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2006 年度 研究成果報告書概要

植物発生とゲノム構造のエピジェネティックな制御

研究課題

研究課題/領域番号 14GS0321
研究種目

学術創成研究費

配分区分補助金
研究機関国立遺伝学研究所

研究代表者

角谷 徹仁  国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 教授 (20332174)

研究分担者 木下 哲  国立遺伝学研究所, 助手 (60342630)
柴原 慶一  国立遺伝学研究所, 助教授 (20263098)
荒木 崇  京都大学, 大学院・生命科学研究科, 教授 (00273433)
研究期間 (年度) 2002 – 2006
キーワードエピジェネティクス / トランスポゾン / DNAメチル化 / シロイヌナズナ / クロマチン / インプリンティング / ゲノム / 花成
研究概要

(1)野生型個体では、FWA遺伝子が胚乳特異的かつインプリントされた発現をすること、これは維持型DNAメチンレ化酵素遺伝子METIおよびDNAグリコシラーゼ遺伝子DEMETERによって制御されていることを明らかにできた(Science303,521-)。さらに、FTが花成誘導因子であること(Science309,1052-)、FWAは、このFTの活性を蛋白質レベルで阻害することによって花成に影響することがわかった(PlantCell Physiol 48,205-)。また、別のインプリント遺伝子FIS2もDNAメチル化による制御を受けていた(Plant Ce1118,1360-)。
(2)転移因子CACTAは野生型では転移が抑制されているが、CGメチル化酵素遺伝子METIと非CGメチル化酵素CMT3の二重突然変異下で高頻度に転移した。DNヘメチル化がこのトランスポゾンの転移抑制に働いていることがわかる(Curr Biol 13,421-)。
(3)クロマチン関連遺伝子の突然変異、およびRNAiに必要な遺伝子の突然変異体でCACTA因子の活性を調べた結果、ddm1以外に、CGメチル化酵素遺伝子MET1およびクロマチン集合因子FASの突然変異で転写誘導が観察された(Curr Biol 13,421-,Genes to Cells 18,153-)。Ddm1突然変異は、CACTA因子やセントロメア付近のヘテロクロマチン形成を解除し、この状態が野生型でも継承される(EMBO J.21,6549-)。この系を用いてヘテロクロマチンとユークロマチンへのCACTAトランスポゾンの転移を調べた結果、個々の転移はヘテロクロマチンヘターゲットされていないことがわかった。転移因子の蓄積によるヘテロクロマチン進化の機構を考える上で興味深い(Genetics 168,961-)。

  • 研究成果

    (41件)

すべて 2007 2006 2005 2004 2003 2002

すべて 雑誌論文 (41件)

  • [雑誌論文] Control of FWA gene silencing in Arabidopsis thaliana by SINE-related direct repeats2007

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita, Y., et. al.
    • 雑誌名

      Plant Journal 49

      ページ: 38-45

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Chromosome-specific and ecotype-specific expansion of variant centromeric satellites in Arabidopsis thaliana2007

    • 著者名/発表者名
      Ito, H., et. al.
    • 雑誌名

      MGG 277

      ページ: 23-30

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Molecular basis of late-flowering phenotype caused by dominant epi-alleles of the FWA locus in Arabidopsis2007

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, Y., et. al.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol 48

      ページ: 205-220

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Chromatin assembly factor-1 is required for rapid nucleosome formation during DNA replication and efficient Chk1 activation in vertebrate chicken DT40 cells2007

    • 著者名/発表者名
      Takami, Y., et. al.
    • 雑誌名

      Mol.Biol.Cell. 18(1)

      ページ: 129-141

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Chromosome-specific and ecotype-specific expandion of variant centromeric satellites in Arabidopsis thaliana.2007

    • 著者名/発表者名
      Ito, H., et. al.
    • 雑誌名

      MGG 277

      ページ: 23-30

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Molecular basis of late-flowering phenotype caused by dominant epi-alleles of the FWA locus in Arabidopsis2007

    • 著者名/発表者名
      Ikeda, Y., et. al.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol. 48

      ページ: 205-220

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Chromatin assembly factor-1 is required for rapid nucleosome formation during DNA replication and efficient Chkl activation in vertebrate chicken DT40 cells2007

    • 著者名/発表者名
      Takami, Y., et. al.
    • 雑誌名

      Mol.Biol. Cell. 18(1)

      ページ: 129-141

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Enhauced homologous recombination and T-DNA integration in chromatin assembly factor-1 mutants in Arabidopsis thaliana.2007

    • 著者名/発表者名
      Endo, M., et. al.
    • 雑誌名

      EMBO J. 25(23)

      ページ: 5579-5590

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Simple, one-week method to construct gene-targeting vectors : application to production of human knockout cell lines.2007

    • 著者名/発表者名
      Iizumi, S., et. al.
    • 雑誌名

      Bio Techniques 41(3)

      ページ: 311-316

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Histone acetyltransferase 1 is dispensable for replication-coupled chromatin assembly but contributes to recover DNA damages created following replication blockage in vertebrate cells.2007

    • 著者名/発表者名
      Barman, HK., et. al.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun. 345

      ページ: 1547-1557

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Enhanced homologous recombination and T-DNA integration in chromatin assembly factor-1 mutants in Arabidopsis thaliana2006

    • 著者名/発表者名
      Endo, M., et. al.
    • 雑誌名

      EMBO J. 25(23)

      ページ: 5579-5590

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Simple,one-week method to construct gene-targeting vectors:application to production of human knockout cell lines2006

    • 著者名/発表者名
      Iizumi, S., et. al.
    • 雑誌名

      Bio Techniques 41(3)

      ページ: 311-316

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Histone acetyltransferase 1 is dispensable for replication-coupled chromatin assembly but contributes to recover DNA damages created following replication blockage in vertebrate cells2006

    • 著者名/発表者名
      Barman, HK., et. al.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun 345

      ページ: 1547-1557

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Asfl is required for viability and chromatin assembly during DNA replication in vertebrate cells2006

    • 著者名/発表者名
      Sanematsu, F., et. al.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 281

      ページ: 13817-13827

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Nuclear RanGAP is required for the heterochromatin assembly and is reciprocally regulated by histone H3 and Clr4 histone methyltransferase in Schizosaccharomyces Pombe2006

    • 著者名/発表者名
      Nishijima, H., et. al.
    • 雑誌名

      Mol.Biol.Cell 17

      ページ: 2524-2536

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Chromatin assembly factor 1 ensures the stable maintenance of silent chromatin states in Arabidopsis2006

    • 著者名/発表者名
      Ono, T., et. al.
    • 雑誌名

      Genes Cells 18

      ページ: 153-162

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Asfl is required for viability and chromatin assembly during DNA replication in vertebrate cells.2006

    • 著者名/発表者名
      Sanematsu, F., et. al.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 218

      ページ: 13817-13827

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Nuclear RanGAP is required for the heterochromatin assembly and is reciprocally regulated by histone H3 and C1r4 histone methyltransferase in Schizosaccharomyces Pornbe.2006

    • 著者名/発表者名
      Nishijima, H., et. al.
    • 雑誌名

      Mol. Biol. Cell 17

      ページ: 2524-2536

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Chromatin assembly factor 1 ensures the stable maintenance of silent chromatin states in Araidopsis2006

    • 著者名/発表者名
      Ono, T., et. al.
    • 雑誌名

      Genes Cells 18

      ページ: 153-162

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] FD,a bZIP protein mediating signals from the floral pathway integrator FT at the shoot apex2005

    • 著者名/発表者名
      Abe, M., et. al.
    • 雑誌名

      Science 309

      ページ: 1052-1056

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Phytochrome B in the mesophyll delays flowering by suppressing FLOWERING LOCUS T expression in Arabidopsis vascular bundles2005

    • 著者名/発表者名
      Endo, M., et. al.
    • 雑誌名

      Plant Cell 17

      ページ: 1941-1952

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] TWIN SISTER OF FT(TSF)acts as a floral pathway integrator redundantly with FT2005

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, A., et. al.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol 46

      ページ: 1175-1189

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Ectopic expression of an FT homolog from Citrus confers an early flowering phenotype on trifoliate orange2005

    • 著者名/発表者名
      Endo, T., et. al.
    • 雑誌名

      Transgenic Res. 14

      ページ: 703-712

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] FD, a bZIP protein mediating signals from the floral pathway integrator FT at the shoot apex.2005

    • 著者名/発表者名
      Abe, M., et. al.
    • 雑誌名

      Science 309

      ページ: 1052-1056

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Phytochrome B in the mesophyll delays flowering by suppressing FLOWERING LOCUS T expression in Arabidopsis vascular bundles.2005

    • 著者名/発表者名
      Endo, M., et. al.
    • 雑誌名

      Plant Cell 17

      ページ: 1941-1952

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] TWIN SITSTER OF FT(TSF) acts as a floral pathway integrator redundantly with FT.2005

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, A., et. al.
    • 雑誌名

      PlantCell Physiol. 46

      ページ: 1175-1189

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Ectopic expression of an FT homolog from Citrus confers an early flowering phenotype on trifoliate orange.2005

    • 著者名/発表者名
      Endo, T., et. al.
    • 雑誌名

      Transgenic Res. 14

      ページ: 703-712

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] One-way control of FWA imprinting in Arabidopsis endosperm by DNA methylation2004

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita, T., et. al.
    • 雑誌名

      Science 303

      ページ: 521-523

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Genomic localization of endogenous mobile CACTA family transposons in natural variants of Arabidopsis thaliana2004

    • 著者名/発表者名
      Miura, A., et. al.
    • 雑誌名

      Molecular Genetics and Genomics 270

      ページ: 524-532

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Epigenetic control of CACTA transposon mobility in Arabidopsis thaliana2004

    • 著者名/発表者名
      Kato, M., et. al.
    • 雑誌名

      Genetics 168

      ページ: 961-969

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] BRU1,a novel link between resposes to DNA damage and epigenetic gene silencing in Arabidopsis2004

    • 著者名/発表者名
      Takeda, S., et. al.
    • 雑誌名

      Genes Dev. 18

      ページ: 783-793

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] One-way control of FWA imprinting in Arabidopsis endosperm by DNA methylation.2004

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita, T., et. al.
    • 雑誌名

      Science 305

      ページ: 521-523

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Genomic localization of endogenous mobile CACTA family transposons in natural variants of Arabidopsis thaliana.2004

    • 著者名/発表者名
      Miura, A., et. al.
    • 雑誌名

      Molecular Gemetics and Genomics 270

      ページ: 524-532

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Epigenetic control of CACTA transposon mobility in Arabidopsis thaliana.2004

    • 著者名/発表者名
      Kato, M., et. al.
    • 雑誌名

      Genetics 168

      ページ: 961-969

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] BRU1, a novel link between resposes to DNA damage and epigenetic gene silencing in Arabidopsis.2004

    • 著者名/発表者名
      Takeda, S., et. al.
    • 雑誌名

      Genes Dev. 18

      ページ: 783-793

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Role of CG and non-CG methylation in immobilization of transposons in Arabidopsis2003

    • 著者名/発表者名
      Kato, M., et. al.
    • 雑誌名

      Current Biology 13

      ページ: 421-426

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Role of CG and non-CG methylation in immobilization of transposons in Arabidopsis.2003

    • 著者名/発表者名
      Kato, M., et. al.
    • 雑誌名

      Current Biology 13

      ページ: 421-426

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] DNA methylation controls histone H3 lysine 9 methylation and heterochromatin assembly in Arabidopsis2002

    • 著者名/発表者名
      Soppe, W., et. al.
    • 雑誌名

      EMBO Journal 21

      ページ: 6549-6559

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Hd3a,a rice orthologof the Arabidopsis FT gene,promotes transition to flowering downstream of Hd1 under short-day condition2002

    • 著者名/発表者名
      Kojima, S., et. al.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol 43

      ページ: 1096-1105

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] DNA metylation controls histone H3 lysine 9 methylation and heterochromatin assembly in Arabidopsis.2002

    • 著者名/発表者名
      Soppe, W., et. al.
    • 雑誌名

      EMBO Journal 21

      ページ: 6549-6559

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Hd3a, a rice orthologof the Arabidopsis FT gene, promotes transition to flowering downstream of Hdl under short-day condition.2002

    • 著者名/発表者名
      Kojima, S., et. al.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol. 43

      ページ: 1096-1105

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より

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公開日: 2010-02-04  

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