| 研究課題/領域番号 |
14572179
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| 研究機関 | 岐阜大学 |
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研究代表者 |
藤井 秀比古 岐阜大学, 医学部, 助手 (50301213)
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| 研究分担者 |
清島 満 岐阜大学, 医学部, 教授 (10171315)
和田 久泰 岐阜大学, 医学部附属病院, 講師 (10283300)
斉藤 邦明 岐阜大学, 医学部附属病院, 講師 (80262765)
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| キーワード | proteomics / macrophage / Atherosclerosis |
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| 研究概要 |
動脈硬化の進展に重要である活性化マクロファージが発現するタンパク質分子を同定する目的で、ヒト単球由来のマクロファージのproteome解析を行った。
1.Proteome解析技術の基礎的検討 以下の3方法を用い比較検討した。
1)2次元電気泳動法による展開後、違いの明らかな各spotをcut、トリプシンでゲル内消化、online逆相カラムで分離後、連結させたイオントラップ型質量分析装置によりタンパク質を同定。
2)SDS-PAGEにて分離後、2mm毎にcutした33個の未染色gel sliceをトリプシンでゲル内消化し、各gelに存在するタンパクを1)と同様の方法で同定。
3)可溶化したマクロファージ細胞を直接トリプシン消化し、online2次元HPLC(陽イオン交換カラムと逆相カラムを接続)で分離後、ESI-IT-MSに導入し、sample内に含まれるタンパク質を同定。
1)では、同定できたタンパク質の総数は少なかった。2)3)は、定量的評価は困難であったが、同定された総数は飛躍的に増加した。とくに2次元HPLCを使用した例では、発現量の少ないタンパク質分子を同定できる可能性が示唆された。
2.LPSにより誘導されるタンパク質の同定
2次元電気泳動法により20スポットが同定され、controlとLPS刺激sampleとの比較が可能であった。そのなかでadipocyte fatty acid binding proteinなど、動脈硬化に関与すると考えられているタンパク質が同定された。カラムによる分離を用いた2)および3)の方法から、236個のマクロファージ細胞内タンパク質を同定した。解析例をカテゴリー分類すると、細胞骨格蛋白が60%を占め、残りは酵素蛋白がほとんどで、膜蛋白は4%であった。LPSにより誘導されるタンパク質は、シグナル伝達に関与する蛋白を含む26個を同定した。
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