| 研究課題/領域番号 |
15K06865
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| 研究機関 | 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 |
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研究代表者 |
白水 崇 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 プロテオームリサーチプロジェクト, 協力研究員 (00582678)
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| 研究分担者 |
足立 淳 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 プロテオームリサーチプロジェクト, 上席研究員 (20437255)
長山 聡 公益財団法人がん研究会, 有明病院 消化器外科, 医長 (70362499)
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| 研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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| キーワード | 大腸癌 / バイオマーカー / プロテオミクス |
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| 研究実績の概要 |
大腸癌治療では肝転移が予後を規定する主要な因子であり、肝転移を制御する上で転移を予測・診断できるバイオマーカーの開発が急務である。転移のメカニズムは複雑で、症例ごとの個人差も大きい。それ故、同一症例の原発巣と転移巣を用いたマーカー探索は極めて有望である。本研究では、癌原発巣と転移巣組織から抽出した膜タンパク質を用いた定量プロテオーム解析により行う。同定した候補分子は、血中エクソソームに対しバイオマーカーとして有効かどうかを評価する。これには多検体でのハイスループットな検証が可能なSRM法にて行う。
【平成27年度実績】臨床組織を用いた大規模定量プロテオーム解析によるマーカー候補の同定：大腸癌患者の原発巣および転移巣12組24検体の臨床組織より膜画分を調製し、PTS法によるタンパク質消化を行った。さらに、TMT10plexによる定量プロテオーム解析を行った結果、4967個のタンパク質を同定し、さらに原発巣と転移巣の間で発現量に変化があったタンパク質を182個同定した。
【平成28年度実績】マーカー候補タンパク質のSRM解析系の構築：同定タンパク質の中からSRM法に適するターゲットペプチドを選択し、検出条件の検討を行った。また、血中エクソソーム画分に対する解析により、マーカー候補の絞り込みを行った。
【平成29年度実績】血中エクソソーム画分を用いたマーカー候補の検証：多検体の患者血漿サンプルから回収したエクソソーム画分を用いたSRM法によるマーカー候補の検証を行った。健常者、転移なしおよび転移ありの患者由来血漿サンプルより、超遠心法によるエクソソーム画分の回収を行い、マーカー候補のSRM解析を行った。その結果、健常者/転移あり/転移なしのサンプルグループ間で発現量に差のある新規の大腸癌血中診断マーカー候補タンパク質を複数同定した。
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