• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2004 年度 研究成果報告書概要

網羅的SAGE解析とGICHIP開発による消化管癌の分子病態解明と診断応用

研究課題

研究課題/領域番号 15390116
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 人体病理学
研究機関広島大学

研究代表者

安井 弥  広島大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 教授 (40191118)

研究分担者 中山 宏文  広島大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教授 (50253068)
大上 直秀  広島大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助手 (60346484)
研究期間 (年度) 2003 – 2004
キーワードSAGE解析 / 消化管癌 / 胃癌 / Ex-STOMACHIP / 遺伝子多型 / CLDN18 / CDH17
研究概要

SAGE法を用いた消化管癌における網羅的遺伝子発現解析の内、5種類の胃癌についてSAGE解析を行い、38,903個のユニークtagを含む137,706発現tagを同定、世界最大のSAGEライブラリーを完成した(GEO accession number : GSE545)。胃癌と正常胃粘膜のライブラリーの比較及び定量的RT-PCR法により、APOC1,CEACAM6,YF13H12が高頻度に高発現し、早期癌と進行癌、原発巣と転移巣の比較から、FUS,CDH17,COL1A1,COL1A2,APOEが悪性度と相関することが確認された。さらに、胃癌特異的発現遺伝子候補をリストアップし、定量的RT-PCR法による実際の発現解析により、少なくとも8遺伝子が特異的に発現することを見い出した。SAGE法で抽出された遺伝子に、既知の癌関連遺伝子及び薬剤感受性のマーカー遺伝子を合わせた475遺伝子について、オリゴDNAアレイ(Ex-STOMACHIP)を作成、20例の胃癌組織について遺伝子発現を解析し、深達度、転移、組織型等を判別する有意な遺伝子群を抽出した。これらについて、定量的RT-PCR法にて多数症例について発現を検討し、発現レベルと臨床病理学的事項との関連を検証した。遺伝子多型解析については、約500例の血液DNA及び正常組織DNAを収集し、HER2やMMP-1などの既知遺伝子の多型と発癌や進展のリスクとの関連を明らかにした。さらに、SAGE法で新規に同定した胃癌で発現が抑制されている遺伝子CLDN18の5'UTRにG/AのSNPが存在することを見い出した。胃癌症例と健常対照症例におけるジェノタイプ解析を行ったところ、A/G及びG/G型が胃癌症例で有意に高頻度であり、ORは5.17(95%CI:2.01-13.3)であった。

  • 研究成果

    (48件)

すべて 2005 2004 2003

すべて 雑誌論文 (48件)

  • [雑誌論文] Loss of heterozygosity and histone hypoacetylation of the PINX1 gene are associated with reduced expression in gastric carcinoma2005

    • 著者名/発表者名
      Kondo, T.
    • 雑誌名

      Oncogene 24

      ページ: 157-164

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Histone H3 acetylation is associated with reduced p21^<WAF1/CIP1> expression in gastric carcinoma2005

    • 著者名/発表者名
      Mitani, Y.
    • 雑誌名

      J.Pathol. 205

      ページ: 65-73

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] A single nucleotide polymorphism of the MMP9 promoter affects tumor progression and invasive phenotype of gastric cancer2005

    • 著者名/発表者名
      Matsumura, S.
    • 雑誌名

      J.Cancer Res.Clin.Oncol. 131

      ページ: 19-25

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Loss of heterozygosity and histone hypoacetylation of the PINX1 gene are associated with reduced expression in gastric carcinoma2005

    • 著者名/発表者名
      Kondo T
    • 雑誌名

      Oncogene 24

      ページ: 157-164

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Histone H3 acetylation is associated with reduced p21^<WAF1/CIP1> expression in gastric carcinoma2005

    • 著者名/発表者名
      Mitani Y
    • 雑誌名

      J Pathol 205

      ページ: 65-73

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] A single nucleotide polymorphism of the MMP9 promoter affects tumor progression and invasive phenotype of gastric cancer2005

    • 著者名/発表者名
      Matsumura S
    • 雑誌名

      J Cancer Res Clin Oncol 131

      ページ: 19-25

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] A single nucleotide polymorphism in the MMP-1 promoter is correlated with histological differentiation of gastric cancer2004

    • 著者名/発表者名
      Matsumura, S.
    • 雑誌名

      J.Cancer Res.Clin.Oncol. 130

      ページ: 259-265

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Gene expression profile of gastric carcinoma : Identification of genes and tags potentially involved in invasion, metastasis and carcinogenesis by serial analysis of gene expression2004

    • 著者名/発表者名
      Oue, N.
    • 雑誌名

      Cancer Res. 64

      ページ: 2397-2405

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Search for new biomarkers of gastric cancer through serial analysis of gene expression and its clinical implication2004

    • 著者名/発表者名
      Yasui, W.
    • 雑誌名

      Cancer Sci. 95

      ページ: 385-392

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Expression of POT1 is associated with tumor stage and telomere length in gastric carcinoma2004

    • 著者名/発表者名
      Kondo, T.
    • 雑誌名

      Cancer Res. 64

      ページ: 523-529

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Frequent epigenetic inactivation of RIZ1 by promoter hypermethylation in human gastric carcinoma2004

    • 著者名/発表者名
      Oshimo, Y.
    • 雑誌名

      Int.J.Cancer 110

      ページ: 212-218

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Epigenetic inactivation of SOCS-1 by CpG island hypermethylation in human gastric carcinoma2004

    • 著者名/発表者名
      Oshimo, Y.
    • 雑誌名

      Int.J.Cancer 112

      ページ: 1003-1009

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Frequent loss of RUNX3 expression by promoter hypermethylation in gastric carcinoma2004

    • 著者名/発表者名
      Oshimo, Y.
    • 雑誌名

      Pathobiol. 71

      ページ: 137-143

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Expression of Cb1 linking with the epidermal growth factor receptor system is associated with tumor progression and poor prognosis of human gastric carcinoma2004

    • 著者名/発表者名
      Ito, R.
    • 雑誌名

      Virchow Arch. 444

      ページ: 324-331

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Presence of vascular adventitial fibroblastic cells in diffuse-type gastric carcinomas2004

    • 著者名/発表者名
      Nakayama, H.
    • 雑誌名

      J.Clin.Pathol. 57

      ページ: 970-972

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Hypoxia-inducible factor-1{alpha} polymorphisms associated with enhanced transactivation capacity, implying clinical significance2004

    • 著者名/発表者名
      Tanimoto, K.
    • 雑誌名

      Carcinogenesis 24

      ページ: 1779-1783

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] A single nucleotide polymorphism in the MMP-1 promoter is correlated with histological differentiation of gastric cancer2004

    • 著者名/発表者名
      Matsumura S
    • 雑誌名

      J Cancer Res Clin Oncol 130

      ページ: 259-265

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Gene expression profile of gastric carcinoma : Identification of genes and tags potentially involved in invasion, metastasis and carcinogenesis by serial analysis of gene expression2004

    • 著者名/発表者名
      Oue N
    • 雑誌名

      Cancer Res 64

      ページ: 2397-2405

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Search for new biomarkers of gastric cancer through serial analysis of gene expression and its clinical implication (Review article)2004

    • 著者名/発表者名
      Yasui W
    • 雑誌名

      Cancer Sci 95

      ページ: 385-392

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Expression of POT1 is associated with tumor stage and telomere length in gastric carcinoma2004

    • 著者名/発表者名
      Kondo T
    • 雑誌名

      Cancer Res 64

      ページ: 523-529

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Frequent epigenetic inactivation of RIZ1 by promoter hypermethylation in human gastric carcinoma2004

    • 著者名/発表者名
      Oshimo Y
    • 雑誌名

      Int J Cancer 110

      ページ: 212-218

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Epigenetic inactivation of SOCS-1 by CpG island hypermethylation in human gastric carcinoma2004

    • 著者名/発表者名
      Oshimo Y
    • 雑誌名

      Int J Cancer 112

      ページ: 1003-1009

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Frequent loss of RUNX3 expression by promoter hypermethylation in gastric carcinoma2004

    • 著者名/発表者名
      Oshimo Y
    • 雑誌名

      Pathobiol 71

      ページ: 137-143

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Expression of Cbl linking with the epidermal growth factor receptor system is associated with tumor progression and poor prognosis of human gastric2004

    • 著者名/発表者名
      Ito R
    • 雑誌名

      carcinoma Virchow Arch 444

      ページ: 324-331

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Presence of vascular adventitial fibroblastic cells in diffuse-type gastric carcinomas2004

    • 著者名/発表者名
      Nakayama H
    • 雑誌名

      J Clin Pathol 57

      ページ: 970-972

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Histone acetylation and gastrointestinal carcinogenesis2003

    • 著者名/発表者名
      Yasui, W.
    • 雑誌名

      Ann NY Acad Sci 983

      ページ: 220-231

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Expression of integrin-linked kinase is closely correlated with invasion and metastasis of gastric carcinoma2003

    • 著者名/発表者名
      Ito, R.
    • 雑誌名

      Virchow Arch 442

      ページ: 118-123

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Expression of the TSP-1 gene and its association with promoter hyper methylation in gastric carcinomas2003

    • 著者名/発表者名
      Oue, N.
    • 雑誌名

      Oncology 64

      ページ: 423-429

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] DNA methylation and histone acetylation status of HLTF gene are associated with reduced expression in gastric carcinoma2003

    • 著者名/発表者名
      Hamai, Y.
    • 雑誌名

      Cancer Sci 94

      ページ: 692-698

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Expression of osteoprotegerin correlates with aggressiveness and poor prognosis of gastric carcinoma2003

    • 著者名/発表者名
      Ito, R.
    • 雑誌名

      Virchow Arch 443

      ページ: 146-151

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] A single nucleotide polymorphism in the transmembrane domain coding region of HER-2 is associate with development and malignant phenotype of gastric cancer2003

    • 著者名/発表者名
      Kuraoka, K.
    • 雑誌名

      Int J Cancer 107

      ページ: 593-596

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Rapid and preferential induction of ATF3 transcription in response to low doses of UVA light2003

    • 著者名/発表者名
      Abe, T.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun 310

      ページ: 1168-1174

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] The promoter methylation status of the DNA repair gene O6-methylguanine-DNA methyltransferase in ulcerative colitis2003

    • 著者名/発表者名
      Matsumura, S.
    • 雑誌名

      Virchow Arch 443

      ページ: 518-523

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] DNA methylation of multiple genes in gastric carcinoma : association with histological type and CpG island methylator phenotype2003

    • 著者名/発表者名
      Oue, N.
    • 雑誌名

      Cancer Sci 94

      ページ: 901-905

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Helicobacter Pylori infection influences expression of genes related to angiogenesis and invasion in human gastric carcinoma cells2003

    • 著者名/発表者名
      Kitadai, Y.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun 311

      ページ: 809-814

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Helicobacter pylori infection is closely associated with telomere reduction in gastric mucosa2003

    • 著者名/発表者名
      Kuniyasu, H.
    • 雑誌名

      Oncology 65

      ページ: 275-282

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] Histone acetylation and gastrointestinal carcinogenesis (Review article)2003

    • 著者名/発表者名
      Yasui W
    • 雑誌名

      Ann NY Acad Sci 983

      ページ: 220-231

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Expression of integrin-linked kinase is closely correlated with invasion and metastasis of gastric carcinoma2003

    • 著者名/発表者名
      Ito R
    • 雑誌名

      Virchow Arch 442

      ページ: 118-123

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Expression of the TSP-1 gene and its association with promoter hypermethylation in gastric carcinomas2003

    • 著者名/発表者名
      Oue N
    • 雑誌名

      Oncology 64

      ページ: 423-429

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] DNA methylation and histone acetylation status of HLTF gene are associated with reduced expression in gastric carcinoma2003

    • 著者名/発表者名
      Hamai Y
    • 雑誌名

      Cancer Sci 94

      ページ: 692-698

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Expression of osteoprotegerin correlates with aggressiveness and poor prognosis of gastric carcinoma2003

    • 著者名/発表者名
      Ito R
    • 雑誌名

      Virchow Arch 443

      ページ: 146-151

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] A single nucleotide polymorphism in the transmembrane domain coding region of HER-2 is associated with development and malignant phenotype of gastric cancer2003

    • 著者名/発表者名
      Kuraoka K
    • 雑誌名

      Int J Cancer 107

      ページ: 593-596

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Rapid and preferential induction of ATF3 transcription in response to low doses of UVA light2003

    • 著者名/発表者名
      Abe T
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun 310

      ページ: 1168-1174

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] The promoter methylation status of the DNA repair gene O6-methylguanine-DNA methyltransferase in ulcerative colitis2003

    • 著者名/発表者名
      Matsumura S
    • 雑誌名

      Virchow Arch 443

      ページ: 518-523

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] DNA methylation of multiple genes in gastric carcinoma : association with histological type and CpG island methylator phenotype2003

    • 著者名/発表者名
      Oue N
    • 雑誌名

      Cancer Sci 94

      ページ: 901-905

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Hypoxia-inducible factor-1{alpha} polymorphisms associated with enhanced transactivation capacity, implying clinical significance2003

    • 著者名/発表者名
      Tanimoto K
    • 雑誌名

      Carcinogenesis 24

      ページ: 1779-1783

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Helicobacter Pylori infection influences expression of genes related to angiogenesis and invasion in human gastric carcinoma cells.2003

    • 著者名/発表者名
      Kitadai Y
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun 311

      ページ: 809-814

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [雑誌論文] Helicobacter pylori infection is closely associated with telomere reduction in gastric mucosa2003

    • 著者名/発表者名
      Kuniyasu H
    • 雑誌名

      Oncology 65

      ページ: 275-282

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より

URL: 

公開日: 2006-07-11  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi