| 研究課題/領域番号 |
13F03366
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| 研究機関 | 愛媛大学 |
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研究代表者 |
渡辺 幸三 愛媛大学, 理工学研究科, 准教授 (80634435)
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| 研究分担者 |
GAMBOA Maribet 愛媛大学, 理工学研究科, 外国人特別研究員
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| キーワード | 生物多様性 / 河川 / 適応進化 / 気候変動 / オミックス / ゲノム / 遺伝子発現 |
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| 研究実績の概要 |
日本の気候勾配に沿った札幌，仙台，岐阜，松山の４地域で採取したカワゲラ標本を使って，ゲノム，タンパク質，RNAの各レベルにおける進化パターンを探る分子生物学的解析を実施した．まず，ゲノムレベルの解析では，次世代DNAシークエンサーを使ったRADシークエンシングにより，26.5Gbにも及ぶ96個体分のゲノムワイドのDNA塩基配列情報を収集できた。タンパク質レベルの解析では，2次元電気泳動によるタンパク分画解析から，気温の季節間変動が大きな札幌と岐阜では，他地域よりも多様なタンパク質を発現していることが分かった．さらに，各地域に固有に発現していた計21種類のタンパク質を選択して，更に高度なアミノ酸配列情報等を取得するMALDI-TOF/TOFを行い，すべての実験が完了した．また，RNAレベルの解析では，ゲノムワイドのmRNAの発現解析（トランスクリプトーム解析）を次世代DNAシークエンサーを使って行い，12 GBに及ぶ46個体分のmRNA配列情報を取得した．このmRNAの配列情報に基づく簡易な遺伝子検索により，411個の遺伝子領域がアノテーションされ，そのうち131個はもっとも寒冷な札幌で特異的に検出されていることがわかった．
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
計画通り，ゲノム，タンパク，RNAの３つのレベルにおけるカワゲラの適応的進化を調べるための分子生物学的解析を完了することができたので，順調に進展していると評価できる．
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| 今後の研究の推進方策 |
最終年度はデータ解析と論文執筆を中心に進めて，研究成果をまとめる作業に力点を入れる予定である．
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