| 研究課題/領域番号 |
13J10599
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
大前 陽輔 東京大学, 医学系研究科, 特別研究員(PD)
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| 研究期間 (年度) |
2013-04-26 – 2016-03-31
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| キーワード | 結核症 / ゲノムワイド関連解析 / 菌体ゲノム / 宿主ゲノム / タイ王国 |
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| 研究実績の概要 |
本研究計画の目的は、結核菌による感染症である結核症について、病状の発症並びに薬剤治療有効性に与る宿主の遺伝的要因を、結核菌の遺伝的背景の情報と患者のゲノム情報とを統合的に解析することで、結核菌の遺伝的背景ごとに特徴的な感染メカニズムや薬剤治療応答メカニズムを明らかにすることである。
平成25年度の研究においては、受入研究室の先行研究によるゲノムワイド関連解析（GWAS）により同定されていた若年性結核における発症関連因子MAFBに対して、結核菌の遺伝的背景の情報を加えた解析を行った。タイNIHとの先行研究により収集されていたタイ人若年性結核サンプル127検体のうち、57検体について結核菌の遺伝系統を決定し、特定の遺伝系統感染時のみ発症関連遺伝子が有意にリスクとなることを明らかにした。さらに平成26年度は、タイNIHおよび理化学研究所、結核予防会との共同研究によりさらに解析検体数を増やした。研究費繰越事由として申請した、サンプルの性染色体上の遺伝子多型から私が推定する性別情報とタイ側共同研究者から提供された臨床情報データでの性別情報が不一致となるという問題が生じたものの、タイ側共同研究者と共同でデータ化された臨床情報記録と原記録を照合する作業を行うとともに、得られているデータと原サンプルからのSNPタイピングデータとの照合も行い、臨床情報およびデータ両方において対応にズレがないことを確証した。本確認作業により、当初のデータに加え、さらに若年性結核１５７症例が利用可能となり、それらの症例群においても、特定の遺伝系統でのみ発症関連遺伝子MAFBのリスクが有意に上昇することの再現性を得た。本成果は、結核症のリスク遺伝要因を同定するうえで、病原菌である結核菌のゲノム情報も考慮することが重要であることを示している。研究担当者は本成果について、第１３回国際人類遺伝学会にて口頭発表を行った。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
研究費繰越事由として申請した、サンプルの性染色体上の遺伝子多型から私が推定する性別情報とタイ側共同研究者から提供された臨床情報データでの性別情報が不一致となるという問題が生じたものの、タイ側共同研究者と共同でデータ化された臨床情報記録と原記録を丁寧に照合する作業を行うとともに、得られているデータと原サンプルからのSNPタイピングデータとの照合も行い、臨床情報およびデータ両方において対応にズレがないことを確証した。本確認作業により、当初のデータに加えてさらに若年性結核１５７症例のデータが利用可能となり、それらの症例の解析により自身の先行研究成果を補強する成果を得ることが出来た。従って、おおむね順調に研究は進捗したと判断する。
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| 今後の研究の推進方策 |
MAFB以外の宿主の結核発症リスク遺伝子についても解析を進める。結核菌の遺伝系統に基づく分類により、タイ王国で収集した北京型株感染患者270例、非北京型株感染患者420例、健常者782例のデータが利用可能である。また、もう一方の研究目的である薬剤治療有効性決定遺伝子の探索についても、理化学研究所との共同研究により、タイおよびインドネシアにてサンプル収集が進行中であり、来年度中にゲノムワイド関連解析を実施予定である。
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