研究概要 |
前年度までの研究により、class-IIハプロタイプ内では花粉側に直線的な優劣性関係が存在し、SP11の発現レベルで制御されていることを明らかにした。今年度はSP11のプロモーター領域の単離を目的とし、S29,S40,S44の3系統のゲノムライブラリーから、SP11の周辺領域を含む約15kbのファージクローンをそれぞれ単離し、その全塩基配列をショットガン法により決定した。S40とS44由来のクローンには、SP11の上流約10kbにSRKの一部が座乗していた。S29については、SP11とSRKの物理的距離を正確に測定できなかったが、現在、PCR法によりクローニングを行っている。奈良先端大で解析されたS60のゲノム構造と比較したところ、SP11とSRKの相対的な位置関係及び両者の転写方向が一致していたため、class-IIハプロタイプ内ではSP11,SRK,SLG遺伝子の配列と同様に、ゲノム構造も高度に保存されていると考えられた。 SP11の転写制御領域であると考えられるATGより-300bp領域ではSハプロタイプ間で、69.2-85.5%の相同性を有することがわかった。またこれらの領域にはDNAのメチル化の修飾を受けるとされるCpG,CpNpG配列がハプロタイプ間で保存されて存在している場所と、ハプロタイプ特異的な場所が存在していた。こうした配列が優劣性を制御している候補と考えられた。
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