• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2016 年度 実績報告書

核内構造体を構築する長鎖Noncoding RNAの探索法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 15J01473
研究機関北海道大学

研究代表者

中條 岳志  北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 特別研究員(PD) (50788578)

研究期間 (年度) 2015-04-24 – 2018-03-31
キーワードArchitectural RNA / 核内RNA顆粒 / RNAの難溶性 / Prion-like domain / NEAT1 / FUS
研究実績の概要

NEAT1長鎖noncoding RNAが細胞から抽出されにくい性質(難溶性)の原因を解明するために、前年度に様々なタンパク質をヒト細胞株においてノックアウトした結果、NEAT1の難溶性に大きく寄与するタンパク質として、NEAT1結合タンパク質であるFUSを同定していた。本年度は、FUSのタンパク質間相互作用を担うPrion-like domainがNEAT1の難溶性を引き起こすことを明らかにした。この結果より、核内ボディを構築する駆動力であるRNA-タンパク質間相互作用とタンパク質-タンパク質間相互作用が、RNAの難溶性の原因でもあると考えられ、核内ボディを構築するArchitectural RNAを探索する上で難溶性RNAに着目することの有用性が強く示唆された。
新しいArchitectural RNAを同定することを目的として、HeLa細胞の難溶性RNAを次世代シーケンス解析により探索した結果、前年度には3種類の新規難溶性RNAとそれらRNAの核内顆粒様の局在を見出していた。本年度にシーケンス結果をより詳細に再解析した結果、さらに6種類の新規難溶性RNAを同定し、これら6種類の新規難溶性RNAも核内顆粒様の局在を示すことを明らかにした。また、新規難溶性RNAに関して、転写阻害時に難溶性が失われること、既知の核内顆粒と局在が重ならないこと、顆粒は転写部位のみならずその周辺にも存在すること、一部の新規難溶性RNAはNEAT1と同様にその難溶性がFUSに依存すること、スプライシングを受けないことと難溶性のつながりも見出している。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

特別研究員の研究課題で得られた成果をEMBO Journalに論文投稿し、2017年3月10日(ドイツ時間で3月9日)に受理された。また上記の研究内容に関して、国際学会(Keystone Symposia)で口頭発表を行い、国際RNA学会年会と第7回IGM研究交流会でのポスター発表に対してそれぞれPoster Awardと最優秀ポスター発表賞を受賞した。さらに、共同研究の成果がJ Cell Biol及びPLoS Biolに掲載された。

今後の研究の推進方策

これまでに本研究課題で確立した、RNAの難溶性に着目する手法を用いて、様々なストレス条件下の細胞、疾患細胞、分化細胞におけるArchitectural RNAの探索を計画している。また、難溶性とは異なる角度からも、Architectural RNAを探索する方法を立ち上げることを計画している。

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2017 2016

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 2件、 査読あり 3件、 謝辞記載あり 1件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 2件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Unusual semi-extractabitliy as a hallmark of nuclear body-associated architectural RNAs2017

    • 著者名/発表者名
      Chujo T, Yamazaki T, Kawaguchi T, Kurosaka S, Takumi T, Nakagawa S, Hirose T.
    • 雑誌名

      The EMBO Journal

      巻: - ページ: 印刷中

    • DOI

      10.15252/embj.201695848

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Structural, super-resolution microscopy analysis of paraspeckle nuclear body organization2016

    • 著者名/発表者名
      West JA, Mito M, Kurosaka S, Takumi T, Tanegashima C, Chujo T, Yanaka K, Kingston RE, Hirose T, Bond C, Fox A, Nakagawa S.
    • 雑誌名

      Journal of Cell Biology

      巻: 214 ページ: 817-830

    • DOI

      10.1083/jcb.201601071

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Mitochondrial 16S rRNA Is Methylated by tRNA Methyltransferase TRMT61B in All Vertebrates2016

    • 著者名/発表者名
      Bar-Yaacov D, Frumkin I, Yashiro Y, Chujo T, Ishigami Y, Chemla Y, Blumberg A, Schlesinger O, Bieri P, Greber B, Ban N, Zarivach R, Alfonta L, Pilpel Y, Suzuki T, Mishmar D.
    • 雑誌名

      PLoS Biology

      巻: - ページ: e1002557

    • DOI

      10.1371/journal.pbio.1002557

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Remarkable semi-extractability as the hallmark of nuclear body-associated architectural long ncRNAs2017

    • 著者名/発表者名
      Chujo T, Yamazaki T, Kawaguchi T, Kurosaka S, Takumi T, Nakagawa S, Hirose T.
    • 学会等名
      Keystone Symposia Protein-RNA Interactions: Scale, Mechanisms, Structure and Function of Coding and Noncoding RNPs
    • 発表場所
      Banff Springs Hotel (Banff, Canada)
    • 年月日
      2017-02-07
    • 国際学会
  • [学会発表] 核内構造体形成のアーキテクチュラルlncRNAの共通特性としての難溶性2016

    • 著者名/発表者名
      中條岳志、山崎智弘、川口哲哉、黒坂哲、内匠透、中川真一、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-11-30
  • [学会発表] 核内構造体形成のアーキテクチュラル長鎖ncRNAの共通特性としての難溶性2016

    • 著者名/発表者名
      中條岳志、山崎智弘、川口哲哉、黒坂哲、内匠透、中川真一、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      第7回IGM研究交流会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道札幌市)
    • 年月日
      2016-10-18
  • [学会発表] Remarkable semi-extractability as a hallmark of architectural long noncoding RNAs associated with nuclear bodies2016

    • 著者名/発表者名
      中條岳志、山崎智弘、川口哲哉、黒坂哲、内匠透、中川真一、廣瀬哲郎
    • 学会等名
      RNAフロンティアミーティング2016
    • 発表場所
      ニセコいこいの湯宿いろは(北海道ニセコ町)
    • 年月日
      2016-08-31
  • [学会発表] An improved cellular RNA extraction method for quantification of NEAT1 architectural long noncoding RNA and an exploratory search for novel nuclear architectural RNAs2016

    • 著者名/発表者名
      Chujo T, Yamazaki T, Kawaguchi T, Kurosaka S, Takumi T, Nakagawa S, Hirose T.
    • 学会等名
      RNA Society meeting 2016
    • 発表場所
      京都国際会館(京都府京都市)
    • 年月日
      2016-06-30
    • 国際学会
  • [図書] 核内ボディの骨格として働く構造構築RNA (arcRNA)2016

    • 著者名/発表者名
      中條岳志、廣瀬哲郎
    • 総ページ数
      12
    • 出版者
      化学同人

URL: 

公開日: 2018-01-16  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi