• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2017 年度 実施状況報告書

弱結合条件下の荷電タンパク質間実効相互作用と相挙動における溶媒分子の役割

研究課題

研究課題/領域番号 15K05249
研究機関九州大学

研究代表者

秋山 良  九州大学, 理学研究院, 准教授 (60363347)

研究分担者 吉森 明  新潟大学, 自然科学系, 教授 (90260588)
徳永 健  工学院大学, 教育推進機構(公私立大学の部局等), 准教授 (30467873)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2019-03-31
キーワード電解質溶液 / 荷電巨大分子 / 実効相互作用 / 分子シミュレーション / 電気二重層斥力 / 液体の積分方程式理論 / 相挙動 / クーロン系
研究実績の概要

クーロン相互作用が熱エネルギーより充分大きな領域以外での電解質溶液中の荷電巨大分子間の実効相互作用およびその相挙動の理解を目指して研究を開始した。まず、液体の積分方程式理論を用いて同符号荷電巨大分子間の実効相互作用を計算した。モデルは荷電剛体球モデルを用いた。
その結果、いわゆるDLVO理論とは異なった共イオン価数依存性がみられた。通常のDLVO理論では、イオン強度が同じであれば、共イオン価数を変えても同符号荷電巨大分子間の静電遮蔽の強さには変化がない。これは電気二重層斥力が線形化されたポアソンボルツマン方程式の解から求められているからである。しかし、少し電荷が大きくなり、また電解質濃度が高くなると線形近似では不十分になる。例えば、価数が大きくなることでその条件は不十分になる。その結果、実効相互作用の形状はよく知られた電気二重層斥力の形に似ているが、その遮蔽の強さは変化する。一方で、カウンター電荷のイオンの濃度を一致させると、実効相互作用は同符号荷電巨大分子間の実効相互作用はほとんど一致してしまう濃度および荷電領域が存在した。この場合、イオン強度は当然変化している。それにもかかわらず、同符号荷電巨大分子間の実効相互作用は互いに一致するのである。この結果は、その濃度および荷電領域では、共イオンが荷電巨大分子間から排斥されてしまい、静電遮蔽は主に対イオンによって行われているからであると予想できる。このアイディアは、電解質溶液中の膜間距離に関する実験結果の解釈と似ている。
それらの実効相互作用を用いて電気二重層斥力で反発し合う巨大分子の作る”液体”構造を分子シミュレーションを用いて計算中でありいくつかのケースについては結果が得られつつある。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

共イオンの価数依存性の効果などの解釈は予想を超えて進んだ。また、シミュレーションとの組み合わせも進みつつある。一方で、相図の計算の進捗状況が思わしくない。しかし、良い方針が最近掴めたので、今後相図の計算および結果の論文化を進める予定である。

今後の研究の推進方策

巨大分子が有限濃度の場合の実効相互作用の扱い方の再検討を行ったところ実効的な直接相互作用を少し修正する方法でとり入れることができそうである。また、モデルの再検討により相図の計算をまとまる形で計算する算段がつきつつある。この研究を進めることで、相図により平衡クラスターの存在について検討する当初のもう一つの目的について達成することができそうである。それらの研究を進めたい。
また、モデルの再検討で分子シミュレーションを用いた相図に関する検討も進めることができそうなので行いたい。
また、また論文化していない成果があるので、まずはそれを今後進めてゆく予定である。

次年度使用額が生じた理由

研究成果はまとまりつつあるが、平成29年度に巨大分子の拡散や相図に関する議論が発展し、研究分担者との共著論文および学会発表のために次年度使用が生じた。

  • 研究成果

    (18件)

すべて 2018 2017

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Theoretical approaches for dynamical ordering of biomolecular systems2018

    • 著者名/発表者名
      Okumura Hisashi、Higashi Masahiro、Yoshida Yuichiro、Sato Hirofumi、Akiyama Ryo
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta(BBA) - General Subjects

      巻: 1862 ページ: 212~228

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1016/j.bbagen.2017.10.001

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Basic Cell Size Dependence of Displacement for a Solvation Motor in a Lennard-Jones Solvent2018

    • 著者名/発表者名
      Tokunaga Ken, Akiyama Ryo
    • 雑誌名

      J. Comput. Chem. Jpn

      巻: 17 ページ: 80-84

    • DOI

      DOI: 10.2477/jccj.2018-0004

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Stick boundary condition at large hard sphere arising from effective attraction in binary hard-sphere mixtures2018

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Yuka, Yoshimori Akira, Akiyama Ryo, Yamaguchi Tsuyoshi
    • 雑誌名

      THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS

      巻: 148 ページ: 124502-1-12

    • DOI

      https://doi.org/10.1063/1.5025202

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Electrostatic double-layer interaction between stacked charged bilayers2017

    • 著者名/発表者名
      Hishida Mafumi, Nomura Yoko, Akiyama Ryo, Yamamura Yasuhisa, Saito Kazuya
    • 雑誌名

      PHYSICAL REVIEW E

      巻: 96 ページ: 040601(R)-1-5

    • DOI

      10.1103/PhysRevE.96.040601

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isotactic poly(4-methyl-1-pentene) melt as a porous liquid: Reduction of compressibility due to penetration of pressure medium2017

    • 著者名/発表者名
      Chiba Ayano、Inui Masanori、Kajihara Yukio、Fuchizaki Kazuhiro、Akiyama Ryo
    • 雑誌名

      THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS

      巻: 146 ページ: 194503-1-5

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1063/1.4983508

    • 査読あり
  • [学会発表] 多価カチオンを含む電解質中におけるタンパク質表面の負に帯電した酸素間の実行相互作用2018

    • 著者名/発表者名
      末松安由美、菱田真史、秋山良
    • 学会等名
      日本物理学会第73回年次大会
  • [学会発表] 溶媒の密度分布で決まる粒子表面の境界条件2018

    • 著者名/発表者名
      中村有花, 吉森明, 秋山良, 山口毅
    • 学会等名
      日本物理学会第73回年次大会
  • [学会発表] 荷電脂質膜が作る多重層ベシクルの表面電位2018

    • 著者名/発表者名
      菱田真史, 秋山良, 山村泰久, 齋藤一弥
    • 学会等名
      日本物理学会第73回年次大会
  • [学会発表] 荷電コロイド粒子の結晶化に影響する平均力ポテンシャルの斥力2018

    • 著者名/発表者名
      田村雄大, 末松安由美, 吉森明, 秋山良
    • 学会等名
      日本物理学会第73回年次大会
  • [学会発表] Effective attraction between negatively charged oxygen atoms on protein surface in an electrolyte solution2018

    • 著者名/発表者名
      Ryo Akiyama, Ayumi Suematsu
    • 学会等名
      新学術領域研究「動的秩序と機能」第6回国際シンポジウム
    • 国際学会
  • [学会発表] 2成分剛体球系での固体表面への分子吸着における活性化自由エネルギー及び吸着量のモル分率依存性2017

    • 著者名/発表者名
      大島 章生、秋山 良
    • 学会等名
      凝縮系の理論化学2017
  • [学会発表] 統計力学的手法による2成分剛体球系の相挙動の研究2017

    • 著者名/発表者名
      末松安由美、吉森輝、秋山良
    • 学会等名
      凝縮系の理論化学2017
    • 招待講演
  • [学会発表] Selectivity of large hard sphere on a hard wall immersed in binary hard-sphere fluid2017

    • 著者名/発表者名
      Akio Oshima, Ayano Chiba, Ryo Akiyama
    • 学会等名
      The 10th Liquid Matter Conference
    • 国際学会
  • [学会発表] Effective potential and crystallization by depletion effect in binary hard-sphere systems2017

    • 著者名/発表者名
      Ayumi Suematsu, Akira Yoshimori, Ryo Akiyama
    • 学会等名
      The 10th Liquid Matter Conference
    • 国際学会
  • [学会発表] Statistical Mechanics Study of Reentrant Phase Behavior of Proteins in an Electrolyte Solution2017

    • 著者名/発表者名
      Ryo Akiyama
    • 学会等名
      The 17th KIAS Conference on Protein Structure and Function
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Exclusion of coions from space between two macroions in an electrolyte solution: the charge dependence2017

    • 著者名/発表者名
      A. Suematsu, R. Akiyama and M. Hishida
    • 学会等名
      11th Mini Symposium on liquids
  • [学会発表] System Size Dependence of the Motion of Solvation Motor2017

    • 著者名/発表者名
      Ken Tokunaga, Ryo Akiyama
    • 学会等名
      11th Mini Symposium on liquids
  • [学会発表] Short and long range effects of an effective ectiveg range effects of an effective force on crystallization of like-charged colloidal particles2017

    • 著者名/発表者名
      Y. Tamura, A. Suematsu, A. Yoshimori, R. Akiyama
    • 学会等名
      11th Mini Symposium on liquids

URL: 

公開日: 2018-12-17  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi