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2004 年度 実績報告書

膜蛋白質相互作用解析のための構造生物学的戦略の開発とその応用

研究課題

研究課題/領域番号 14104017
研究機関東京大学

研究代表者

嶋田 一夫  東京大学, 大学院・薬学系研究科, 教授 (70196476)

研究分担者 寺沢 宏明  東京大学, 大学院・薬学系研究科, 助手 (10300956)
キーワード安定同位体標識法 / 交差飽和法 / 移転交差飽和法 / 膜蛋白質 / 相互作用解析 / NMR
研究概要

昨年度までに、我々は、TCS実験結果に基づいてKcsA-AgTx複合体モデルを構築し、複合体モデル中における相互作用残基対の特定を行った。その結果、電位依存性K+チャネルのポアーブロッカー感受性を決定する要因を明らかにしてきた。しかし、膜蛋白質が極めて不安定であることを考慮すると、膜蛋白質をNMRにて解析するためには、適切なNMR試料調整法が必要と考えた。そこで、NMR試料調整法に関して、以下のアイデアをもって実験を行った。膜蛋白質にHisタグを付加し、Zn-NTAビーズに吸着させ、脂質2重膜でコートし、プロテオリポソームを作成する。このような膜蛋白質の埋め込みにより、膜の内外に対する膜蛋白質の配向は完全にコントロールされことになる。また、膜蛋白質は、本来の二重膜に覆われているため、界面活性剤中に存在する場合に比較してより安定であることが期待される。さらに、Zn-NTAビーズに固定することにより膜蛋白質同士の凝集を抑えられることが期待される。
そこで、KcsAを吸着膜蛋白として、プロテオリポソームの作成を行った。
得られたプロテオリポソームに関して、共焦点顕微鏡を用いた脂質吸着の確認、また、DSC、燐酸のNMRシグナルの観測から、プロテオリポソーム上に脂質2重膜が存在していることが示された。したがって、KcsAチャネルを用いて、上記プロテオリポソームを構成させることに成功したと結論した。さらに、このプロテオリポソームを用いて転移交差飽和法実験を行い、AgTx上のチャネル結合面の同定を行ったところ、すでに得られていた結合残基と同じ残基を同定することができ、この再構成法は有効であることが示された。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2004 その他

すべて 雑誌論文 (6件)

  • [雑誌論文] 1H, 13C, and 15N backbone resonance assignments of the hyaluronan-binding2004

    • 著者名/発表者名
      Mitsuhiro Takeda
    • 雑誌名

      J.Biomol.NMR 29

      ページ: 97-98

  • [雑誌論文] Optimization of 13C Direct Detection NMR Methods2004

    • 著者名/発表者名
      Nobuhisa Shimba
    • 雑誌名

      J.Biomol.NMR 30

      ページ: 175-179

  • [雑誌論文] Investigation of the CPD photolyase DNA Recognition Mechanism by NMR Analyses2004

    • 著者名/発表者名
      Takuya Torizawa
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 279

      ページ: 32950-32956

  • [雑誌論文] NMR Study of Repair Mechanism of DNA Photolyase by FAD-Induced Paramagnetic Relaxation Enhancement2004

    • 著者名/発表者名
      Takumi Ueda
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 279

      ページ: 52574-52579

  • [雑誌論文] NMR techniques for identifying the interface of a larger protein-protein complex : cross-salutation and transferred cross-saturation experiments

    • 著者名/発表者名
      Ichio Shimada
    • 雑誌名

      Method.Enzymol (in press)

  • [雑誌論文] An NMR Method for the Determination of Protein Binding Interfaces Using Dioxygen-Induced Spin-Lattice Relaxation Enhancement

    • 著者名/発表者名
      M.Sakakura
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc (in press)

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公開日: 2006-07-12   更新日: 2016-04-21  

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