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2017 年度 実績報告書

低発現量タンパク質の探索を可能とするフォトアフィニティーセレクション法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 15K05559
研究機関東京農工大学

研究代表者

櫻井 香里  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (50447512)

研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
キーワードフォトアフィニティープローブ / 生物活性分子 / 標的タンパク質 / 光反応基 / 金ナノ粒子
研究実績の概要

有望な生物活性を示す天然物や医薬品候補化合物において、結合タンパク質の合理的な同定法の開発は、新規薬剤の開発や生物機構の解明に向けて重要な未解決課題である。従来の親和性に基づいた結合タンパク質探索法は、成功確率がリガンドや未知の結合タンパク質の性質に依存するため、ルーチンワークの技術として確立していない。本研究では、金ナノ粒子基盤の特性を利用し、結合タンパク質をワンポットでラベル化反応と濃縮精製を行うキャッチ・リリース型タンパク質探索法の確立を目指した。本研究期間を通して、糖鎖リガンドや、非天然型及び天然生物活性化合物をリガンドとし、種々の光反応基を提示した金ナノ粒子フォトアフィニティープローブの作成方法とタンパク質ラベル化および濃縮精製・同定方法を確立した。金ナノ粒子上ではリガンドや光反応基を高密度で提示することが可能であることから、プローブ自体はnM程度の低濃度で用いることで、望みのタンパク質の選択的なラベル化と濃縮精製を実現した。われわれは先行研究において、低親和性タンパク質や低発現量タンパク質に対してフォトアフィニティーラベリングを行う場合は、反応効率は低いが高い選択性を示すジアジリン基が有用であることを明らかにした。本研究において、低濃度のプローブを用いる反応条件を達成できたことから、反応効率が高く選択性が低い光反応基の方がより有効であることが示唆された。また一方で、光反応基によるラベル化は、通常ラベル化の収率が<10%程度の分子プローブと比して、部分的に効率化できた(<70%)ものの、原理的にさらなる収率の向上は困難であることが示唆された。そこで、最終年度では、タンパク質ラベル化剤を光反応基に限定せず、求電子性官能基を導入する金ナノ粒子プローブの開発を検討した。これまでに合成した金ナノ粒子プローブを用い、nM程度の濃度のプローブでタンパク質ラベル化に成功した。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件) (うち招待講演 3件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] カロリンスカ研究所(スウェーデン)

    • 国名
      スウェーデン
    • 外国機関名
      カロリンスカ研究所
  • [雑誌論文] Synthesis of alkyne-tagged and biotin-tagged Sortin1 as novel photoaffinity probes2018

    • 著者名/発表者名
      Komatsu, R. Yamaguchi, T. Kobayashi, N. Ozeki, Y. Sakurai, K.
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      巻: 28 ページ: 1562-1565

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2018.03.060.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis of a fluorescent photoaffinity probe of OSW-1 by site-selective acylation of an inactive congener and biological evaluation2017

    • 著者名/発表者名
      Sakurai, K., Hiraizumi, M., Isogai, N., Komatsu, R., Shibata, T., Ohta, Y.
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 53 ページ: 517-520

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2016.08.053.

    • 査読あり
  • [学会発表] 生物活性分子の作用機構解明に向けた標的タンパク質探索法2018

    • 著者名/発表者名
      櫻井香里
    • 学会等名
      Asian Chemical Probe Research Hub Symposium天然物有機化学・天然物合成とケミカルバイオロジー
    • 招待講演
  • [学会発表] 生物活性分子の作用機構解明に向けた標的タンパク質探索法2018

    • 著者名/発表者名
      櫻井香里
    • 学会等名
      日本化学会 第98春季年会 女性科学者が拓く生命化学 特別企画公演
    • 招待講演
  • [学会発表] 生物活性分子の作用機序解明に向けた標的タンパク質探索法の開発2017

    • 著者名/発表者名
      櫻井香里
    • 学会等名
      新規素材探索研究会第16回セミナー
    • 招待講演
  • [備考]

    • URL

      http://web.tuat.ac.jp/~sakurai/

URL: 

公開日: 2018-12-17  

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