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2004 年度 実績報告書

全ゲノム情報を基盤とする細菌病原性の多面的な解析

研究課題

研究課題/領域番号 14014241
研究機関宮崎大学

研究代表者

林 哲也  宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 教授 (10173014)

研究分担者 小椋 義俊  宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 助手 (40363585)
大岡 唯祐  宮崎大学, 医学部, 助手 (50363594)
戸邉 亨  大阪大学, 大学院・医学系研究科, 助教授 (70207596)
清水 徹  金沢大学, 大学院・医学研究科, 教授 (80235655)
飯田 哲也  大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (90221746)
キーワード病原性大腸菌 / ウェルシュ菌 / 腸炎ビブリオ / 病原性 / ゲノム多様性 / 発現制御ネットワーク / 二成分制御系 / III型分泌系
研究概要

本研究の解析対象である病原性大腸菌・ウェルシュ菌・腸炎ビブリオに関して、以下の知見を得た。
【病原性大腸菌】O157およびnon-O157タイプの腸管出血性大腸菌(EHEC)菌株の比較ゲノム解析が終了し、O157のプロファージ領域には遺伝子レベルでも高度な菌株間多様性が存在すること、non-O157EHECにはO157と異なる菌株特異的配列が大量に存在することが明らかとなった。病原性発現制御機構の解析では、RcsCDB二成分制御系による制御と重炭酸塩応答に、O157特異的制御因子GrvAとPchがそれぞれ関与することを見いだし、本菌の病原性発現制御機構が大腸菌共通の環境応答システムに菌株特異的制御因子を組み込むことによって構築されていることを明らかにした。III型分泌系の解析では、通常の嫌気培養条件下では抑制されている分泌活性が電子受容体添加により活性化されること、嫌気呼吸系の発現制御に関わる二成分制御系がこの活性化には必須であり、分泌活性自体を制御することを明らかにした。また、新たな分泌蛋白質(エフェクター)を多数見いだし、これらのエフェクターを含む86種類のO157特異的な分泌・菌体表層蛋白質の抗体作製も終了した。
【ウェルシュ菌】VirR/S二成分制御系あるいはVirR/S-VR-RNA系によって制御される200遺伝子を同定し、本制御システムが病原性だけでなく、エネルギー産生やアミノ酸・糖代謝系遺伝子群の制御にも関与することを明らかにした。このうち、myo-InositolオペロンがVirR/S系によって正に調節されること、機能未知遺伝子の一つ(CPE1368)がVirR/S-VR-RNA系によって負に調節されるDNase遺伝子であることを確認し、さらにVirR結合配列を持つ機能未知遺伝子の解析から、2種類の新規調節RNAを同定した。
【腸炎ビブリオ】全ゲノム配列解析から見出された2つのIII型分泌系(TTSS1,TTSS2)の解析を行い、それぞれが異なるエフェクターを分泌すること、TTSS1がHeLa細胞に対する細胞毒性に関与すること、TTSS2はウサギ結紮腸管ループ試験における液体貯留活性の発現に関与することを明らかにし、各分泌系のエフェクターを3種類ずつ同定した。

  • 研究成果

    (30件)

すべて 2005 2004

すべて 雑誌論文 (30件)

  • [雑誌論文] Vibrios commonly possess two chromosomes.2005

    • 著者名/発表者名
      K.Okada, et al.
    • 雑誌名

      J.Bacteriol. 187

      ページ: 752-757

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Identification and characterization of a cell-wall anchored DNase gene in Clostridium perfringens.2005

    • 著者名/発表者名
      K.Okumura, et al.
    • 雑誌名

      FEMS Microbiol.Lett. 242

      ページ: 281-285

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] III型分泌装置と細菌の病原性2005

    • 著者名/発表者名
      飯田哲也
    • 雑誌名

      蛋白質・核酸・酵素 50

      ページ: 29-35

  • [雑誌論文] Urease activity of enterohemorrhagic Escherichia coli depends on a specific one-base substitution in ureD.2004

    • 著者名/発表者名
      M.Nakano, et al.
    • 雑誌名

      Microbiology 150

      ページ: 3483-3489

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Phages of Pseudomonas.2004

    • 著者名/発表者名
      T.Hayashi, K.Nakayama
    • 雑誌名

      Pseudomonas 1

      ページ: 233-259

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Extensive genomic diversity in pathogenic Escherichia coli and Shigella strains revealed by comparative genomic hybridization microarray.2004

    • 著者名/発表者名
      S.Fukiya, et al.
    • 雑誌名

      J.Bacteriol. 186

      ページ: 3911-3921

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Functional characterization of two type III secretion systems of Vibrio parahaemolyticus.2004

    • 著者名/発表者名
      K.-S.Park, et al.
    • 雑誌名

      Infect.Immun. 72

      ページ: 6659-6665

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Biodiversity of vibrios.2004

    • 著者名/発表者名
      F.L.Thompson, et al.
    • 雑誌名

      Microbiol.Mol.Biol.Rev. 68

      ページ: 403-431

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Organization and transcriptional regulation of myo-Inositol operon in Clostridium perfringens.2004

    • 著者名/発表者名
      H.I.Kawsar, et al.
    • 雑誌名

      FEMS Microbiol.Lett. 235

      ページ: 289-295

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Genomic analysis of Bacteroides fragilis reveals extensive DNA inversions regulating cell surface adaptation.2004

    • 著者名/発表者名
      T.Kuwahara, et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101

      ページ: 14919-14924

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Cytotoxicity and enterotoxicity of the thermostable direct hemoly sin-deletion mutants of Vibrio parahaemolyticus.2004

    • 著者名/発表者名
      K.-S.Park, et al.
    • 雑誌名

      Microbiol.Immunol. 48

      ページ: 313-318

  • [雑誌論文] 下痢・腸炎をおこす大腸菌-O157のゲノム解析からみえてきたこと2004

    • 著者名/発表者名
      林哲也
    • 雑誌名

      微生物はなぜ病気をおこすか ゲノムの特徴(林英生編集)

      ページ: 58-69

  • [雑誌論文] クロストリジウム2004

    • 著者名/発表者名
      清水徹
    • 雑誌名

      微生物はなぜ病気をおこすか ゲノムの特徴(林英生編集)

      ページ: 91-99

  • [雑誌論文] DNAマイクロアレイの応用2004

    • 著者名/発表者名
      清水 徹
    • 雑誌名

      微生物はなぜ病気をおこすか ゲノムの特徴(林英生編集)

      ページ: 160-167

  • [雑誌論文] 病原性の質と強さを見る2004

    • 著者名/発表者名
      戸邉亨
    • 雑誌名

      微生物はなぜ病気をおこすか ゲノムの特徴(林英生編集)

      ページ: 170-177

  • [雑誌論文] 腸管出血性大腸菌O157(enterohemorrhagic Escherichia coliO157)のゲノム解析2004

    • 著者名/発表者名
      林哲也
    • 雑誌名

      ゲノミクス・プロテオミクスの新展開 生物情報の解析と応用(今中忠行監修)

      ページ: 235-247

  • [雑誌論文] 腸炎ビブリオ2004

    • 著者名/発表者名
      飯田哲也
    • 雑誌名

      ゲノミクス・プロテオミクスの新展開 生物情報の解析と応用(今中忠行監修)

      ページ: 248-255

  • [雑誌論文] Clostridium2004

    • 著者名/発表者名
      林英生, 清水徹
    • 雑誌名

      ゲノミクス・プロテオミクスの新展開 生物情報の解析と応用(今中忠行監修)

      ページ: 256-267

  • [雑誌論文] ゲノム解読・ゲノム比較から見えてくる細菌の病原性と多様性-病原性大腸菌O157を例として2004

    • 著者名/発表者名
      林 哲也
    • 雑誌名

      わかる実験医学シリーズ ウイルス・細菌と感染症がわかる(吉開泰信編集)

      ページ: 107-113

  • [雑誌論文] 病原細菌のゲノム構造2004

    • 著者名/発表者名
      林英生, 清水徹, 太田敏子
    • 雑誌名

      「医学をゲノムする」阿蘇シンポジュウム記録2003

      ページ: 15-45

  • [雑誌論文] ゲノムから解くヒト病原微生物 病原性ビブリオ2004

    • 著者名/発表者名
      飯田哲也
    • 雑誌名

      化学と生物 42

      ページ: 619-624

  • [雑誌論文] ゲノムから解くヒト病原微生物 クロストリジウム2004

    • 著者名/発表者名
      清水徹
    • 雑誌名

      化学と生物 42

      ページ: 674-679

  • [雑誌論文] 病原性大腸菌2004

    • 著者名/発表者名
      林哲也, 戸邉亨
    • 雑誌名

      化学と生物 42

      ページ: 758-764

  • [雑誌論文] ウェルシュ菌のゲノム構造の解析と病原遺伝子発現調節機構の解明2004

    • 著者名/発表者名
      清水徹
    • 雑誌名

      日本細菌学雑誌 59

      ページ: 377-385

  • [雑誌論文] 腸炎ビブリオの病原性とゲノム構造に関する分子遺伝学的研究2004

    • 著者名/発表者名
      飯田哲也
    • 雑誌名

      日本細菌学雑誌 59

      ページ: 457-464

  • [雑誌論文] ウェルシュ菌のシグナル伝達機構2004

    • 著者名/発表者名
      清水徹, 大谷郁, 中村信一
    • 雑誌名

      臨床と微生物 31

      ページ: 229-237

  • [雑誌論文] 病原性大腸菌のクオラムセンシングと病原性発現2004

    • 著者名/発表者名
      戸邉亨
    • 雑誌名

      臨床と微生物 31

      ページ: 239-244

  • [雑誌論文] 腸管出血性大腸菌のゲノム解析2004

    • 著者名/発表者名
      小椋義俊, 林哲也
    • 雑誌名

      ゲノム医学 4

      ページ: 219-224

  • [雑誌論文] ビブリオ属菌のゲノム解析2004

    • 著者名/発表者名
      飯田哲也, 朴権三
    • 雑誌名

      ゲノム医学 4

      ページ: 337-340

  • [雑誌論文] 腸管出血性大腸菌のゲノムの特徴2004

    • 著者名/発表者名
      大岡唯祐, 小椋義俊, 林哲也
    • 雑誌名

      化学療法の領域 20

      ページ: 1328-1333

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公開日: 2006-07-12   更新日: 2016-04-21  

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