研究課題/領域番号 |
15K06916
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
研究分野 |
ゲノム医科学
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研究機関 | 国立研究開発法人国立がん研究センター |
研究代表者 |
加藤 護 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 部門長 (40391916)
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研究分担者 |
筆宝 義隆 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 客員研究員 (30359632)
新井 康仁 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 主任研究員 (80222727)
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連携研究者 |
柴田 龍弘 国立がん研究センター, がんゲノミクス分野, 分野長 (90311414)
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研究期間 (年度) |
2015-04-01 – 2018-03-31
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キーワード | がんゲノム / 一細胞シークエンス / 腫瘍内多様性 |
研究成果の概要 |
腫瘍内不均質性のダイナミクスを解明すべく、大腸がんマウスモデル再構成系において、腫瘍培養細胞の皮下導入直前、導入1ヶ月後、3ヶ月後で細胞を採取し、C1 を用いて一細胞エキソームとトランスクリプトームをシークエンスした。結果、皮下導入前後でDNA の多様性は減少する一方、RNA の多様性は増大していた。さらに、RNA での多様性の増加は、新しいがん細胞分集団の発生と対応していた。その分集団には、細胞増殖や上皮-間葉転換、さらに幹細胞に関する遺伝子発現が異なるという特徴があり、そのダイナミクスが解明できた。しかもこれらの結果が、転移定着や他の臨床項目と関連していることも示唆された。
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自由記述の分野 |
バイオインフォマティクス
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