カイコの全ゲノム解析のための研究者ネットワークの構築

2002 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 14606002
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 小林 正彦 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (60162020)
• 研究分担者: 川崎 秀樹 宇都宮大学, 農学部, 教授 (00134263) ; 嶋田 透 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教授 (20202111) ; 佐原 健 北海道大学, 大学院・農学研究科, 助手 (30241368) ; 新美 輝幸 名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 助手 (00293712) ; 阿部 広明 東京農工大学, 農学部, 助手 (80222660)
• キーワード: 全ゲノムショットガン / 国際研究者交流 / フランス:インド:中国 / カイコゲノム / 完全長cDNA / BACコンティグ / ホームページ / メーリングリスト

研究概要

1.カイコゲノム研究者ウェブサイトおよびメーリングリストの整備
日本のカイコゲノム研究者ネットワークのウェブサイトをhttp://www.ab.a.u-tokyo.ac.jp/に開設した。また,日本のカイコゲノム研究者のメーリングリストをナショナルバイオリソースプロジェクトと連携して開設した。
2.国際ワークショップの開催
第1回国際鱗翅目ゲノムワークショップを2002年9月30〜10月2日につくば市の文部科学省研究交流センターにて開催した。世界各国から多数の研究者が参集した。
3.カイコの全ゲノム解析の国内体制の整備と国際協力
当ネットワークの総意として,カイコの全ゲノムショットガン解析が必要であることの合意を得た。これを,農業生物資源研究所・国立遺伝学研究所・理化学研究所などの関係者へ説明した。また,中国の西南農業大学(重慶)および国家人類基因組南方研究中心(上海)のカイコゲノム研究者と協議し,日中の協力関係を推進することで合意した。
4.cDNAライブラリーの整備
農業生物資源研究所で行われているカイコのBACコンティグ化/配列決定,ならびに本年度の後半になって開始した全ゲノムショットガン解析が進むにともなって,遺伝子のアノーテーションに必要なcDNA情報が不足していることが問題になってきた。そのため,当ネットワークとして完全長cDNAライブラリーを作成することに決定し,翅原基および培養細胞BmNのライブラリーを作成した。

研究成果

• [文献書誌] Yoshiko Koike, Kazuei Mita, Masataka G, Susumu Maeda, Hiroaki Abe, Osoegawa K, Pieter J. deJong, Toru Shimada: "Genomic sequence of 320 kb containing a kettin ortholog on the Z chromosome in Bombyx mori"Molecular Genetics and Genomics. (印刷中). (2003)
• [文献書誌] Hiroaki Abe, Toshiyuki Sugasaki, Mariko Kanehara, Fumi ohbayashi, Shinya Kawai, Kazuei Mita, Toru Shimada: "Nested retrotransposons on the W chromosome of the wild silkworm Bombyx mandarina"Insect Molecular Biology. 11(4). 307-314 (2002)
• [文献書誌] Fumi Ohbayashi, Masataka G.Suzuki, Toru Shimada: "Sex determination in Bombyx mori"Current Science (Bangalore). 83(4). 466-471 (2002)
• [文献書誌] Kazuei Mita, Mitsuoki Morimyo, Kazuhiro Okano, Yoshiko Koike, Junko Nohata, Masataka G.Suzuki, Toru Shimada: "Construction of an EST database for Bombyx mori and its applications"Current Science (Bangalore). 83(4). 426-431 (2002)
• [文献書誌] Guo-Xing Quan, Insu Kim, Natuo Koumoto, Hideki Sezutsu, Manabu Ote, Toru Shimada, Toshio Kanda, Kazuei Mita, Masahiko Kobayashi, Tosihiki Tamura: "Characterization of the kynurenine 3-monooxygenase gene corresponding to the white egg 1 mutant in the silkworm Bombyx mori"Molecular Genetics and Genomics. 267(1). 1-9 (2002)
• [文献書誌] 嶋田 透: "カイコのゲノムが解き明かす昆虫の謎(ゲノム-命の設計図-)"東大出版会(印刷中,所収). (2003)