研究課題/領域番号 |
15H04410
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研究機関 | 北海道大学 |
研究代表者 |
増田 隆一 北海道大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (80192748)
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研究分担者 |
大舘 智志 北海道大学, 低温科学研究所, 助教 (60292041)
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研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2019-03-31
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キーワード | ヒグマ / ユーラシア / 多様性 / 起源 / 系統地理学 |
研究実績の概要 |
バルカン半島に位置するブルガリアにおける古代ヒグマの系統的位置を明らかにするするため、ブルガリア国立自然史博物館およびトラキア大学農学部を訪問し、先方の海外共同研究者とともに古い毛皮標本、および洞窟や遺跡からの出土骨の標本調査を行った。各研究機関に種々の状態の古代ヒグマ標本が保管されていることがわかった。 すでに代表者らが現生のアジア産ヒグマのミトコンドリア全ゲノム遺伝情報を用いて開発し公表したamplified product length polymorphism (APLP)法を用いて、ブルガリアのヒグマ出土骨DNAについてマルチプレックス遺伝子増幅法(PCR)を試みた。その際に、適切な反応条件を調整することにより、効率的なPCR増幅を行うことが可能となった。その結果、ブルガリア集団に特異的な複数の単一塩基多型サイト(SNP)を検出し、アジア産ヒグマの遺伝情報との違いを見出すことができた。現在のところ、ブルガリアの古代ヒグマには、同じ系列のミトコンドリアDNAハプログループが検出されている。 APLP法に加え、従来のミトコンドリアDNAコントロール領域のPCRダイレクトシーケンス法による解析も同時並行で進めているが、分析成功率はAPLP法の方が良好であることが判明した。 さらに、ユーラシア南部であるイランにあるペルシャ野生動物遺産財団の野生動物専門員を招聘し、イランにおけるヒグマを含む野生動物の多様性について研究打ち合わせを行った。イランにおけるヒグマの分布状況を把握することができた。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
ゲノムDNA分析は現在準備中であり、核DNA(常染色体、Y染色体)の複数の遺伝子に着目した分子系統解析も盛り込む予定である。
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今後の研究の推進方策 |
研究はほぼ計画通りに進んでいるが、ゲノムDNA分析は現在準備中であり、核DNA(常染色体、Y染色体)の複数の遺伝子に着目した分子系統解析も盛り込む計画である。 また、現生の西欧州ヒグマのミトコンドリアDNA情報がデータベースで公開された際には、ユーラシア全体のヒグマを対象として単一塩基多型を検出できるAPLP法を開発し、詳細な分析を進める。
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