2003 年度実績報告書

ニホンウズラにおける遺伝連鎖地図と比較染色体地図の作製

研究課題

研究課題/領域番号	15780181
研究機関	神戸大学
研究代表者	万年英之神戸大学, 農学部, 助教授 (20263395)
キーワード	日本ウズラ / 連鎖地図 / マッピング / 機能遺伝子 / 筋ジストロフィー / 比較染色体地図 / シンテニー / ニューロフィラメント欠損症
研究概要	本研究は最小の家禽であるニホンウズラ(Coturnix japonica)の遺伝連鎖地図の構築を目的としている。近年、家畜・家禽においても遺伝子地図の構築が急速に進められているが、鳥類の実験動物および経済動物として多くの利点を有する日本ウズラについては遺伝子連鎖地図の構築が行われてこなかった。この観点から申請者は1)AFLP(amplified fragment length polymorphisim)法を用いたニホンウズラの連鎖地図構築に取り組む、2)数多くの機能遺伝子をこの連鎖地図上に位置付ける、3)ヒトやニワトリとの比較染色体分析を行い、相同染色体領域を同定する、の3点を目的としている。本年度では、AFLP法よるマーカー数を増加し、これまでの600マーカーから1883マーカーに増やすことに成功し、かなり高密度な連鎖グループの構築に成功した。しかしマーカーの同一遺伝子座での重複が数多く認められたために、実際のマーカー数としては661となった。この地図は58の連鎖グループからなり、その全長は3418cMであった。次にニワトリで既知のマイクロサテライトマーカーが日本ウズラの連鎖地図作製に有効かを検討した。200のマイクロサテライトマーカーの増幅を日本ウズラで試みたが、増幅不可能なものや多数バンドが検出されるため、多くのマーカーではその利用が不可能であった。20のマーカーにおいて良好な増幅と使用家系において多型が認められたために、これらを連鎖グループにマッピングした。さらに新たに開発した機能遺伝子マーカー9つのマッピングに成功した。そのうち、ニワトリ第1染色体にマップされている遺伝子では本連鎖グループ第一に、またニワトリ第2染色体上の遺伝子は連鎖グループ第2に位置付けられ、ニワトリと日本ウズラ間で染色体のシンテニーが認められた。本家系は筋ジストロフィーとニューロフィラメント欠損の表現型を持ち、これらと連鎖グループ間での連鎖解析を行ったところ、ニューロフィラメント欠損は第6連鎖群に位置付けられ、また筋ジストロフィー表現型とは連鎖が認められなかった。マーカー数は連鎖グループにおける遺伝子座の重複から十分であると考えられるため、次年度は機能遺伝子のマッピングに力を注ぎ、ニワトリやヒトの染色体間での相同性を検出すると共に、その染色体進化について考察する予定である。

研究成果

(7件)

すべてその他

すべて文献書誌 (7件)

[文献書誌] Mannen, H.: "Isolation and Linkage Mapping of Coding Sequences from Chicken Cosmids by Exon Trapping"Asian-Aust.J.Anim.Sci.. 17. 309-312 (2004)
[文献書誌] Mannen, H.: "Independent Mitochondrial Origin and Historical Genetic Differentiation of North Eastern Asian Cattle"Mol.Phylogenet.Evol.. 未定. (2004)
[文献書誌] Tsuji, S: "An association study using AFLP markers and application to a beef cattle breeding population"Anim.Genet.. 35. 40-43 (2004)
[文献書誌] Yoshizawa, K.: "Analyses of beta-1 syntrophin, syndecan 2 and Gem GTPase as candidates for chicken muscular dystrophy"Exp.Anim.. 52. 391-396 (2003)
[文献書誌] Sultana, S.: "Mitochondrial DNA diversity of Pakistani goats"Anim.Genet.. 34. 417-421 (2003)
[文献書誌] H.Mannen: "Identification of mitochondrial DNA substitutions related to meat quality in Japanese Black cattle"J.Anim.Sci.. 81. 68-72 (2003)
[文献書誌] 万年英之: "動物遺伝育種学事典"シュプリンガーフェアラーク東京. 636 (2001)

2003 年度 実績報告書

ニホンウズラにおける遺伝連鎖地図と比較染色体地図の作製

研究代表者

万年 英之 神戸大学, 農学部, 助教授 (20263395)

研究成果

[文献書誌] Mannen, H.: "Isolation and Linkage Mapping of Coding Sequences from Chicken Cosmids by Exon Trapping"Asian-Aust.J.Anim.Sci.. 17. 309-312 (2004)

[文献書誌] Mannen, H.: "Independent Mitochondrial Origin and Historical Genetic Differentiation of North Eastern Asian Cattle"Mol.Phylogenet.Evol.. 未定. (2004)

[文献書誌] Tsuji, S: "An association study using AFLP markers and application to a beef cattle breeding population"Anim.Genet.. 35. 40-43 (2004)

[文献書誌] Yoshizawa, K.: "Analyses of beta-1 syntrophin, syndecan 2 and Gem GTPase as candidates for chicken muscular dystrophy"Exp.Anim.. 52. 391-396 (2003)

[文献書誌] Sultana, S.: "Mitochondrial DNA diversity of Pakistani goats"Anim.Genet.. 34. 417-421 (2003)

[文献書誌] H.Mannen: "Identification of mitochondrial DNA substitutions related to meat quality in Japanese Black cattle"J.Anim.Sci.. 81. 68-72 (2003)

[文献書誌] 万年 英之: "動物遺伝育種学事典"シュプリンガーフェアラーク東京. 636 (2001)

2003 年度実績報告書

万年英之神戸大学, 農学部, 助教授 (20263395)

[文献書誌] 万年英之: "動物遺伝育種学事典"シュプリンガーフェアラーク東京. 636 (2001)