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2015 年度 実績報告書

一本鎖RNAを認識する自然免疫受容体TLRの構造生物学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 15J12485
研究機関東京大学

研究代表者

丹治 裕美  東京大学, 薬学系研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2015-04-24 – 2018-03-31
キーワードTLR8 / 一本鎖RNA / 自然免疫 / X線結晶構造解析 / ウィルス感染 / Toll様受容体
研究実績の概要

自然免疫に関わるToll様受容体(TLR)の中で、TLR7とTLR8は一本鎖RNA (ssRNA)を認識しており、様々なウィルス感染症や自己免疫疾患に関与している。本年度は、TLR8/ssRNA複合体のX線結晶構造解析に成功し、TLR8のssRNA認識機構を解明した (Tanji et al., Nat. Struct. Mol. Biol., 2015) 。
TLR8/ssRNA複合体の構造解析を行った結果、TLR8は活性化型の2量体を形成しており、2量体界面に存在する合成低分子リガンド結合部位 (1st site) にウリジンが、リング型構造の内側に存在する結合部位 (2nd site) にUGの配列を有するジヌクレオチドが、それぞれ結合していることが明らかになった。先行研究より、1st siteにリガンドが結合するとTLR8の活性化型2量体への構造変化を引き起こすことが示されており、TLR8のssRNA認識における真のリガンドはウリジンだと考えた。実際に、TLR8/ウリジン複合体の結晶構造解析の結果、TLR8は活性化型2量体を形成していることが明らかになった。さらに、等温滴定カロリメトリー法を用いて、グアノシン、アデノシン、シチジン、ウリジン、チミジンの各モノヌクレオシドの中でウリジンが最も強くTLR8に結合することを示した。また、ssRNAの存在下では、TLR8に対するウリジンの結合が増強することを明らかにした。これまではRNAがTLR8を活性化すると考えられていたが、本研究結果によって、実際はRNAの分解産物であるウリジンとssRNAを同時に認識して活性化されるという新規機構が解明された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

現在までに、TLR8とssRNAの結晶構造解析に成功しており、論文として発表した。さらに、TLR8と種々のリガンドとの複合体構造解析に成功しており、共著者として論文を発表している。

今後の研究の推進方策

TLR8には、活性化に関わっているとされる挿入ループが存在する。今後は、この挿入ループによる活性化制御について構造生物学的な知見を得ることを目指し、挿入ループ部位の変異体を作成してX線結晶構造解析および性状解析を行う。

  • 研究成果

    (8件)

すべて 2015 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 2件、 査読あり 4件、 謝辞記載あり 4件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] University of Kansas(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      University of Kansas
  • [雑誌論文] Toll-like receptor 8 senses degradation products of single-stranded RNA.2015

    • 著者名/発表者名
      Tanji, H., Ohto, U., Motoi, Y., Shibata, T., Miyake, K., Shimizu, T.
    • 雑誌名

      Nat. Struct. Mol. Biol.

      巻: 22 ページ: 109~115

    • DOI

      10.1038/nsmb.2943

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Structural basis of CpG and inhibitory DNA recognition by Toll-like receptor 9.2015

    • 著者名/発表者名
      Ohto, U., Shibata, T., Tanji, H., Ishida, H., Krayukhina, E., Uchiyama, S., Miyake, K., Shimizu, T.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 520 ページ: 702~705

    • DOI

      0.1038/nature14138

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The Imidazoquinoline Toll-Like Receptor-7/8 Agonist Hybrid-2 Potently Induces Cytokine Production by Human Newborn and Adult Leukocytes.2015

    • 著者名/発表者名
      Ganapathi, L., Van Haren, S., Dowling, D.J., Bergelson, I., Shukla, N.M., Malladi, S.S., Balakrishna, R., Tanji, H., Ohto, U., Shimizu, T., David, S.A., Levy, O.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 10 ページ: e0134640

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0134640

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Structure-Based Design of Human TLR8-Specific Agonists with Augmented Potency and Adjuvanticity.2015

    • 著者名/発表者名
      Beesu, M., Caruso, G., Salyer, A. C., Sil, D., Weerasinghe, M., Tanji, H., Ohto, U., Shimizu, T., David S. A.
    • 雑誌名

      J. Med. Chem.

      巻: 58 ページ: 7833~7849

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.5b01087

    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Structural studies of single-stranded RNA receptor TLR82015

    • 著者名/発表者名
      Hiromi Tanji, Umeharu Ohto, Takuma Shibaga, Kensuke Miyake, Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      Toll 2015 Meeting
    • 発表場所
      Marbella (Spain)
    • 年月日
      2015-09-30 – 2015-10-03
    • 国際学会
  • [学会発表] 自然免疫系一本鎖RNA受容体TLR8の構造基盤2015

    • 著者名/発表者名
      丹治裕美、大戸梅治、柴田琢磨、田岡万悟、山内芳雄、礒邉俊明、三宅健介、清水敏之
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24 – 2015-06-26
  • [図書] 臨床免疫:アレルギー科2015

    • 著者名/発表者名
      丹治裕美、大戸梅治、清水敏之
    • 総ページ数
      312 (294-298)
    • 出版者
      科学評論社

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公開日: 2016-12-27   更新日: 2022-02-02  

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