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2015 年度 実績報告書

アーキアべん毛研究の基盤構築

研究課題

研究課題/領域番号 15H04364
研究機関学習院大学

研究代表者

西坂 崇之  学習院大学, 理学部, 教授 (40359112)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2019-03-31
キーワードarchaea / archaella / アーキアべん毛 / 回転分子モーター / IV型分泌装置 / Halobacterium salinarum
研究実績の概要

本研究の目的は、生命科学の未踏の領域である「古細菌(archaea、アーキア)遊泳の分子メカニズム」を解明することである。極限環境で生息するアーキアのべん毛は、理解が進んでいる真核生物の分子モーターや大腸菌の回転モーターと異なり、分泌装置がベースとなったATP駆動による独自の運動機構を備えていると考えられている。細菌学のみならず、生物物理・進化・タンパク質科学・ナノマシンデザインからも注目すべき課題であるはずだが、培養条件や実験の再現性の難しさから、未だ大きな進展は見られていない。本課題により、アーキアモーターという新しい研究分野を開拓する。
本年度においては、以下の2項目について研究を進めた。
(1)【再現性のある培養条件の検討】高熱・高塩分・嫌気環境など、いわば極限的な環境に適応した生物であるアーキアの培養は容易ではなく、増殖したとしても、再現性良く遊泳が観察できる状態にまで持って行くことは難しい。Halobacterium salinarum をモデル生物として、条件検討を行った。従来の研究では培養に peptone medium を用いていたが、これを casamino acid medium に変更したところ、85%の細胞が滑らかな遊泳を行う条件を決めることができた。
(2)【滑走装置がダメージを受けていない個体における遊泳の観察】上記の条件検討を行うに当たり、培養サンプルを回収する過程にも注意を払い、観察条件を絞り込んだ。べん毛や回転装置がたやすく損傷を受けるため、回収には“コツ”のようなものが必要だということが分かった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

再現性のある実験方法が確立したことにより、細胞本体の回転・べん毛の回転について、これまで研究室で培ってきた1分子観察技術を応用することにより高い精度で計測するための準備が整った。既に全段階的な結果は得られており、学会発表および論文投稿に近い状況にまで到達している。

今後の研究の推進方策

残りの研究機関において、以下の7つの研究項目を進める予定である。①電子顕微鏡によるアーキアべん毛の観察。②クライオ電子顕微鏡法によるべん毛基部の観察。③光学顕微鏡下でのべん毛の可視化。④べん毛回転の3次元定量化。⑤テザードセルの作製。⑥回転ステップの観察。⑦制御機構の解明。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] F1-ATPase conformational cycle from simultaneous single-molecule FRET and rotation measurements2016

    • 著者名/発表者名
      Sugawa, M. Okazaki, K. Kobayashi, M. Matsui, T. Hummer, G. Masaike, T. Nishizaka, T.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 113 ページ: E2916-24

    • DOI

      10.1073/pnas.1524720113

    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Directed binding of gliding bacterium, Mycoplasma mobile, shown by detachment force and bond lifetime2016

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, A. Nakane, D. Mizutani, M. Nishizaka, T. Miyata, M.
    • 雑誌名

      mBio

      巻: 0 ページ: 0

    • DOI

      0

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Torque generation by axonemal outer-arm dynein2015

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, S. Saito, K. Sutoh, M. Nishizaka, T. Toyoshima, Y. Y. Yajima, J.
    • 雑誌名

      Biophys J

      巻: 108 ページ: 872-9

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2014.12.038

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three-dimensional superlocalization imaging of gliding Mycoplasma mobile by extraordinary light transmission through arrayed nanoholes2015

    • 著者名/発表者名
      Lee, W. Kinosita, Y. Oh, Y. Mikami, N. Yang, H. Miyata, M. Nishizaka, T. Kim, D.
    • 雑誌名

      ACS Nano

      巻: 9 ページ: 10896-908

    • DOI

      10.1021/acsnano.5b03934

    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Bacteriocin protein BacL1 of Enterococcus faecalis targets cell division loci and specifically recognizes L-Ala2-cross-bridged peptidoglycan2015

    • 著者名/発表者名
      Kurushima, J. Nakane, D. Nishizaka, T. Tomita, H.
    • 雑誌名

      J Bacteriol

      巻: 197 ページ: 286-95

    • DOI

      10.1128/JB.02203-14

    • 査読あり
  • [学会発表] Unitary Steps of Supermolecular Motility Machineries in Gliding Bacteria and Swimming Arcaea2016

    • 著者名/発表者名
      Kinosita, Yoshiaki Nakane, Daisuke Uchida, Nariya Miyata, Makoto Nishizaka, Takayuki
    • 学会等名
      Biophyscial Society 60th Annual Meeting
    • 発表場所
      Los Angeles Convention Center, Los Angeles, California
    • 年月日
      2016-02-27 – 2016-03-02
    • 国際学会
  • [学会発表] Real-time imaging of a polymorphism, rotation rate and stepwise rotation of archaeal flagella (archaella)2016

    • 著者名/発表者名
      Kinosita, Y Uchida, N Nakane, D Nishizaka, T
    • 学会等名
      Sensory transduction in Microorganism (Gordon conference)
    • 発表場所
      January 17-22, 2016
    • 年月日
      2016-01-17 – 2016-01-22
    • 国際学会
  • [学会発表] Detection of rotation of archaeal flagella under advanced optical microscopes2015

    • 著者名/発表者名
      Kinosita, Yoshiaki Nakane, Daisuke Nishizaka, Takayuki
    • 学会等名
      Pacifichem 2015
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Mechanics of Motor Proteins and Supermolecular Motility Machinery Revealed under Advanced Optical Microscopes2015

    • 著者名/発表者名
      西坂崇之
    • 学会等名
      WPI-next international workshop ~~High resolution cell biology~~
    • 発表場所
      E & S building, Nagoya Univ.
    • 年月日
      2015-10-01 – 2015-10-01
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] シンポジウム「べん毛・繊毛が織りなす多様な生命現象に挑む ~分子から個体まで~ Diverse functions of flagella and cilia; -From molecules to mammalian development-」 先進光学顕微鏡により明らかになる繊毛とアーキアべん毛の力学機能 Mechanical function of cilia and archaeal flagella resolved by advanced optical microscopes2015

    • 著者名/発表者名
      西坂崇之
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学 角間キャンパス 自然科学本館
    • 年月日
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [図書] Katoh, T. A. Fujimura, S. Nishizaka, T.2015

    • 著者名/発表者名
      Katoh, T. A. Fujimura, S. Nishizaka, T.
    • 総ページ数
      15
    • 出版者
      Springer

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公開日: 2017-01-06  

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