛍光星ATPアナログであるCy3-ATPを用いることにより,三つのβサブユニットのどれにATPが結合したかを見分けることができるようになり,Cy3-ATPは一度結合すると240°回転するまで結合したままでいることがわかった.この結果は上のトリプトファン変異体を用いた実験結果と符合するものである.さらに,一分子のCy3-ATPによる反応が,少なくとも二つの120°ステップに対して影響を与えていること,等が分かった.
さらにF_1-ATPaseに磁気ビーズを結合し,外部磁場を操作して強制的に回転させることによりATPをADPとPiから持続的に合成できることを示した.

  • 研究成果

    (46件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (46件)

  • [文献書誌] Noji H, Yoshida M.: "The rotary machine in the cell ; ATP Synthase."J Biol Chem.. 276. 1665-1668 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Tsunoda, S.P., Ageller, R., Yoshida, M., Capaldi, R.A.: "Rotation of the c subunit oligomer in fully functional F_1F_0"Proc Natl Acad Sci USA.. 98. 898-902 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Hara, K.Y., Kato-Yamada, Y., Kikuchi, Y., Hisabori, T., Yoshida M.: "The role of the beta-DELSEED motif of F_1-ATPase."J.Biol.Chem.. 276. 23969-23973 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Tsunoda, S.P., Rodgers, A.J.W., Ageller R, Wilce, M.C.J., Yoshida, M., Capaldi, R.A.: "Conformational changes of the ε subunit in the bacterial F_1F_0 ATP synthase provide a ratchet action to regulate this rotary motor enzyme."Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 98. 6560-6564 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Yasuda, R., Noji, H., Yoshida, M., Kinosita, K., Itoh, H.: "Resolution of distinct substeps by submillisecond kinetic analysis of F_1-ATPase"Nature. 410. 898-904 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Ariga, T., Masaike, T., Noji, H., Yoshida, M.: "Stepping rotation of F_1-ATPase with one, two, or three altered catalytic sites that bind ATP only slowly;"J Biol Chem,. 277. 24870-24874 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Suzuki, T., Ueno, H., Mitome, N., Suzuki, J., Yoshida, M.: "F_0 of ATP synthase is a rotary proton channel, Obligatory coupling of proton translocation with rotation of c-subunit ring;"J Biol Chem. 277. 13281-13285 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Masaike, T., Muneyuki, E., Noji, H., Kinosita, K., Jr.Yoshida, M.: "F_1-ATPase changes its conformations upon phosphate release"J Biol Chem. 277. 21643-21649 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Imamura, H., Nakano, M., Noji, H., Muneyuki, E., Ohkuma, S., Yoshida, M.: "Evidence for rotation of V_1-ATPase"Proc Natl Acad Sci USA. 100. 2312-2315 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Yokoyama, K., Nakano, M., Imamura, H., Yoshida, M., Tamakoshi, M.: "Subunit Arrangement in V-ATPase from Thermus thermophilus"J.Biol.Chem. 278. 24255-24258 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Bald D, Noji H, Yosbida M, Hirono-Hara Y, Hisabori T.: "Redox regulation of the rotation of F_1-ATP synthase."J Biol Chem.. 276. 39505-39507 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Yoshida, M., Muneyuki, E., Hisabori, T.: "ATP synthase --- a marvelous rotary engine of the cell."Nature Review Mol.Cell Biol.. 2. 669-677 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Hirono-Hara Y, Noji H, Nishiura M, Muneyuki E, Hara KY, Yasuda R, Kinosita K, Jr.Yoshida M.: "Pause and rotation of F_1-ATPase during catalysis."Proc Natl Acad Sci USA.. 98. 13649-13654 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Tozawa K, Yagi H, Hisamatsu K, Ozawa K, Yashida M, Akutsu H.: "Functions and ATP-binding responses of the twelve histidine residues in the TF_1-ATPase beta subunit."J Biochem.. 130. 527-533 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Mitome N, Ono S, Suzuki T, Shimabukuro K, Muneyuki E, Yashida M.: "The presence of phosphate at a catalytic site suppresses the formation of the MgADP-inhibited form of F_1-ATPase."Eur J Biochem.. 269. 53-60 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Kato-Yamada, Y., Yoshida, M.: "Isolated epsilon Subunit of Thermophilic F_1-ATPase Binds ATP"J.Biol.Chem. 278. 36013-36016 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Suzuki, T., Murakami, T., Iino, R., Suzuki, J., Ono, S., Shirakihara, Y., Yoshida M.: "F_0F_1-ATPase/synthase is geared to the synthesis mode by conformational rearrangement of subunit in response to proton motive force and ADP/ATP balance"J.Biol.Chem.. 278. 46840-46846 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Ono S, Hara KY, Hirao J, Matsui T, Noji H, Yoshida M, Muneyuki E.: "Origin of apparent negative cooperativity of F_1-ATPase."Biochim Biophys Acta. 1607. 35-44 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Shimabukuro, K., Yasuda, Y., Muneyuki, E., Hara, K.Y., Kinosita, K.Jr, Yoshida, M.: "Catalysis and rotation of F_1 motor ; cleavage of ATP at the catalytic site occurs in 1 ms before 40 degree substep rotation."Proc Natl Acad Sci USA. 100. 14731-14736 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Itoh H, Takahashi A, Adachi K, Noji H, Yasuda R, Yashida M, Kinosita K.: "Mechanically driven ATP synthesis by F_1-ATPase."Nature.. 427. 465-468 (2004)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Nishizaka T, Oiwa K, Noji H, Kimura S, Muneyuki E, Yoshida M, Kinosita K Jr.: "Chemomechanical coupling in F_1-ATPase revealed by simultaneous observation of nucleotide kinetics and rotation."Nat Struct Mol Biol.. 11. 142-148 (2004)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Noji H, Bald D, Yasuda R, Itoh H, Yoshida M, Kinosita K Jr.: "Purine but not pyrimidine nucleotides support rotation of F_1-ATPase."J Biol Chem.. 276. 25480-25486 (2001)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 宗行 英朗, 吉田 賢右: "シリーズ・ニューバイオフィジックスII-10 生物物理学とはなにか 第1章7.エネルギー変換:ATP合成酵素(曽我部正博, 郷信広編)"共立出版. 13 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 宗行英朗, 吉田賢右: "新ミトコンドリア学 第一章1・3エネルギー転換系と分子モーター(内海耕慥, 井上正康監修)"共立出版. 8 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Noji H, Yoshida M.: "The rotary machine in the cell ; ATP Synthase."J Biol Chem.. 276. 1665-1668 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Tsunoda, S.P., Ageller, R., Yashida, M., Capaldi, R.A.: "Rotation of the c subunit oligomer in fully functional F_1F_0 ATP synthase."Proc Natl Acad Sci U S A.. 98. 898-902 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Hara, K.Y., Kato-Yamada, Y., Kikuchi, Y., Hisabori, T., Yoshida M.: "The role of of the beta-DELSEED motif of F_1-ATPase."J. Biol. Chem.. 276. 23969-23973 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Tsunoda, S.P., Rodgers, A.J.W., Ageller, R., Wilce, M.C.J., Yoshida, M., Capaldi, R A.: "Large conformational changes of the ε subunit in the bacterial F_1F_0 ATP synthase provide a ratchet action to regulate this rotary motor enzyme."Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98. 6560-6564 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Yasuda, R., Noji, H., Yoshida, M., Kinosita, K., Itoh, H.: "Resolution of distinct substeps by submillisecond kinetic 'analysis of F_1-ATPase"Nature. 410. 898-904 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Noji H, Bald.D, Yasuda R, Itoh H, Yoshida M, Kinosita K Jr.: "Purine but not pyrimidine nucleotides support rotation of F_1-ATPase."J Biol Chem.. 276. 25480-25486 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Bald D, Noji H, Yoshida M, Hirono-Hara Y, Hisabori T.: "Redox regulation of the rotation of F_1-ATP synthase."J Biol Chem.. 276. 39505-39507 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Yoshida, M., Muneyuki, E., Hisabori, T.: "ATP synthase--a marvelous rotary engine of the cell."Nature Review Mol. Cell Biol.. 2. 669-677 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Hirono-Hara Y, Noji H, Nishiura M, Muneyuki E, Hara KY, Yasuda R, Kinosita K Jr, Yoshida M.: "Pause and rotation of F_1-ATPase during catalysis."Proc Natl Acad Sci U S A.. 98. 13649-13654 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Tozawa K, Yagi H, Hisamatsu K, Ozawa K, Yoshida M, Akutsu H.: "Functions and ATP -binding responses of the twelve histidine residues in the TF_1-ATPase beta subunit."J Biochem.. 130. 527-533 (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Mitome N, Ono S, Suzuki T, Shimabukuro K, Muneyuki E, Yoshida M.: "The presence of phosphate at a catalytic site suppresses the formation of the MgADP-inhibited form of F_1-ATPase."Eur J Biochem.. 269. 53-60 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Ariga, T., Masaike, T., Noji, H., Yoshida, M.: "Stepping rotation of F_1-ATPase with one, two, or three altered catalytic sites that bind ATP only slowly;"J Biol Chem. 277. 24870-24874 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Suzuki, T., Ueno, H,.Mitome, N., Suzuki, J, Yoshida, M.: "F_0 of ATP synthase is a rotary proton channel. Obligatory coupling of proton translocation with rotation of csubunit ring;"J Biol Chem. 277. 13281-13285 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Imamura, H., Nakano, M., Noji, H., Muneyuki, E,.Ohkuma, S., Yoshida, M., Yokoyama.K.: "Evidence for rotation of V_1-ATPase"Proc Natl Acad Sci U S A. 100. 2312-2315 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Yokoyama, K., Nakano, M., Imamura, H., Yoshida, M., Tamakoshi, M.: "Rotation of the Proteolipid Ring in the V-ATPase"J. Biol. Chem.. 278. 24255-24258 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Yokoyama, K., Nagata, K., Imamura, H., Ohkuma, H., Yoshida, M., Tamakoshi, M.: "Subunit Arrangement in V-ATPase from Therm us thermophilus"J. Biol. Chem.. 278. 42686-42691 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Kato-Yamada, Y., Yoshida, M.: "Isolated epsilon Subunit of Thermophilic F_1-ATPase Binds ATP"J. Biol. Chem.. 278. 36013-36016 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Suzuki, T., Murakami, T., Iino, R., Suzuki, J., Ono, S., Shirakihara, Y., Yoshida, M.: "F_0F_1-ATPase/synthase is geared to the synthesis mode by conformational rearrangement of subunit in response to proton motive force and ADP/ATP balance"J. Biol. Chem.. 278. 46840-46846 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Ono S, Hara KY, Hirao J, Matsui T, Noji H, Yoshida M, Muneyuki E.: "Origin of apparent negative cooperativity of F_1-ATPase."Biochim Biophys Acta.. 1607. 35-44 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Shimabukuro, K., Yasuda, Y., Muneyuki, E,.Hara, K.Y., Kinosita.K.Jr., Yoshida, M.: "Catalysis and rotation of F_1 motor ; cleavage of ATP at the catalytic site occurs in 1 ms before 40 degree substep rotation."Proc Natl Acad Sci USA. 100. 14731-14736 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Itoh H, Takahashi A, Adachi K, Noji H, Yasuda R, Yoshida M, Kinosita K.: "Mechanically driven ATP synthesis by F_1-ATPase."Nature.. 427(6973). 465-458 (2004)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Nishizaka T, Oiwa K, Noji H, Kimura S, Muneyuki B, Yoshida M, Kinosita K Jr.: "Chemomechanical coupling in F_1-ATPase revealed by simultaneous observation of nucleotide kinetics and rotation."Nat Struct Mol Biol.. 11(2). 142-148 (2004)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より

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公開日: 2005-04-19  

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