| 研究概要 |
神経膠腫の個性診断のための低コストアレィを作製し,個々の遺伝子診断に代替する診断方法を確立することを目標とする.このため本年度は1)任意の遺伝子のストップコドン型変異の有無について迅速な遺伝子診断が可能な酵母Universal Stop Codon Assayを開発、それの誌上発表を行った(Am J Pathol).
2)1300遺伝子を厳選し、それをナイロンフィルター上に高密度スポットした、独自のアレイを開発、119種の癌細胞株のRNAサンプルにてそのアレイによる遺伝子発現プロフィールを検討し、良好な成績を得た。
3)U251MG, SF268,SF295,SF539,SNB-75,SNB-78の6種の神経膠腫細胞株において、P53,APC, PTEN遺伝子変異の有無を検討するとともに、上記DNAアレイにて遺伝子発現プロフィールを解析し、発現が他の癌細胞株と比べ、特異な上昇または下降を示す遺伝子85種を抽出した。
4)脳腫瘍を中心とする各種癌においてP53変異の化学療法感受性、放射線感受性におよぼす影響を検討、さらにdominant negative変異の意義を検討し誌上発表を行った。これらの結果から、設計作成されたDNAアレイは本研究計画遂行上、申し分ない特性を備えていることが明らかになった。
5)脳腫瘍の個性診断にはP53,PTEN遺伝子変異の検討に加え,上記アレイを用いた解析結果を特徴選択アルゴリズムおよびニューラルネットワークによりパターン識別することで識別率の高い判定が得られることが判明した.現在,臨床サンプルによる試験を実施中である.
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