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2004 年度 実績報告書

低分子化した混合斑痕試料に有用なマルチプレックス型判定システムの構築及び評価

研究課題

研究課題/領域番号 15590577
研究機関名古屋大学

研究代表者

山本 敏充  名古屋大学, 大学院・医学系研究科, 助教授 (50260592)

研究分担者 勝又 義直  名古屋大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (30109326)
打樋 利英子  名古屋大学, 大学院・医学系研究科, 助手 (20223571)
玉木 敬二  京都大学, 大学院・医学研究科, 教授 (90217175)
キーワードSTR / 混合斑痕 / マルチプレックス / 低分子化DNA / 日本人 / 遺伝的多型
研究概要

本年度は、昨年度作製したトリプレックス(Penta E及びD、並びにD10S2325)に新たに加えるべくローカスの選択を試みた。その一方で、本年度初めにPromega社から市販された"Penta BEC Multiplex kit"の有用性について評価・検討した。日本人300人におけるアリール頻度を算出し、識別力を検討したところ、3ローカス全てでHardy-Weinberg平衡からの乖離は認められず、各PD値は、全て0.9以上という高い値であった。また、総合PD値は0.99991、総合PE値は0.96531となり、このシステムは、日本人において、高い識別力を有していることが判明した。さらに、各アリールのstutterピーク比を計算したところ、グローバルに利用されているtetranucleotideと比較して、pentaucleotideのstutterピーク比は低く、ピーク比はアリールのリピート数と正の相関関係にあることがわかり、平均値から±3倍のSD値の範囲内に、ほとんどのサンプルのピーク比は分布した。
本研究の本来の目的である4ローカスのマルチプレックス化には、Penta Bローカスを選択して、低分子化用のプライマーを設計しなおし、マルチプレックス化を試みた。このマルチプレックスシステムは、アレリックラダーマーカーの一部を除きほぼ完成し、その評価の一部をstutterピーク比で行った。また、日本の3地域から秋田200名、名古屋300名、大分175名について、タイピングし、アリール頻度を算出し、ハーディ・ワインベルグ平衡の検定を行ったところ乖離がみられたものはなかった。ヘテロ接合度は0.77以上、PD値は0.92以上であった。さらに、地域間の有意差を統計学的に検定したところ、秋田-大分間で2ローカス、秋田-名古屋並びに名古屋-大分間でそれぞれ1ローカスにおいて有意差が認められた。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2004

すべて 雑誌論文 (4件)

  • [雑誌論文] Mutations in 14 Y-STR loci among Japanese father-son haplotypes.2004

    • 著者名/発表者名
      R.Kurihara
    • 雑誌名

      Int.J.Legal Med. 118

      ページ: 125-131

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] 日本近隣ヒト集団における105ローカスのSTR多型分析2004

    • 著者名/発表者名
      李士林
    • 雑誌名

      DNA多型 12

      ページ: 225-227

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] STRマーカーにより診断された二精子性全胞状奇胎を伴う二胎児例2004

    • 著者名/発表者名
      山本敏充
    • 雑誌名

      DNA多型 12

      ページ: 273-275

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [雑誌論文] ヒト遺伝情報の取り扱いについての世界基準について2004

    • 著者名/発表者名
      勝又義直
    • 雑誌名

      DNA多型 12

      ページ: 283-287

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公開日: 2006-07-12   更新日: 2016-04-21  

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