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2003 年度 実績報告書

X線構造に基づく好熱性放線菌α-アミラーゼのシクロデキストリン加水分解機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 14580621
研究機関東京農工大学

研究代表者

神鳥 成弘  東京農工大学, 工学部, 助教授 (00262246)

研究分担者 坂野 好幸  東京農工大学, 農学部, 教授 (70014959)
キーワードX線結晶解析 / α-アミラーゼ / シクロデキストリン / 加水分解 / ミュータント酵素 / 好熱性放線菌 / グルコシド結合 / 放射光
研究概要

好熱性放線菌(Thermoactinomyces vulgaris R-47)は,2つのα-アミラーゼ(TVA1,TVA2)を持つ。これらは,デンプンに加えて,通常のα-アミラーゼがほとんど加水分解できない環状オリゴ糖であるシクロデキストリン(CD)やプルランをも加水分解できるという興味深い基質特異性を持つ。また,TVA1はデンプン・プルランなどの高分子量基質に,TVA2は,CD・オリゴ糖などの低分子量基質に対してよく働く。これらの酵素の加水分解機構を解明するために,前年度から引き続き平成15年度においては,以下の研究を行った。
不活性型TVA2ミュータント酵素と,α-,β-,γ-CD(それぞれグルコース単位が6,7,8)との複合体の結晶を作成し,X線結晶解析を行った。X線データは,放射光(高エネルギー加速器研究機構PF,およびSPring-8)により収集した。3.0Å程度の分解能での解析ではあるが,全ての複合体において,触媒部位へのCD結合が認められた。CD認識・加水分解機構について新たな知見を得たので現在,論文執筆中である。
TVA1不活性型ミュータント酵素とマルトヘキサオースとの複合体のX線結晶解析を行った。その結果,触媒部位とは別に,ドメインNに2箇所の基質結合が認められた。このことは,ドメインNがデンプン結合ドメインとして働き,TVA1が高分子量基質を好むことと密接に関係があると考えられる。この結果は,それを立証する生化学データとともに,論文誌に発表した。
TVA1,TVA2のX線結晶解析の結果から,CDを認識するアミノ酸を相互置換することにより,TVA1とTVA2の基質特異性の相互変換を試みた。その結果,TVA1ミュータント酵素(F313A)において,デンプン:CDに対する加水分解活性比を,野生型TVA2のものに近づけることに成功した。この結果は,論文誌に発表した。

  • 研究成果

    (2件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (2件)

  • [文献書誌] Ohtaki, A., Iguchi, A., Mizuno, M., Tonozuka, T., Sakano, Y., Kamitori.S.: "Mutual conversion of substrate specificities of Thermoactinomyces vulgarius R-47 α-amylase TVAI and TVAII by site-directed mutagenesis"Carbohydrate Research. 338. 1553-1558 (2003)

  • [文献書誌] Abe, A., Tonozuka, T., Sakano, Y., Kamitori, S.: "Complex structures of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-amylase 1 with malto-oligosaccharides demonstrate the role of domain N acting as a starch binding domain"J.Mol.Biol.. 335. 811-822 (2004)

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公開日: 2005-04-18   更新日: 2016-04-21  

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