| 研究課題/領域番号 |
14570385
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| 研究機関 | 名古屋大学 |
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研究代表者 |
打樋 利英子 名古屋大学, 大学院・医学系研究科, 助手 (20223571)
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| 研究分担者 |
吉岡 尚文 秋田大学, 医学部, 教授 (80108935)
勝又 義直 名古屋大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (30109326)
山本 敏充 名古屋大学, 大学院・医学系研究科, 助教授 (50260592)
岸田 哲子 大分医科大学, 医学部, 教授 (50136793)
玉木 敬二 京都大学, 大学院・医学研究科, 教授 (90217175)
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| キーワード | 日本人 / STR / Y染色体 / 遺伝的多型 / 遺伝マーカー |
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| 研究概要 |
本年度は、名古屋200名、秋田199名、沖縄196名のDNA試料からAmpFlSTR Identifiler kitを用いて常染色体上の15STRローカスのタイピングを行い、各ローカスのアレル頻度を算出した。また、これらの頻度について、Hardy-Weinberg平衡(HWE)からの乖離を、homozygosity test、likelihood ratio test exact testにより検定したところ、全てのローカスにおいて、少なくともexact testで乖離は認められなかった。また、アメリカ合衆国NISTが開発した10ローカス(DYS436、DYS439、DYS435、DYS19、DYS460、YGATAH4、DYS391、DYS392、DYS438、DYS437)のY-STRをマルチプレックス法により型判定できるシステムにおいて、非常に情報量が少ないDYS436をMinimal Databaseに含まれるDYS389Iに入れ換えた改良型の10-plexシステムを作製し、このシステムと、市販のY-PLEX6キット(DYS393、DYS19、DYS389、DYS390、DYS391、DYS385)を用いて、名古屋207名、秋田122名、沖縄87名の男性DNA試料から、共通な2ローカスを除く14ローカスのハプロタイプ解析を行った。また、同様に、大分で採取された135名のDNA試料についても現在解析中である。今後、少なくとも全ての集団で200サンプル以上収集し、できれば、他の地域から収集したDNA試料や我々が開発したマルチプレックスに含まれるローカスをダイピングした後、各ローカスの地域差について、GenepopやStructure programなどのソフトを使って検討したいと考えている。
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