| 研究課題/領域番号 |
15H02637
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| 研究機関 | 京都大学 |
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研究代表者 |
曽田 貞滋 京都大学, 理学研究科, 教授 (00192625)
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| 研究分担者 |
池田 紘士 弘前大学, 農学生命科学部, 准教授 (00508880)
高見 泰興 神戸大学, 人間発達環境学研究科, 准教授 (60432358)
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| 研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2020-03-31
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| キーワード | 甲虫類 / 全球的分散 / 飛翔多型 / 種多様性 / 分子系統 |
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| 研究実績の概要 |
（１）分析試料のサンプリング
12月にイタリア，サルディニア島，スペイン，テネリフェ島でサンプリングを行い，系統解析において分岐年代のカリブレーションに用いるCarabus geneiとCarabus abbreviatus, およびこれまでサンプルがなかったHeterotemna属のヒラタシデムシを採集した．ハンミョウ亜科についてはアジア，アフリカ，ニューカレドニアにおいてサンプリングを行った．この他，アルメニアの共同研究者を通して，未入手であったAclypea属のヒラタシデムシ，カタビロオサムシ亜族のCalosoma属Callisthenes亜属，およびオサムシ亜族数種（Carabus属Procerus, Tribax, Lipaster, Sphodristocarabus）のサンプルを入手した．
（２）RNAシーケンスによる分子系統解析
これまでに得られたサンプルのうち，今年度はオサムシ亜科カタビロオサムシ亜族2種・オサムシ亜族１種，ハンミョウ亜科19種，外群のオサムシ科5種（マルクビゴミムシ亜科，ホソクビゴミムシ亜科，ヒョウタンゴミムシ亜科，ゴモクムシ亜科），合計27個体について，Illumina HiSeqによるpaired endライブラリーのシーケンスを行った．前年度にシーケンスしたデータもあわせて，Trinityによるアセンブル・contig作成と，Yang & Smithの方法にしたがって，アミノ酸配列に基づくオーソロガスな遺伝子の探索・配列マトリクスの作成を行い，最尤法による系統解析を行った．
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
３年目までに，分析対象の甲虫３グループに着いて，必須的な分類群の分析対象種をほとんど入手することができた．残りの２年間で，さらに重要な種を採集し、分子系統解析を行って全球的分散・多様化過程を推定する目処がたっていることから，順調に進展していると言える．
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| 今後の研究の推進方策 |
今後のサンプル収集は，大陸によってサンプルが欠けているもの，トピック的に興味深い種，重要な外群を対象にする．RNAサンプルが得にくい種については，エタノール固定サンプルから，保存的なエクソンシーケンスのデータを取得する方法を利用する．
分子系統解析，分岐年代推定を本格的に進め，分散・多様化過程を推定し，２年以内の論文発表をめざす．
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