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CHPおよびSKN細胞株を理科学研究所の細胞バンクより入手し、分化を誘導した。72時間で形態的に分化を完了するために、分化誘導前(0時間)、分化誘導後30分、1時間、2時間、6時間、12時間、24時間、72時間のタイミングで細胞を回収し、total RNAを抽出、Affymetrix社のチップにハイブリダイズした。以下の遺伝子が分化誘導の際、転写量の増加あるいは減少をみた。
分化誘導によりRNA発現が増加する遺伝子 protein kinase C inhibitor/Dyrk6/GSTT2/stat-like protein (Fe65)/replication protein A/Keratinocyte growth factor/T cell-specific tyrosine kinase/interferon receptor/RB1/metastasis-associated mta1/cyclin G1 interacting protein/cdc2-related protein kinase/Oncogene Ret/Ptc2/Guanine Nucleotide-Binding Protein Ral/T cell leukemia LERK-2/FGFR2/Breast cancer 2/Bcl-2 interacting killer (BIK)/ DNA-PKcs/Lyn B protein/sky/spermidine synthase/FKBP-rapamycin associated protein/angiotensin II type 1b receptor/CD34/NF1/folate receptor alpha/ubiquitin-like protein(GdX)/phosphatase 2A/metallothionein-IG/ISGF-3
分化誘導によりRNA発現が減少する遺伝子 S76475 trkC/hCox-2/GM-CSF receptor beta chain/IEX-1/cathepsin O/tyrosine kinase/interleukin-8 receptor type A/ubiquitin/BRCA2/Rap2/HER3/androgen receptor/RAD52/Fanconi anemia complementation group C/rac protein kinase beta/lymphocyte-specific protein tyrosine kinase(lck)/Sap 62/bleomycin hydrolase/CGR19/parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor/histone H1/cathepsin G/glia maturation factor/GDF-1/tyk2/CYP 27
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