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1.(1)p53ならびにp73結合配列を全ゲノムDNA配列を対象に検索できるクライアント/サーバ型構造の解析システムを開発した。開発言語はANSI C言語を使用した。
(2)開発したシステムはユーザのリクエストを受け取るWEBサーバ(多数のCGI群で構成)、WEBサーバからの情報により制御手続きを自動生成するタスクコントローラ、タスクコントローラの制御命令により実際の処理を行う処理プロセッサ(マルチパラレルコンピューティングエンジン)で構成した。
2.(1)開発したシステムを用いて全ゲノムDNAシークエンスを解析した結果、p53、p73の結合配列と100%一致する部位をp53については3600箇所(従来のコンセンサス配列と100%一致、スペーサ0から12塩基)、p73に関しては12箇所(従来のコンセンサス配列と100%一致、スペーサ0から9塩基)予測した。
(2)p53結合部位として既知のp53下流遺伝子p53AIP、Annexin-8、MDM2、Col type IVについては既報の結合部位に加え、新たな結合部位を予測した
(3)予測されたp53結合部位近傍の遺伝子につき、RT-PCR法によりAd-p53による遺伝子発現誘導の検討を行った結果、新規のp53下流遺伝子候補としてPIBP1、SCBP1、IGFBP-2、Co12A18、MGMT、AQP7を同定した。
3.(1)システムのOSはDebian GNU Linux3.0を使用したが、USAGI IPv6 Patchによりカーネル再構築を行うことでIPv6化し、あわせてwebサーバのIPv6化も行うことでシステム全体のIPv6化を行った。
(2)IPsecを実装することで、特定クライアント間との通信を暗号化して行えるシステムとした。
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