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2017 年度 実績報告書

アーキアべん毛研究の基盤構築

研究課題

研究課題/領域番号 15H04364
研究機関学習院大学

研究代表者

西坂 崇之  学習院大学, 理学部, 教授 (40359112)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2019-03-31
キーワードアーキアべん毛 / アーキアラ / ハロアーキア / IV型分泌装置
研究実績の概要

生命科学の未踏の領域である「古細菌(Archaea、アーキア)遊泳の分子メカニズム」を解明する。運動装置の構造、それが生み出す流体への推進力の定量化、さらには、装置の単位素子が生み出すステップを検出し、新規の分子モーターにおける化学―力学共役の詳細を明らかにする。
極限環境で生息するアーキアべん毛は、理解が進んでいる真核生物の分子モーターや大腸菌の回転モーターと異なり、分泌装置がベースとなったATP駆動による独自の運動機構を備えていると考えられている。細菌学のみならず、生物物理・進化・タンパク質科学・ナノマシンデザインからも注目すべき課題であるはずだが、培養条件や実験の再現性の難しさから、未だ大きな進展は見られていない。本課題により、アーキアモーターという新しい研究分野を開拓する。
平成28年度において、アーキアに関する重要な成果については原著論文として取りまとめることができたため、29年度では、アーキアべん毛がバクテリアにおいて機能している「シアノバクテリアのIV型線毛」について研究を進めた。アーキアモーターを対象にした研究で開発された様々な顕微鏡技術に加え、照射する光の方向性を制御するという新しい切り口を加えた。この新しい技術によって、走光性を持つバクテリア(Synechocystis sp. PCC6803)の運動が制御される仕組みの基礎を解明することに成功した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

本課題は申請段階では、ハロバクテリア・サリナラムもしくはハロバクテリア・ボルカニというアーキアを研究対象にしてスタートしており、2016年度に生物物理学の分野で初めて報告することができた(Nature Microbiologyに掲載)。またそこで開発されている観察方法や解析手法は、他のバクテリアの微生物であるスピロプラズマ、シネコシスティス、サーマス・サーモフィラスといったさまざまな研究対象に派生し、米アカデミー紀要といった一流科学誌に原著論文として発表された。本課題で産み落とされた独自の顕微鏡技術が、バクテリア運動という分野にあますところなく応用され、そして新しい生物物理学として結実する独自の研究の方向性が示されつつある。

今後の研究の推進方策

アーキアラ・モーターが発生するトルクの3次元精密測定を実現する。現在進んでいる前段階的な測定では、アーキアラ・モーターは速度一定型であることが示唆されているが、興味深いことに、これは入力がATPの化学エネルギーである点と矛盾する。恐らくは、アーキアべん毛自体の粘性抗力に対する寄与が予想より高く(バクテリアの測定ではこの点は無視されることが多い)、結果の解釈に対して、理論が十分に追い付いていないためだと考えられる。実験サイドから、流体の粘度の調製やべん毛の長さの可視化などを通じてより正確な見積もりを行い、必要に応じ、共同研究者の助けを借りながら理論を補強する。

  • 研究成果

    (10件)

すべて 2018 2017

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 6件、 招待講演 4件)

  • [雑誌論文] Detailed Analyses of Stall Force Generation in Mycoplasma mobile Gliding2018

    • 著者名/発表者名
      Mizutani Masaki、Tulum Isil、Kinosita Yoshiaki、Nishizaka Takayuki、Miyata Makoto
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 114 ページ: 1411~1419

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2018.01.029

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Unforeseen swimming and gliding mode of an insect gut symbiont, Burkholderia sp. RPE64, with wrapping of the flagella around its cell body2018

    • 著者名/発表者名
      Kinosita, Y. Kikuchi, Y. Mikami, N. Nakane, D. Nishizaka, T.
    • 雑誌名

      ISME J

      巻: 12 ページ: 838-848

    • DOI

      10.1038/s41396-017-0010-z

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Asymmetric distribution of type IV pili triggered by directional light in unicellular cyanobacteria2017

    • 著者名/発表者名
      Nakane, D. Nishizaka, T.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci USA

      巻: 114 ページ: 6593-6598

    • DOI

      10.1073/pnas.1702395114

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] "Single-molecule detection of biomolecules and protein conformational dynamics."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T Fujimura, S. Sohma, Y. Nakane, D
    • 学会等名
      第55回 日本生物物理学会年会
  • [学会発表] "Development of optical-microscope techniques for single-molecule biophysics and their application to microbiology."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      10th International Conference on Advanced Materials and Devices
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] "Development of Imaging Techniques to Reveal Singl-Protein Dynamics and their Application to Microbiology."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      International Symposium on Fluctuation and Structure out of Equilibrium 2017
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] “Development of Techniques for Single-Molecule Detection of Protein Conformational Dynamics and Their Application to Microbiology.”2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      The 2nd Korea-Japan Joint Symposium on Single-Molecule Biophysics
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] "Direct observation of dynamics in Type IV pili system and archaella motor."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      19th IUPAB congress and 11th EBSA congress
    • 国際学会
  • [学会発表] "Development of imaging techniques to reveal single-protein dynamics and their application to microbiology."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      Telluride Science Research Center Workshop on Protein Dynamics
    • 国際学会
  • [学会発表] "Application of single-molecule techniques to supramolecular machinery in bacteria and archaea."2017

    • 著者名/発表者名
      Nishizaka, T.
    • 学会等名
      The 15th International Conference of “Na,K-ATPases and Related Transport ATPases”
    • 国際学会 / 招待講演

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公開日: 2018-12-17  

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