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2018 年度 実績報告書

豚レンサ球菌症発症要因解析のための豚口腔内微生物動態解析

研究課題

研究課題/領域番号 15H02651
研究機関東京大学

研究代表者

関崎 勉  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (70355163)

研究分担者 大澤 朗  神戸大学, 農学研究科, 教授 (10253189)
中川 一路  京都大学, 医学研究科, 教授 (70294113)
渡辺 孝康  日本大学, 歯学部, 助教 (70725514)
黒木 香澄 (石田香澄)  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特別研究員 (80760272)
遠矢 真理  順天堂大学, 医学部, 助教 (20804694)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2019-03-31
キーワード豚レンサ球菌 / 口腔内細菌叢 / 微生物動態 / 感染症
研究実績の概要

2018年9月までに,ベトナムおよびタイの農場訪問と試料収集を行い,さらに2019年3月に,ベトナムの農場を訪問し,試料収集,収集した試料の処理,塩基配列決定,決定した配列の情報処理,研究成果とりまとめを行う予定であったが,アフリカ豚熱がアジア諸国で流行し,2019年3月初頭にはベトナムにも侵入したため,当初予定していた農場訪問ができなくなった。そこで,計画をもう1年延長するとともに,2019年3月の訪問では,農場を直接訪問するのはとりやめ,豚の糞便を農家から送付してもらい,それを利用した薬剤耐性菌の調査を実施することに変更した。薬剤耐性菌については,これまで分担者の大澤が基礎的調査を進めており,その成績を参考にして,広域スペクトラムβラクタマーゼ(ESBL)産生大腸菌の調査を行った。選択培地としてDHL寒天培地を用い,cefotaxime (ctx)を1microgram/ml添加した培地に糞便を接種し,3農場から採集した豚糞便を摂取し,発育してきた赤色コロニーを分離,純培養した。急な予定変更で動物検疫の許可を取れなかったため,分離した菌株はベトナムの研究室に保存した。2019年9月に訪問した際,簡易同定キットを用いて保存した菌株の菌種同定を行った。その結果,A農場の20頭中3頭から6株,B農場の20頭中10頭から10株,C農場の16頭中12頭から15株のESBL産生大腸菌が分離でき,これらを日本に持ち帰って,MLST解析を行ったところ,3農場から分離した菌はそれぞれ異なるタイプで,しかも過去にヒトの感染症として報告されたタイプとも異なる新しいタイプの菌であった。

現在までの達成度 (段落)

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (13件)

すべて 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 3件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] Non Lam University(ベトナム)

    • 国名
      ベトナム
    • 外国機関名
      Non Lam University
  • [国際共同研究] Kasetsart University(タイ)

    • 国名
      タイ
    • 外国機関名
      Kasetsart University
  • [雑誌論文] 16S rRNA Gene Amplicon Sequence Data from Chicken Cecal Feces from Vietnam and Thailand.2019

    • 著者名/発表者名
      Takeshita N, Kim H, Witoonsatian K, Tohya M, Vo TH, Boonyong N, Nguyen TPB, Nakagawa I, Meekhanon N, Nguyen NH, Sekizaki T
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcement

      巻: 8 ページ: e00781-19

    • DOI

      doi:10.1128/MRA.00781-19

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Characterization of pig saliva as the major natural habitat of Streptococcus suis by analyzing oral, fecal, vaginal, and environmental microbiota.2019

    • 著者名/発表者名
      Murase K, Watanabe T, Arai S, Kim H, Tohya M, Ishida-Kuroki K, Vo TH, Nguyen TPB, Nakagawa I, Osawa R, Nguyen NH, Sekizaki T
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 14 ページ: e0215983

    • DOI

      doi:10.1371/journal.pone.0215983

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Functional dysbiosis within dental plaque microbiota in cleft lip and palate patients.2019

    • 著者名/発表者名
      Funahashi K, Shiba T, Watanabe T, Muramoto K, Takeuchi Y, Ogawa T, Izumi Y, Sekizaki T, Nakagawa I, Moriyama K
    • 雑誌名

      Progress in Orthodontics

      巻: 20 ページ: 11

    • DOI

      doi: 10.1186/s40510-019-0265-1

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] High rate misidentification of biochemically determined Streptococcus isolates from swine clinical specimens.2019

    • 著者名/発表者名
      Meekhanon N, Kaewmongkol S, Jirawattanapong P, Kaminsonsakul T, Kongsoi S, Chumsing S, Okura M, Ueno Y, Sekizaki T, Takamatsu D
    • 雑誌名

      Journal of Veterinary Medical Sciences

      巻: 81 ページ: 567-572

    • DOI

      doi: 10.1292/jvms.18-0678

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] ブタの感染性心内膜炎から分離した Streptococcus suis の性状2020

    • 著者名/発表者名
      関崎 勉
    • 学会等名
      第93回日本細菌学会総会
  • [学会発表] 新たな汚染指標細菌候補であるStreptococcus suisの豚肉フードチェーン内汚染状況調査2020

    • 著者名/発表者名
      黒木香澄,仁田義弘,門屋亨介,関崎 勉
    • 学会等名
      第93回日本細菌学会総会
  • [学会発表] Genome comparison of the capsule-negative Streptococcus suis isolates from endocarditis.2019

    • 著者名/発表者名
      Dozaki S, Suzuki E, Tohya M, Watanabe T, Kuroki K, Sekizaki T
    • 学会等名
      The 4th International Workshop on Streptococcus suis
    • 国際学会
  • [学会発表] 豚心内膜炎病変部由来Streptococcus suisの比較ゲノム解析による無莢膜菌出現理由の推測2019

    • 著者名/発表者名
      堂崎真一,遠矢真理,渡辺孝康,鈴木詠律子,黒木香澄,関崎 勉
    • 学会等名
      第162回日本獣医学会学術集会
  • [学会発表] 豚肉フードチェーン内の網羅的な細菌汚染状況調査とStreptococcus suisの汚染指標細菌としての有用性の検証2019

    • 著者名/発表者名
      黒木香澄,仁田義弘,門屋亨介,関崎 勉
    • 学会等名
      第162回日本獣医学会学術集会
  • [学会発表] 比較ゲノム解析から推測する豚心内膜炎病変部由来Streptococcus suisでの無莢膜菌の出現理由2019

    • 著者名/発表者名
      堂崎真一,遠矢真理,渡辺孝康,鈴木詠律子,黒木香澄,関崎 勉
    • 学会等名
      第51回Lancefieldレンサ球菌研究会
  • [学会発表] 豚肉フードチェーン内の細菌叢解析による新たな汚染指標細菌Streptococcus suisの有用性の検証2019

    • 著者名/発表者名
      黒木香澄,仁田義弘,門屋亮介,関崎 勉
    • 学会等名
      第51回Lancefieldレンサ球菌研究会

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公開日: 2021-01-27  

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