人の様々な遺伝子座に存在するSNP解析とその法医学的応用

2002 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 13670440
• 研究機関: 久留米大学
• 研究代表者: 神田 芳郎 久留米大学, 医学部, 助教授 (90231307)
• 研究分担者: 副島 美貴子 久留米大学, 医学部, 助手 (80279140) ; 木村 博司 久留米大学, 医学部, 教授 (20112039)
• キーワード: KEL / α(1,4)glactosyltransferase gene / PON1 / BRCA1 / SNP / linkage disequilibrium(LD)

研究概要

我々は科学研究費の補助を受けて、人の様々な遺伝子座に存在するSNP解析を行なってきた。今回解析した遺伝子座はP式血液型の前駆物質を合成するα(1,4)glactosyltransferase gene, KEL式血液型を決定するKEL遺伝子等のnull mutationに相当するSNPsを同定し報告した。またparaoxonase1(PON1)遺伝子のpromoter領域とcoding多型(コドン192)のflanking sequenceそれぞれ1.3kb,1.7kb中のSNPを同定しSNP間のlinkage disequilibrium(LD) の人種差を解析した。その結果、PON1遺伝子のLDは日本人では非常に強く白人やアフリカ人では日本人に比べLDが小さいことが示された。これらのことからPON1に認められる冠動脈疾患などとcoding多型のassociationが人種によって異なっている理由の1つとして人種間のLDの違いによる可能性が示唆された。したがって今後は単にSNPと疾患のassociationではなく、haplotypeと疾患のassociation studyをする必要があると思われる。さらに乳癌感受性遺伝子BRCA1のExon 11(3.4kb)中のSNPsの人種差を解析し、この遺伝子はアフリカ人では1つのalleleが高頻度に存在しヨーロッパ人や日本人では別の2つのalleleが共に高頻度に存在することが示された。これらの結果からこの遺伝子多型が何らかのselectionによって維持されている可能性について解析中である。

研究成果

• [文献書誌] H.Pang: "N-acetylglucosamine-phosphate mutase genotype and diabetic microvascular complications"Diabetic Med. (in press).
• [文献書誌] S.Yamagishi: "PEDF Met72Thr polymorphism in patients with diabetic microangiopathy"Int.J.Clin.Pharm.Res. (in press).
• [文献書誌] M.Tsuneoka: "A novel Myc target gene, mina53, that is involed in cell proliferation"J.Biol.Chem. 277. 35450-35459 (2002)
• [文献書誌] H.Pang: "Identification of human phosphoglucomutase 3(PGM3) as N-acetylglucosamine-phosphate mutase(AGM1)"Ann.Hum.Genet. 66. 139-144 (2002)
• [文献書誌] Y.Koda: "Haptoglobin genotype and diabetic microangiopathies in Japanese diabetic patients"Diabetologia. 45. 1039-1040 (2002)
• [文献書誌] B.Wang: "Polymorphisms of eight STR loci in Chinese and African(Xhosa) populations"Forensic Sci.Int. 125. 279-280 (2002)
• [文献書誌] Y.Koda: "Three-base deletion and one-base insertion of the α(1,4)galactosyltransferase gene responsible for the p phenotype"Transfusion. 42. 48-51 (2002)
• [文献書誌] Y.Koda: "Heterozygosity for two novel alleles of the KEL gene causes the Kell-null phenotype in a Japanese woman"Br.J.Haematol. 117. 220-225 (2002)
• [文献書誌] K.Nakayama: "Distinctive distribution of AIM1 polymorphism among major human populations with different skin color"J.Hum.Genet. 47. 92-94 (2002)