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NAT1はRNAエディティングAPOBEC1の過剰発現により誘導された肝細胞癌において、原因遺伝子の候補として同定された。ノックアウトマウスの解析の結果、NAT1はES細胞の分化とマウス初期発生に必須であることがわかった。NAT1は翻訳開始因子eIF4Gと類似しており、eIF4Gと同様に複数の蛋白質結合ドメインを有していることから、アダプター蛋白質として機能している可能性が高い。そこで本研究ではNAT1と結合する蛋白質の同定を目標とした。NAT1のC末端にカルモジュリン結合蛋白質とプロテインAの2つのタッグを融合させた蛋白質を発現するベクターをES細胞に導入した。この細胞を大量培養し、蛋白質を抽出した。ついでIgGビーズとカルモジュリンビーズによる2段階のアフィニティー精製を行った結果、NAT1を高純度に精製することに精製した。精製産物をSDS-PAGEにて分離し、銀染色による可視化を行った結果、複数の蛋白質が特異的に共精製されていることがわかった。これらのバンドを切り出し、LC/MS/MS質量分析により同定を試みた。一つは以前からNAT1と結合することが知られているeIF4Aであった。他のバンドに関してはサンプル量が少なく、同定には至らなかった。
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