DNAメチル化によるクロマチン制御機構の構造的基盤

2003 年度 研究成果報告書概要

• 研究課題/領域番号: 13480230
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 横浜市立大学
• 研究代表者: 白川 昌宏 横浜市立大学, 総合理学研究科, 教授 (00202119)
• 研究期間 (年度): 2001 – 2003
• キーワード: DNAメチル化 / ユビキチン化 / NMR / DNA修復

研究概要

本研究はCpGメチル化を介したクロマチン構造の制御機構を、関与する蛋白質因子の立体構造と分子間相互作用の構造的基盤を基に解明することを目的とした。具体的には、研究対象として、メチル化DNA結合蛋白質であるMBD1、さらにヒトHR23B-プロテアソームS5aサブユニットユビキチン相互作用モチーフ(ubiquitin-interacting motif : UIM)複合体、ユビキチンのリジン48リンクの2量体、4量体、リジン63リンクの2量体、4量体、酵母Saccharomyces cerevisae Dsk2pのユビキチン会合ドメイン(ubiquitin-associated : UBA)-ユビキチン複合体を取り上げた。MBD1については、MBD1 M1行い、それからUIM-ユビキチン相互作用を推察した。また酵母Dsk2pユビキチン会合(UBA)ドメイン-ユビキチン複合体の構造解析を行った。加えて。Lys48リンク、Lys63リンクの2量体、4量体ユビキチン鎖の構造的特徴を調べるためにサブユニット特異的な安定同位体ラベルを行い、サブユニット間の相互作用面を化学シフト摂動法(chemical shift perturbation)、交差飽和法(cross saturation)を使って調べた。

研究成果

• [雑誌論文] Structure of the ubiquitin-interacting motif of S5a bound to the ubiquitin-like domain of HR23B. (2004)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara,K., Tenno,T., Sugasawa,K., Jee,J.-G., Ohki,I., Kojima,C., Tochio,H., Hiroaki,H., Hanaoka,F., shirakawa,M.
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 279 ページ: 4760-4767
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Structure of the ubiquitin-interacting motif of S5a bound to the ubiquitin-like domain of HR23B (2004)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, K., Tenno, T., Sugasawa, K., Jee, J.-G., Ohki, I., Kojima, C., Tochio, H., Hiroaki, H., Hanaoka, F., Shirakawa, M.
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 279 ページ: 4760-4767
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The structure and binding mode of interleukin-18. (2003)
  • 著者名/発表者名: Kato,Z, Jee,J.-G., Shikano,H., Mishima,M., Ohki,I., Ohnishi,H., Li,A., Hashimoto,K., Matsukuma,E., Omoya,K., Yamamoto,Y., Yoneda,T., Hara,T., Kondo,N., Shirakawa,M.
  • 雑誌名: Nature Structural Biology 10 ページ: 966-971
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Structure of the male determinant factor for Brassica self-incompatibility. (2003)
  • 著者名/発表者名: Mishima,M., Takayama,S., Saski,K., Jee,J.G., Kojima,C., Iogai,A., Shirakawa,M.
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 278 ページ: 36389-36395
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Methylated DNA-binding domain 1 and methylpurine-DNA glycosylase link transcriptional repression and DNA repair in chromatin. (2003)
  • 著者名/発表者名: Watanabe,S., Ichimura,T., Fujita,N., Tsuruzoe,S., Ohki,I., Shirakawa,M., Kawasuji,M., Nakao,M.
  • 雑誌名: Proceedings of Natural Academy of Sciences USA 100 ページ: 12859-12864
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] The structure and binding modeof interleukin-18 (2003)
  • 著者名/発表者名: Kato, Z, Jee, J.-G., Shikano, H., Mishima, M., Ohki, I., Ohnishi, H., Li, A., Hashimoto, K., Matsukuma, E., Omoya, K., Yamamoto, Y., Yoneda, T., Hara, T., Kondo, N., Shirakawa, M.
  • 雑誌名: Nature Structural Biology 10 ページ: 966-971
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structure of the male determinant factor for Brassica self-incompatibility (2003)
  • 著者名/発表者名: Mishima, M., Takayama, S., Sasaki, K., Jee, J.G., Kojima, C., Isogai, A., Shirakawa, M.
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 278 ページ: 36389-36395
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Methylated DNA-binding domain 1 and methylpurine-DNA glycosylase link transcriptional repression and DNA repair in chromatin (2003)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, S., Ichimura, T., Fujita, N., Tsuruzoe, S., Ohki, I., Shirakawa, M., Kawasuji, M., Nakao, M.
  • 雑誌名: Proceedings of Natural Academy of Sciences USA 100 ページ: 12859-12864
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より