| 研究課題/領域番号 |
13357003
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| 研究機関 | 自治医科大学 |
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研究代表者 |
岡本 宏明 自治医科大学, 医学部, 教授 (30177092)
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| 研究分担者 |
西澤 勉 自治医科大学, 医学部, 講師 (30306112)
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| キーワード | TTウイルス(TTV) / 遺伝子型 / 分子系統樹 / PCR / selective PCR / 遺伝子グループ / Neighbor-joining法 |
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| 研究概要 |
TTウイルスには少なくとも40種類の遺伝子型(genotype)が存在し、系統発生学的に大きく5種類のグループ(1-5:genetic groups 1-5)に分類できることが分かったが、TTVの多様性の全容解明には至っていない。そこで、前年度の成果を踏まえ、小児および成人のTTウイルス感染者を対象として、TTウイルスDNAクローンを分離し、それらの全核酸配列を決定した。Neighbor-joining (NJ)法によりTTウイルスの分子系統樹を作製し解析した結果、それぞれのグループに属する新たな遺伝子型のTTウイルスを分離できたことが分かった。次に、TTウイルスの各genetic groupsのDNA配列にそれぞれ特異的に結合しうるプライマーセットを作製し、selective PCR法によって5つのgenetic groupを簡便に判定しうる系を確立した。その検出系を用いて、年齢別にTTウイルスの各genetic group別の陽性頻度を調査した結果、系統発生学的に最も古いグループ4のTTウイルスが乳幼児の時期に感染し、成人でも高頻度に感染していることが分かった。グループ1のTTウイルスは生後6ヶ月以降に感染する例が少しずつ増え、成人でも10-15%の陽性率であった。グループ3には最も多くの遺伝子型のTTウイルスが属するが、グループ1やグループ4のTTウイルスと共感染している成人例が多いことが明らかになった。現在さらに各genetic groupごとにTTウイルスDNAをreal-time PCR法によって定量的に検出できる系を確立し、その臨床検体への応用を進めている。
(698字)
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