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2013 年度 実績報告書

オリゴヌクレオチドを用いた新規遺伝子発現制御法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 13J09123
研究機関東北大学

研究代表者

草野 修平  東北大学, 大学院理学研究科, 特別研究員(DC2)

キーワードオリゴヌクレオチド / アミノグリコシド / ナンセンス変異 / リードスルー
研究概要

アミノグリコシド-オリゴヌクレオチド(AG-ON)複合型分子によるPremature Stop Codon (PSC)選択的なリードスルー法の構築を目指し、①AG-ON複合型分子の合成法の確立②in vitroにおけるAG-ON複合型分子のリードスルー活性評価について検討を行った。
1. ONユニットへのAGユニットの導入は、官能基受容性の高いHuisgen [3+2]cyclo addition反応を用いることとした。まず、市販のG418およびパロモマイシンを出発原料として、数ステップの変換反応を経ることで、リンカーとしてエチレングリコール鎖を介してアジド基を導入したG418およびパロモマイシン誘導体の合成に成功した。合成したアジド基を持つAG誘導体と別途合成した5'位にアルキンを持つONとのHuisgen [3+2]cyclo addition反応により、目的とするAG-ON複合型分子の合成に成功した。
2. リードスルー活性評価は、AG-ON複合型分子とPSCを導入したmRNAを細胞抽出液中(細胞外翻訳系)で混合し、in vitro翻訳後、そのルシフェラーゼ活性を測定することで行った。その結果、AG部位にパロモマイシンを導入したAG-ON複合型分子はほとんどリードスルー活性を示さなかったが、G418を導入した分子は、若干ではあるがリードスルー活性を示すことが明らかとなった。さらに、今回合成したAG-ON複合型分子は、アジド基を持つG418誘導体単体よりも低濃度でリードスルー活性を示したことから、当初期待した分子設計通り、ONによりAGがPSC近傍に誘導され、効果的にリードスルーを誘起しているものと考えている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

AG-ON複合型分子の合成に関して、効率的な合成法の確立に成功し、目的とする二種類のAG-ON複合型分子の合成に成功した。合成したうちの一つの分子は、活性は低いながらも当初期待した分子設計通りリードスルー活性を示すという、本研究課題を遂行する上で重要な結果も得られた。以上の点から、今年度は期待通り研究が進展したと判断した。

今後の研究の推進方策

これまでに合成に成功したリードスルー活性を示すAG-ON複合型分子の分子構造に基づき、来年度は、G418の分子構造、mRNA上のONの結合位置、AGとONを結ぶスペーサー長の最適化を行い、高いリードスルー活性を示すAG-ON複合型分子の合成を目指す予定である。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Development of the crosslinking reactions to RNA triggered by oxidation2014

    • 著者名/発表者名
      Shuhei Kusano, Takuya Haruyama, Shogo Ishiyama, Shinya Hagihara, Fumi Nagatsugi
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      巻: 50 ページ: 3951-3954

    • DOI

      10.1039/C3CC49463B

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The crosslink formation of 2'-OMe oligonucleotide containing 2-amino-6-vinyl-purine protects mRNA from miRNA-mediated silencing2013

    • 著者名/発表者名
      Shinya Hagihara, Wei-Chen Lin, Shuhei Kusano, Xiao-guang Chao, Tsuneaki Hori, Shuhei Imoto, Fumi Nagatsugi
    • 雑誌名

      Chem Bio Chem

      巻: 14 ページ: 1427-1429

    • DOI

      10.1002/cbic.201300382.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis of peptide-conjugated light-driven molecular motors and evaluation of their DNA-binding properties2013

    • 著者名/発表者名
      Fumi Nagatsugi, Yusuke Takahashi, Maiko Kobayashi, Shunsuke Kuwahara, Shuhei Kusano, Tomoko Chikuni, Shinya Hagihara and Nobuyuki Harada
    • 雑誌名

      Mol. Bio Syst.

      巻: 9 ページ: 969-973

    • DOI

      10.1039/C2MB25520K

    • 査読あり
  • [学会発表] Development of the Oxidation Induced Crosslink Reaction2013

    • 著者名/発表者名
      Shuhei Kusano, Takuya Haruyama, Shinya Hagihara, Fumi Nagatsugi
    • 学会等名
      The 40^<th> International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • 発表場所
      神奈川県横浜市
    • 年月日
      2013-11-14
  • [学会発表] 酸化反応をトリガーとする架橋反応の開発2013

    • 著者名/発表者名
      草野 修平、春山 拓哉、萩原 伸他、永次 史
    • 学会等名
      第7回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県名古屋市
    • 年月日
      2013-09-27
  • [学会発表] 効率的遺伝子発現制御を目指した高い架橋形成能をもつビニルプリン誘導体の開発2013

    • 著者名/発表者名
      草野 修平、岩本 直生、萩原 伸也、春山 拓哉、永次 史
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会 第8回年会
    • 発表場所
      東京都文京区
    • 年月日
      2013-06-19

URL: 

公開日: 2015-06-25  

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